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RTI2018-094248-B-I00

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ENFRENTANDOSE A COMPLEJOS PARADIGMAS EN VIROLOGIA MARINA MEDIANTE APROXIMACIONES...

ENFRENTANDOSE A COMPLEJOS PARADIGMAS EN VIROLOGIA MARINA MEDIANTE APROXIMACIONES MULTI-OMICAS APLICADAS A NIVEL DE COMUNIDAD, POBLACION E INDIVIDUO LOS VIRUS TIENEN UN ENORME IMPACTO EN EL RECICLAJE DEL C EN LOS OCEANOS Y EN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS, ENTRE EL 20-50% DE LAS BACTERIAS SON INFECTADAS, Y SU LISIS, LIBERA GIGATONES DE C AL AÑO, EN EL PASADO PROYECTO RETOS REF, C... ver más

01/01/2018

175K€

Presupuesto del proyecto: 175K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE ALICANTE No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1052

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE ALICANTE No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1052

Presupuesto del proyecto 175K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LOS VIRUS TIENEN UN ENORME IMPACTO EN EL RECICLAJE DEL C EN LOS OCEANOS Y EN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS, ENTRE EL 20-50% DE LAS BACTERIAS SON INFECTADAS, Y SU LISIS, LIBERA GIGATONES DE C AL AÑO, EN EL PASADO PROYECTO RETOS REF, CGL2013-40564-R, MEDIANTE EL DESARROLLO DE UNA NOVEDOSA APROXIMACION EXPERIMENTAL LLAMADA GENOMICA DE VIRUS INDIVIDUALES (GVI), DESVELAMOS EL VIRUS (DSDNA) MAS ABUNDANTE EN LOS OCEANOS, QUE BAUTIZAMOS COMO "37-F6", Y QUE HABIA PERMANECIDO "OCULTO" PARA LAS METODOLOGIAS EXISTENTES HASTA ESA FECHA, A PESAR DE LA IMPORTANCIA DE LOS VIRUS EN LA ESTRUCTURA DE LOS ECOSISTEMAS MARINOS, VARIOS PARADIGMAS CONTINUAN SIN RESOLVER EN VIROLOGIA MARINA QUE SERAN TRATADOS EN ESTE PROYECTO A DIFERENTES NIVELES, DESDE LA COMUNIDAD HASTA EL INDIVIDUO, EL PRIMER PARADIGMA QUE SE ENMARCA DENTRO DEL RETO 2 EN INVESTIGACIONES MARINAS (PUNTO 7) PRETENDE EVALUAR SI LOS ACTUALES MODELOS MARINOS, POR LAS LIMITACIONES EXISTENTES EN LAS TECNICAS, SIGUEN SIN INCORPORAR COMUNIDADES Y POBLACIONES VIRICAS QUE SON ABUNDANTES Y POR TANTO RELEVANTES EN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS, A NIVEL DE COMUNIDAD, AHONDAREMOS EN LA CONTRIBUCION DE LOS VIRUS DE RNA AL VIRIOPLANKTON MARINO, LA MAYORIA DE ESTUDIOS SE HAN CENTRADO EN LOS VIRUS DE DSDNA, LA ESCASEZ DE DATOS EN RELACION A LA ABUNDANCIA DE LOS VIRUS DE RNA LIMITA Y SESGA NUESTRA COMPRENSION DE LA ESTRUCTURA DEL VIRIOPLANCTON MARINO, ABORDAREMOS POR TANTO LA CUESTION DE LA ABUNDANCIA DE LOS VIRUS DE RNA DE UNA MANERA SISTEMATICA Y EXHAUSTIVA EMPLEANDO TECNICAS MULTIDISCIPLINARES QUE SERAN APLICADAS A MUESTRAS DE SUPERFICIE Y PROFUNDIDAD (4000 M) CON DIFERENTES CONDICIONES TROFICAS OBTENIDAS EN LA CAMPAÑA OCEANICA REPROCAN, POR OTRA PARTE, A NIVEL DE POBLACIONES DE VIRUS DE DSDNA, CLARIFICAREMOS SI, IGUAL QUE OCURRIO CON EL VIRUS 37-F6, TODAVIA EXISTEN OTRAS POBLACIONES DOMINANTES POR DESCUBRIR E INCLUIR EN NUESTROS MODELOS ECOLOGICOS DE LA ESTRUCTURA DEL VIRIOPLANCTON, ASI, SECUENCIAREMOS 800 GENOMAS DE VIRUS MARINOS ABUNDANTES NO CULTIVADOS MEDIANTE GVI COMBINADA CON SECUENCIACION POR METAGENOMICA MEDIANTE TECNOLOGIAS BASADAS EN SECUENCIAS CORTAS Y LARGAS, COMO NANOPOROS Y PACBIO, EL SEGUNDO Y TERCER PARADIGMA ESTAN INTERCONECTADOS Y SE CENTRARAN EN ABORDAR UNA PROBLEMATICA ALTAMENTE COMPLEJA EN VIROLOGIA, QUE ES MEDIR LA CONTRIBUCION EN LA TRANSFERENCIA DE C EN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS PARA DETERMINADAS POBLACIONES VIRICAS NO CULTIVADAS, EN LA PRACTICA, LOS VIROLOGOS MARINOS CARECEMOS PRACTICAMENTE DE METODOLOGIAS QUE NOS PERMITAN CONECTAR AMBOS TIPOS DE DATOS: IDENTIFICACION DE UN VIRUS NO CULTIVADO DETERMINADO CON MEDIDAS DIRECTAS DE SU CONTRIBUCION AL C Y OTROS NUTRIENTES, PRIMERO, TENIENDO COMO MODELO DE REFERENCIA DE ESTUDIO, EL VIRUS 37-F6, AHONDAREMOS EN LA ECOGENOMICA DE DICHA POBLACION MEDIANTE TECNICAS MULTIOMICAS BASADAS EN MICROFLUIDICA, PCR DIGITAL Y SECUENCIACION MASIVA, SEGUIDAMENTE, APLICANDO UNA APROXIMACION NOVEDOSA DENOMINADA BONCAT DONDE SE MARCA POR FLUORESCENCIA LAS PROTEINAS DE NUEVOS VIRUS PRODUCIDOS MEDIANTE UN ANALOGO DE LA METIONINA Y EN COMBINACION CON TECNICAS BASADA EN LA GENOMICA DE VIRUS INDIVIDUALES Y OTRAS OMICAS COMPLEMENTARIAS PODREMOS IDENTIFICAR Y MEDIR LA CONTRIBUCION ESPECIFICA DE LOS VIRUS EN LOS ECOSISTEMAS TANTO A NIVEL DE COMUNIDAD, POBLACION, COMO A NIVEL DE UNA CEPA VIRICA DETERMINADO, COMO EL 37-F6, FINALMENTE, DENTRO DEL RETO 5, ESTUDIAREMOS EL IMPACTO DEL CAMBIO CLIMATICO SOBRE POBLACIONES VIRICAS ECOLOGICAMENTE RELEVANTES A ESCALA GLOBAL VIRUS\ECOLOGIA\METAGENOMICA\COMUNIDADES\SECUENCIACION\GENÓMICA\MAR\OCEANO\MARINO

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