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CGL2017-83802-P

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DISECCIONANDO LA CONSERVACION Y FUNCION DE LA ORGANIZACION ESTRUCTURAL DEL GENOM...

DISECCIONANDO LA CONSERVACION Y FUNCION DE LA ORGANIZACION ESTRUCTURAL DEL GENOMA DE LOS MAMIFEROS EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTA PROPUESTA ES INVESTIGAR DE QUE FORMA LA ORGANIZACION TRIDIMENSIONAL DEL GENOMA HA EVOLUCIONADO CONJUNTAMENTE CON LOS ELEMENTOS ESTRUCTURALES QUE REGULAN SU FUNCION DURANTE LA DIVERSIFICACION DE LOS MA... ver más

01/01/2017

UAB

173K€

Presupuesto del proyecto: 173K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1264

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1264

Presupuesto del proyecto 173K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTA PROPUESTA ES INVESTIGAR DE QUE FORMA LA ORGANIZACION TRIDIMENSIONAL DEL GENOMA HA EVOLUCIONADO CONJUNTAMENTE CON LOS ELEMENTOS ESTRUCTURALES QUE REGULAN SU FUNCION DURANTE LA DIVERSIFICACION DE LOS MAMIFEROS, LOS RESULTADOS ESPERADOS DE ESTE PROYECTO NOS PROPORCIONARAN NUEVAS CLAVES INTERPRETATIVAS SOBRE LOS MECANISMOS RESPONSABLES DEL ORIGEN DE LA ARQUITECTURA Y LA PLASTICIDAD DEL GENOMA DE LAS ESPECIES, RESULTADOS PREVIOS DE NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION EN ROEDORES Y PRIMATES NOS HA PERMITIDO DELINEAR UN NUEVO MODELO INTEGRADOR QUE RELACIONA TANTO LAS INTERACCIONES FISICAS COMO LAS MARCAS EPIGENETICAS DE LA CROMATINA, ESTABLECIENDO UN NUEVO NEXO DE UNION ENTRE LA ESTRUCTURA Y FUNCION DEL GENOMA, ESTOS DATOS HAN REVELADO QUE EL ANALISIS DE LAS FUERZAS MECANISTICAS IMPLICADAS EN LA ORGANIZACION TRIDIMENSIONAL DE LA CROMATINA ES METODOLOGICAMENTE FACTIBLE Y FUNDAMENTAL PARA COMPRENDER LA PLASTICIDAD Y EVOLUCION DEL GENOMA DE LOS MAMIFEROS, ASI PUES, EN LA PRESENTE PROPUESTA ABORDAREMOS NUEVOS ASPECTOS FUNCIONALES Y ESTRUCTURALES DE LA ORGANIZACION DEL GENOMA TANTO EN LA LINEA SOMATICA COMO EN LA GERMINAL, ASI COMO EL ALCANCE DE LA CONSERVACION DE DICHA ORGANIZACION A LO LARGO DE LA FILOGENIA DE LOS MAMIFEROS, EXAMINAREMOS EL GRADO DE CONSERVACION DE LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEL GENOMA EN ESPECIES DE MAMIFEROS REPRESENTATIVOS Y DETERMINAREMOS COMO ESTA ORGANIZACION SE TRANSMITE DURANTE LA FORMACION DE LA LINEA GERMINAL, ESTO SE LLEVARA A CABO A TRAVES DE UN ENFOQUE MULTIDISCIPLINAR QUE COMBINARA LA VANGUARDIA DE METODOS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES BASADOS EN TECNOLOGIAS DE ALTO RENDIMIENTO, COMO EL HI-C Y LA CITOMETRIA DE FLUJO DE CELULAS GERMINALES, PARA ELLO NOS PROPONEMOS LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS, EN PRIMER LUGAR, (I) INVESTIGAREMOS LA CONSERVACION DE LA ORGANIZACION ESTRUCTURAL DEL GENOMA DE MAMIFEROS ANCESTRALES (AFROTHERIA Y MARSUPIALIA), LINAJES QUE DIVERGIERON HACE UNOS 80 MILLONES DE AÑOS A PARTIR DE UN ANCESTRO COMUN, EN SEGUNDO LUGAR (II) ANALIZAREMOS LAS CARACTERISTICAS FUNCIONALES DE LA INTERACCION DE LA CROMATINA EN CELULAS SOMATICAS Y GERMINALES DE MAMIFEROS, PARA ELLO SE ABORDARA HASTA QUE PUNTO SE REQUIEREN FACTORES ESPECIFICOS (COMO POR EJEMPLO CTCF Y COHESINAS) PARA ESTABLECER Y MANTENER LA ARQUITECTURA DE LA CROMATINA EN LA LINEA SOMATICA Y GERMINAL, POR ULTIMO, (III) DESARROLLAREMOS UNA NUEVA HERRAMIENTA BIOINFORMATICA PARA EL ANALISIS DE LA ORGANIZACION ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DE LOS GENOMAS, DENOMINADA EPHI-CLOUD, SE TRATARA DE UN NUEVO SISTEMA SAAS DE FACIL USO Y DE CODIGO ABIERTO PARA EL ANALISIS INTEGRADOR DE DATOS GENOMICOS DE GRAN ENVERGADURA,SE TRATA, POR LO TANTO, DE UNA PROPUESTA NOVEDOSA E INNOVADORA, QUE NOS PERMITIRAN APORTAR NUEVOS CONOCIMIENTOS SOBRE LA PLASTICIDAD ESTRUCTURAL DEL GENOMA DE LOS MAMIFEROS, SU CONSERVACION A LO LARGO DE LA FILOGENIA DE LAS ESPECIES Y, ASI COMO SU TRANSMISION DURANTE LA FORMACION DE LA LINEA GERMINAL, EVOLUCIÓN\MAMÍFEROS\REORGANIZACIONES CROMOSÓMICAS\CROMATINA\INTERACTOMA\LINEA GERMINAL\MEIOSIS\HI-C

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