Descripción del proyecto
LAS PLANTAS TIENEN UNA NOTABLE CAPACIDAD REGENERATIVA, LO QUE LES PERMITE RECUPERARSE RAPIDAMENTE DE CUALQUIER DAÑO TISULAR CAUSADO POR FACTORES BIOTICOS Y ABIOTICOS. LAS RAICES ADVENTICIAS SE FORMAN DE NOVO A PARTIR DE TEJIDOS NO RADICULARES, COMO HOJAS Y TALLOS, BIEN SEA DE FORMA NATURAL O EN RESPUESTA A ESTRES.MEDIANTE UN ABORDAJE FISIOLOGICO, GENETICO Y MOLECULAR, ESTAMOS ESTUDIANDO LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS EN EL HIPOCOTILO DE TOMATE TRAS LA ESCISION DE SU SISTEMA RADICULAR. EN NUESTRO MODELO EXPERIMENTAL, EL TRANSPORTE POLAR DE AUXINAS DESDE EL APICE Y HACIA LA REGION BASAL, Y LA SINTESIS LOCAL DE HORMONAS EN LA REGION DE LA HERIDA, ESTABLECEN UN NUEVO GRADIENTE ENDOGENO DE AUXINAS Y CITOQUININAS QUE ACTIVA LA PROLIFERACION DE LAS CELULAS FUNDADORAS DE LAS RAICES ADVENTICIAS EN EL CAMBIUM VASCULAR.LAS MUTACIONES MORE ADVENTITIOUS ROOTS1 (MARS1) AFECTAN A UN GEN QUE CODIFICA UNA DESMETILASA DE HISTONAS ESPECIFICA DE LISINA, LSD1, QUE EN METAZOOS REGULA LA PROLIFERACION CELULAR, LA PLURIPOTENCIA DE CELULAS MADRE Y LA EMBRIOGENESIS. LOS RESULTADOS DE NUESTRO PROYECTO PREVIO (RTI2018-096505-B-I00) INDICAN UNA FUNCION CONSERVADA DE LSD1 EN LA REGULACION DE LA FIRMA EPIGENETICA DE DOMINIOS ESPECIFICOS DE LA CROMATINA QUE, A SU VEZ, DETERMINA LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION DE MUCHOS GENES NO RELACIONADOS FUNCIONALMENTE.CON LAS TAREAS PROPUESTAS EN ESTE PROYECTO, PRETENDEMOS CONTRIBUIR A ESCLARECER EL MECANISMO MOLECULAR DE LA REGULACION DE LA CROMATINA MEDIADA POR LSD1 EN DOMINIOS ESPECIFICOS, E INVESTIGAREMOS COMO LA PERDIDA DE FUNCION DE LSD1 SENSIBILIZA LAS RESPUESTAS A LA AUXINA EN ALGUNAS CELULAS DEL CAMBIUM DURANTE LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS. ESTOS SON LOS CINCO OBJETIVOS ESPECIFICOS QUE PERSEGUIMOS EN ESTE PROYECTO:1. OBTENER EL TRANSCRIPTOMA COMPLETO (GENES CODIFICANTES DE PROTEINAS Y ARN NO CODIFICANTES) DE CELULAS INDIVIDUALES OBTENIDAS DE LOS PRIMORDIOS DE RAICES ADVENTICIAS EN EL SILVESTRE Y EN LOS MUTANTES MARS1.2. CARACTERIZAR LAS FIRMAS EPIGENETICAS EN LOS DOMINIOS DE CROMATINA REGULADOS POR LSD1.3. CONFIRMAR LA RELEVANCIA FUNCIONAL DURANTE LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS DE UN DOMINIO DE CROMATINA REGULADO POR LSD1.4. IDENTIFICAR LAS PROTEINAS QUE INTERACCIONAN CON LSD1 MEDIANTE LA PURIFICACION POR AFINIDAD EN TANDEM (TAP) DE LOS COMPLEJOS DE LSD1-TAP.5. CONFIRMAR LA RELEVANCIA FUNCIONAL PARA LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS DE ALGUNOS DE ESTOS INTERACTORES MEDIANTE UNA APROXIMACION DE GENETICA INVERSA. PIGENETICA\PURIFICACION DE COMPLEJOS PROTEICOS\SECUENCIACION DE ARN DE CELULAS INDIVIDU\DESMETILASA DE HISTONAS\REPROGRAMACION CELULAR