Descripción del proyecto
EL DESARROLLO DE TEORIAS CUANTITATIVAS DE LA EVOLUCION SE ENFRENTA AL RETO DE SINTETIZAR PRINCIPIOS GENERALES A PARTIR DE UN GRAN NUMERO DE OBSERVACIONES PARCIALES, LA COMPLEJIDAD BIOLOGICA RESULTA DE UNA HISTORIA LARGA E INTRINCADA DE PROCESOS COLECTIVOS, DESDE LAS MOLECULAS HASTA LA BIOSFERA, QUE SE DESARROLLAN A MUCHAS ESCALAS DISTINTAS DE TIEMPO Y ESPACIO, LA DINAMICA ADAPTATIVA DE UNA POBLACION IMPLICA MUCHOS NIVELES DISTINTOS DE DESCRIPCION Y SELECCION, INCLUYENDO MECANISMOS QUE CAUSAN VARIABILIDAD GENOMICA, LOS EFECTOS DE LAS MUTACIONES EN EL FENOTIPO, LAS INTERACCIONES ENTRE INDIVIDUOS, LA COMPETICION INTER-GRUPOS O LAS RESTRICCIONES IMPUESTAS POR AMBIENTES QUE VARIAN EN EL TIEMPO, COMO RESULTADO, LAS APROXIMACIONES TEORICAS SOLO HAN ALCANZADO UN EXITO PARCIAL HASTA EL MOMENTO, EN PARTE, ESTO SE DEBE A UNA LIMITADA COMPRENSION DE LA RELACION ENTRE ASPECTOS MOLECULARES Y LOS CAMBIOS FENOTIPICOS CAUSADOS POR LAS MUTACIONES, ELLO A PESAR DE LOS ESFUERZOS DEDICADOS A COMPRENDER LOS ORIGENES DE LA ADAPTACION Y DEL FACIL ACCESO A NUEVAS TECNICAS QUE PERMITEN UNA EXPLORACION EXHAUSTIVA DE LA DIVERSIDAD GENOTIPICA, CUALQUIER APROXIMACION TEORICA A LA EVOLUCION REQUIRE UN CONOCIMIENTO SUFICIENTE DE LA EVIDENCIA EMPIRICA A FIN DE DISEÑAR MODELOS REALISTAS Y FALSABLES, ACTUALMENTE, LOS VIRUS REPRESENTAN EL MEJOR SISTEMA EXPERIMENTAL PARA (I) ESTUDIAR LA EVOLUCION EN TIEMPO REAL, (II) EXPLORAR ESTRATEGIAS ADAPTATIVAS ALTERNATIVAS GRACIAS AL GRAN NUMERO DE MECANISMOS MOLECULARES QUE ESTOS ORGANISMOS DESPLIEGAN, (III) UNIR EL NIVEL MOLECULAR AL POBLACIONAL Y (IV) DISEÑAR MODELOS EVOLUTIVOS CON CAPACIDAD PREDICTIVA, ATENDIENDO A NUESTRA EXPERIENCIA PREVIA, CREEMOS QUE ES POSIBLE DEFINIR "CLASES DE UNIVERSALIDAD" QUE CARACTERICEN, EN PARTICULAR, TRANSICIONES ADAPTATIVAS Y A LA EXTINCION EN POBLACIONES VIRALES,EN ESTE PROYECTO EXPLORAREMOS LA RELACION ENTRE MECANISMOS MOLECULARES QUE CAUSAN VARIABILIDAD INDIVIDUAL Y LAS ESTRATEGIAS ADAPTATIVAS QUE ESTOS PERMITEN A NIVEL POBLACIONAL, ESTA RELACION GENOTIPO-FENOTIPO SE INVESTIGARA A TRAVES DEL USO COORDINADO DE TEORIA Y EXPERIMENTO, HEMOS IDENTIFICADO UNA SERIE DE VIRUS REPRESENTATIVOS QUE INFECTAN PLANTAS Y ANIMALES (INCLUYENDO HUMANOS) Y VARIOS GRUPOS EXPERTOS EN CADA TIPO VIRAL CON QUIENES HEMOS MANTENIDO COLABORACIONES O, MOTIVADOS POR LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO, COMENZADO OTRAS NUEVAS, PARTE DEL EQUIPO DE INVESTIGACION ES EXPERTO EN LA EVOLUCION DE VIRUS QUE INFECTAN BACTERIAS, DE MODO QUE PROPONEMOS NUEVOS EXPERIMENTOS QUE PERMITIRAN UNA MEJOR COMPRENSION DE LOS PAISAJES DE FITNESS Y DE LA DINAMICA POBLACIONAL, CON LA INFORMACION ANTERIOR DESARROLLAREMOS UNA BASE DE DATOS COMPLETA PARA USO PUBLICO QUE RELACIONE MECANISMOS MUTACIONALES Y LA RESPUESTA DE LAS POBLACIONES A DISTINTOS AMBIENTES, LA PARTE TEORICA DEL PROYECTO ESTA DIRIGIDA AL DESARROLLO DE UN ALGORITMO GENERICO PARA INFERIR LA ESTRUCTURA DE LOS PAISAJES DE FITNESS A PARTIR DE DATOS DE DEEP SEQUENCING, Y AL DESARROLLO DE MODELOS (I) DEDICADOS A VIRUS ESPECIFICOS, A FIN DE PREDECIR LAS RESPUESTAS POBLACIONALES Y COMPLEMENTAR CONOCIMIENTOS PREVIOS Y (II) DE APLICABILIDAD GENERAL, CAPACES DE ESTABLECER UNA CORRESPONDENCIA ENTRE MECANISMOS MOLECULARES Y LAS RESPUESTAS ADAPTATIVAS DE LAS POBLACIONES, FINALMENTE, ESPERAMOS QUE ESTOS ESFUERZOS CONTRIBUYAN A DESARROLLAR UNA TEORIA EVOLUTIVA ACTUALIZADA QUE INCLUYA LA COMPLEJA ESTRUCTURA DEL ESPACIO DE GENOMAS Y LAS CORRESPONDIENTES ESTRATEGIAS ADAPTATIVAS DE POBLACIONES NATURALES, TEORÍA EVOLUTIVA\MODELIZACIÓN\DINÁMICA DE POBLACIONES\VIRUS\ESTRATEGIAS ADAPTATIVAS\PAISAJE DE FITNESS\EFECTOS DE LAS MUTACIONES