LA EFICACIA DE LOS ANTIBIOTICOS PARA TRATAR INFECCIONES BACTERIANAS ESTA EN RIESGO POR LA APARICION Y PROPAGACION DE RESISTENCIAS A LOS ANTIMICROBIANOS (RAM). LA RESISTENCIA ANTIBIOTICA ES UN PROCESO NATURAL POR EL CUAL LAS BACTER...
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Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2023-01-01
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Descripción del proyecto
LA EFICACIA DE LOS ANTIBIOTICOS PARA TRATAR INFECCIONES BACTERIANAS ESTA EN RIESGO POR LA APARICION Y PROPAGACION DE RESISTENCIAS A LOS ANTIMICROBIANOS (RAM). LA RESISTENCIA ANTIBIOTICA ES UN PROCESO NATURAL POR EL CUAL LAS BACTERIAS INFECCIOSAS SE ADAPTAN A SOBREVIVIR AL ATAQUE DE ANTIBIOTICOS, PERO ESTE PROCESO SE HA AMPLIFICADO POR USO INADECUADO Y EXCESIVO DE ESTOS FARMACOS. ESTA PROPUESTA SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE LA RESISTENCIA ANTIBIOTICA EN LOS PATOGENOS PRIORITARIOS ENTEROCOCCUS FAECIUM Y ENTEROCOCCUS FAECALIS. LOS ENTEROCOCOS SON UNA DE LAS PRINCIPALES CAUSAS DE INFECCIONES HOSPITALARIAS, PARTICULARMENTE EN PACIENTES CON PROBLEMAS DE SALUD SUBYACENTES. LAS CEPAS NOSOCOMIALES DE ESTAS BACTERIAS SUELEN SER RESISTENTES A MULTIPLES ANTIBIOTICOS, INCLUIDOS LA AMPICILINA Y LA VANCOMICINA, LO QUE LIMITA LAS OPCIONES DE TRATAMIENTO. LA SECUENCIACION GENOMICA PODRIA CONVERTIRSE EN UNA HERRAMIENTA ALTERNATIVA PARA EL DIAGNOSTICO DE RESISTENCIAS.EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTA PROPUESTA ES ESTABLECER UNA CONCORDANCIA COMPLETA ENTRE LA RESISTENCIA ANTIBIOTICA FENOTIPICA Y GENOTIPICA EN ENTEROCOCOS, APOYANDOSE EN RESULTADOS PRELIMINARES, CON EL OBJETIVO FINAL DE PERMITIR EL DIAGNOSTICO PRECISO DE RESISTENCIAS ANTIBIOTICAS A PARTIR DE GENOMAS DE ENTEROCOCOS. EN CONCRETO, ME PROPONGO IDENTIFICAR NUEVOS MECANISMOS DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS DE ULTIMA LINEA, DAPTOMICINA Y TIGECICLINA, EN E. FAECIUM, ASI COMO A ANTIBIOTICOS MAS ANTIGUOS COMO LA NITROFURANTOINA. PARA ELLO, EMPLEARE TECNICAS DE ASOCIACION DEL GENOMA COMPLETO USANDO COLECCIONES EXTENSAS DE CEPAS DE E. FAECIUM, CON SECUENCIAS GENOMICAS Y RESISTENCIAS FENOTIPICAS DISPONIBLES. CUANTIFICARE EL EFECTO DE MULTIPLES DETERMINANTES GENETICOS EN LOS NIVELES DE RESISTENCIA (ES DECIR, EN LA CONCENTRACION INHIBITORIAS MINIMA), ESPECIALMENTE PARA FENOTIPOS COMPLEJOS Y POLIGENICOS COMO ES LA RESISTENCIA A DAPTOMICINA. APLICARE METODOS FILOGENETICOS PARA CUANTIFICAR LA PREVALENCIA Y DILUCIDAR LOS MECANISMOS GENETICOS DE SILENCIAMIENTO DE GENES DE RESISTENCIA, UN FENOMENO PARTICULARMENTE COMUN EN CEPAS PORTADORAS DE GENES DE RESISTENCIA A TETRACICLINAS Y AMINOGLUCOSIDOS. EN SU CONJUNTO, ESTOS RESULTADOS MEJORARAN LA PRECISION EN LA DETECCION DE RESISTENCIAS A PARTIR DE GENOMAS DE E. FAECIUM. FINALMENTE, EVALUARE LA PRECISION DE RESISTENCIAS GENOTIPICAS A PARTIR DE GENOMAS DE E. FAECALIS E IMPLEMENTARE TALES PREDICCIONES EN PATHOGENWATCH, UNA PLATAFORMA WEB QUE YA INCLUYE LA DETECCION DE RESISTENCIAS A PARTIR DE GENOMAS DE MUCHOS OTROS PATOGENOS MICROBIANOS, PERO AUN NO PARA GENOMAS DE ENTEROCOCOS.EN RESUMEN, DADO EL USO CADA VEZ MAS RUTINARIO DE LA SECUENCIACION GENOMICA EN LABORATORIOS DE MICROBIOLOGIA CLINICA Y DE SALUD PUBLICA, LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION FACILITARIAN LA ADOPCION DE LA SECUENCIACION GENOMICA COMO UNA HERRAMIENTA PARA EL DIAGNOSTICO Y LA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA DE RESISTENCIAS ANTIBIOTICAS EN ENTEROCOCO. RESISTENCIA ANTIBIOTICA\VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA GENOMICA\DIAGNOSTICO\MECANISMOS GENETICOS DE RESISTENCIA A AN\SECUENCIACION GENOMICA\ENTEROCOCOS\ENTEROCOCCUS FAECALIS\ENTEROCOCCUS FAECIUM