Descripción del proyecto
LAS RAICES ADVENTICIAS SON ORGANOS POSTEMBRIONARIOS QUE SE FORMAN EN TEJIDOS NO RADICULARES, COMO HOJAS Y TALLOS, DE FORMA NATURAL O EN RESPUESTA A DETERMINADOS ESTRESES AMBIENTALES, LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS TRAS HERIDA ES UN PROCESO LIMITANTE PARA LA SUPERVIVENCIA DE LAS PLANTAS YA QUE RESTAURA SU CAPACIDAD DE ABSORCION DE AGUA Y NUTRIENTES, Y DESEMPEÑA UNA FUNCION CLAVE DURANTE LA PROPAGACION VEGETATIVA MEDIANTE ESQUEJES, A PARTIR DE RESULTADOS PREVIOS OBTENIDOS EN MI LABORATORIO, HEMOS ESTABLECIDO UN MODELO PARA LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS EN EL HIPOCOTILO DE TOMATE TRAS HERIDA DONDE EL TRANSPORTE POLAR DE AUXINAS DESDE LAS HOJAS JOVENES ACTIVA LA EXPRESION DE GENES ESPECIFICOS DE RESPUESTA QUE REGULAN LA PROLIFERACION DEL CAMBIUM VASCULAR Y LA ESPECIFICACION DE LOS NUEVOS PRIMORDIOS RADICULARES, EL FENOTIPO OBTENIDO TRAS LA PERDIDA DE FUNCION DE LOS GENES PLETHORA-LIKE (PLT) DE TOMATE CONFIRMA SU FUNCION EN LA ESPECIFICACION TEMPRANA DE LOS PRIMORDIOS DURANTE LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS, AUNQUE UN NIVEL ELEVADO DE ACTIVIDAD DE PLT PROMUEVE LA IDENTIDAD DE LAS CELULAS MADRE, LA EXPRESION ECTOPICA DE LOS GENES PLT NO ES SUFICIENTE PARA REPROGRAMAR CELULAS COMPLETAMENTE DIFERENCIADAS, DURANTE LA EMBRIOGENESIS, ADEMAS DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION SE REQUIERE LA ACTIVIDAD DE ALGUNOS FACTORES DE REMODELACION DE LA CROMATINA, QUE TAMBIEN CONTRIBUYEN A LA REPROGRAMACION TRANSCRIPCIONAL DE LAS CELULAS MADRE, PARA IDENTIFICAR NUEVOS REGULADORES DE LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS TRAS HERIDA, ESTAMOS UTILIZANDO EL SISTEMA DE FENOTIPADO RADICULAR QUE HEMOS DESARROLLADO RECIENTEMENTE EN NUESTRO LABORATORIO, UNO DE LOS MUTANTES MAS INTERESANTES IDENTIFICADOS HASTA AHORA SON LOS LLAMADOS MORE ADVENTITIOUS ROOTS1, QUE ESTAN AFECTADOS EN LA ACTIVIDAD DE UNA DESMETILASA DE HISTONAS MUY CONSERVADA, LSD1, QUE EN ANIMALES REGULA PROCESOS TAN DIVERSOS COMO LA PROLIFERACION CELULAR, LA PLURIPOTENCIA DE LAS CELULAS MADRE Y LA EMBRIOGENESIS, EN ESTE PROYECTO INICIAREMOS EL ESTUDIO DE LA REGULACION EPIGENETICA DE LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS EN EL HIPOCOTILO TRAS HERIDA A TRAVES DE LA CARACTERIZACION DE LA VIA MOLECULAR EN LA QUE PARTICIPA LSD1, MEDIANTE LA COMBINACION DE ABORDAJES GENETICOS Y BIOQUIMICOS IDENTIFICAREMOS LOS GENES DIANA REGULADOS POR LSD1 Y COMO INTERACCIONAN ESTOS CON LA SEÑAL DE AUXINA EN LAS CELULAS DEL CAMBIUM VASCULAR DURANTE LA FORMACION DE RAICES ADVENTICIAS, ADEMAS, PLANEAMOS CONTINUAR CON NUESTRA ESTRATEGIA DE GENETICA DIRECTA PARA IDENTIFICAR ALGUNOS DE LOS REGULADORES NEGATIVOS ADICIONALES QUE PARTICIPAN EN ESTE PROCESO, NUESTRO OBJETIVO FINAL ES IDENTIFICAR LAS MUTACIONES CAUSALES PRESENTES EN ESTOS MUTANTES MEDIANTE EL USO DE UNA NUEVA ESTRATEGIA DE MAPEO POR SECUENCIACION, NUESTROS RESULTADOS CONTRIBUIRAN A LA COMPRENSION DE LA INTERCONEXION ENTRE EL CONTROL EPIGENETICO Y LA SEÑALIZACION DE LAS FITOHORMONAS (AUXINAS) DURANTE LA FORMACION DE ORGANOS DE NOVO UTILIZANDO EL TOMATE COMO SISTEMA MODELO, EPIGENÉTICA\REPROGRAMACIÓN CELULAR\CHIP-SEQ\MAPEO POR SECUENCIACIÓN\DESMETILASA DE HISTONAS\SILENCIAMIENTO GÉNICO INDUCIDO POR VIRUS