Descripción del proyecto
EL PROYECTO POPCOMICS PRETENDE ABORDAR RETOS ACTUALES DE LA INVESTIGACION EN BIOLOGIA MARINA CON HERRAMIENTAS GENOMICAS, DICHOS RETOS VAN DESDE EL ANALISIS DE POBLACIONES DE ESPECIES REPRESENTATIVAS DE LOS ECOSISTEMAS MEDITERRANEOS (INGENIERAS, VULNERABLES, COMERCIALES E INTRODUCIDAS) HASTA CAMBIOS EN LA BIODIVERSIDAD COMO RESPUESTA A IMPACTOS AMBIENTALES A DISTINTOS NIVELES DE COMPLEJIDAD (COMUNIDADES Y HOLOBIONTES), LOS TRES PRIMEROS DESCRIPTORES DE BUEN ESTADO AMBIENTAL DE LA DIRECTIVA MARCO DE LA ESTRATEGIA MARINA DE LA UE DE 2010 SON EL MANTENIMIENTO DE LA DIVERSIDAD BIOLOGICA, EL CONTROL DE LA INTRODUCCION DE ESPECIES FORANEAS Y EL ESTADO DE LAS POBLACIONES DE PECES COMERCIALES, LA INVESTIGACION EN ESOS TRES CAMPOS SE PUEDE BENEFICIAR NOTABLEMENTE DE HERRAMIENTAS GENOMICAS DERIVADAS DE TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION MASIVA,POPCOMICS SE ORIENTA A ESTOS TRES DESAFIOS Y SE BASA EN LA EXPERIENCIA PREVIA DE LOS EQUIPOS SOLICITANTES EN EL USO DE HERRAMIENTAS GENOMICAS: LA OBTENCION DE MARCADORES EN TODO EL GENOMA MEDIANTE GENOTIPADO POR SECUENCIACION (GBS), QUE PERMITE ANALIZAR LA DIVERSIDAD Y ESTRUCTURA GENETICA POBLACIONAL, Y LA SECUENCIACION MASIVA DE AMPLICONES DEL ADN PRESENTE EN LA COMUNIDAD, QUE PERMITE LA CARACTERIZACION DE LA BIODIVERSIDAD A DIVERSOS NIVELES (DESDE SIMBIOMAS HASTA COMUNIDADES),ESPECIFICAMENTE, NUESTRA INVESTIGACION SE ORIENTARA A LA APLICACION DE AMBAS TECNICAS A DOS OBJETIVOS: 1) ESTIMAR LA DIVERSIDAD, CONECTIVIDAD Y ADAPTACION EN POBLACIONES DE ESPECIES CLAVE PARA LOS RETOS DE LA SOCIEDAD USANDO MARCADORES GENOMICOS, 2) ESTUDIAR LOS CAMBIOS EN LA BIODIVERSIDAD COMO RESPUESTA A LOS IMPACTOS AMBIENTALES A NIVEL DE COMUNIDADES (METABARCODING) Y DEL HOLOBIONTE MEDIANTE SECUENCIACION DE AMPLICONES DE ADN,EL OBJETIVO 1 COMPRENDE 4 TAREAS QUE UTILIZARAN GBS, EN LA TAREA 1,1 SE ANALIZARA LA DIFERENCIACION POBLACIONAL Y LA ADAPTACION DE UNA ESPECIE TERMOFILA E INGENIERA EN LOS ECOSISTEMAS BENTONICOS, EN LA TAREA 1,2 SE REALIZARA UN ANALISIS POBLACIONAL Y EVALUACION DE STOCKS DE UNA ESPECIE AMENAZADA, REUNIENDO EL CONOCIMIENTO NECESARIO PARA SU MANEJO Y CONSERVACION, EN LA TAREA 1,3 SE ESTUDIARAN 3 PECES COMERCIALES CON DIFERENTES CAPACIDADES DE DISPERSION Y SE COMBINARA LA INFORMACION DE SU GENOTIPO Y FENOTIPO, EN FASES TEMPRANAS, DE INDIVIDUOS MUESTREADOS EN DIFERENTES POBLACIONES A LO LARGO DE GRADIENTES AMBIENTALES, EN LA TAREA 1,4 SE ESTUDIARAN POBLACIONES DE DOS ESPECIES INTRODUCIDAS COMBINANDO SU INFORMACION GENOMICA CON POBLACIONES NATIVAS, PARA EVALUAR LAS VIAS DE COLONIZACION Y LAS CAPACIDADES DE ADAPTACION DE LAS MISMAS,EL OBJETIVO 2 INCLUYE 3 TAREAS EN LAS QUE SE UTILIZARA SECUENCIACION MASIVA DE AMPLICONES DE ADN, EN LA TAREA 2,1 SE DESARROLLARA UN SISTEMA DE ALERTA TEMPRANA PARA DETECTAR ESPECIES INTRODUCIDAS USANDO COLECTORES EN PUERTOS E INSTALACIONES DE ACUICULTURA, EN LA TAREA 2,2 SE ANALIZARAN COMUNIDADES DE SUSTRATO DURO DEL MEDITERRANEO IBERICO, PARA GENERAR INVENTARIOS EXHAUSTIVOS (DESDE PROTISTAS HASTA MACROORGANISMOS) QUE SIRVAN COMO BASE DE REFERENCIA PARA BIOMONITORIZACION DE CAMBIOS, ES IMPERATIVO EMPEZAR A GENERAR BASES DE DATOS GENETICAS A LARGO PLAZO, Y ESTE PROYECTO ES EL PRIMER PASO EN ESTE SENTIDO, EN LA TAREA 2,3 SE ESTUDIARA LA CAPACIDAD DE ADAPTACION DE INVERTEBRADOS CLAVE (ESPONJAS Y UNA ASCIDIA INVASORA) MEDIADA POR SUS SIMBIONTES (PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS), CARACTERIZANDO CAMBIOS EN EL SIMBIOMA Y SU FUNCIONALIDAD EN RESPUESTA A GRADIENTES TERMICOS Y DE EUTROFIZACION, GENÓMICA\METABARCODING\GBS\HOLOBIONTE\ESPECIES INGENIERAS\ESPECIES INTRODUCIDAS\PECES COMERCIALES\ESPECIES VULNERABLES\COMUNIDADES LITORALES\EUTROFIZACIÓN