Descripción del proyecto
SE INVESTIGARAN LOS FACTORES QUE AFECTAN A LA RELACION ENTRE REPLICACION DEL DNA DEPENDIENTE DE RECOMBINACION (RDR), ESTRES REPLICATIVO (RS) Y TRANSFERENCIA GENICA HORIZONTAL (HGT) POR TRANSFORMACION NATURAL Y TRANSDUCCION VIRAL EN FIRMICUTES, CARACTERIZAR PROTEINAS INVOLUCRADAS EN HGT PODRIA PERMITIRNOS IDENTIFICAR DIANAS PARA INHIBIR ESTE PROCESO, SE EVALUARA LA PARTICIPACION DE LAS MAQUINARIAS DE RECOMBINACION HOMOLOGA (HR) Y DE SEGREGACION EN LA DISEMINACION DE FACTORES DE VIRULENCIA Y/O TOLERANCIA (PERSISTENCIA) A ANTIBIOTICOS, ADICIONALMENTE, SE BUSCARAN COMPUESTOS QUE INHIBAN LA HELICASA REPLICATIVA BACTERIANA Y/O VIRAL, LA CARACTERIZACION MOLECULAR DE LAS MAQUINARIAS DE ESTABILIDAD GENOMICA SE REALIZARA UTILIZANDO BACILLUS SUBTILIS, EL VIRUS SPP1 Y EL PLASMIDO PSM19035 COMO MODELOS, LOS OBJETIVOS DEL PROYECTO SE DIVIDEN EN 7 BLOQUES DE TRABAJO (WPS): 1) ENTENDER COMO LOS CHECKPOINTS PARTICIPAN EN EL CONTROL DEL PROCESAMIENTO DE INTERMEDIARIOS DE RECOMBINACION (DNA DE CADENA SENCILLA Y INTERMEDIOS DE HOLLIDAY, HJ); 2) CARACTERIZAR LOS MEDIADORES Y MODULADORES DE LA RECOMBINASA RECA; 3) CARACTERIZAR EL PROCESAMIENTO DE INTERMEDIOS DE RECOMBINACION EN LAS ETAPAS PRE- (HORQUILLAS REGRESADAS) Y POST-SINAPTICA (HJS DOBLES) DE HR; 4) ESTUDIAR LAS BASES MOLECULARES DE LA HGT UTILIZANDO TRANSFORMACION NATURAL CROMOSOMICA Y PLASMIDICA; 5) CARACTERIZAR EL CAMBIO DEL MODO DE REPLICACION Y ESTUDIAR LAS BASES MOLECULARES DE LA HGT EN LA TRANSDUCCION PLASMIDICA Y CROMOSOMAL EN SPP1; 6) IDENTIFICAR NUEVAS DIANAS (ANTIVIRALES, ANTIMICROBIANOS) PARA INHIBIR LA HGT Y/O LA PROLIFERACION DE BACTERIAS Y VIRUSES; 7) DISECCIONAR LAS BASES MOLECULARES DE LA PERSISTENCIA A ANTIBIOTICOS UTILIZANDO LA TOXINA ZETA, Y LA ADQUISICION DE GENES DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS (ABR) POR EL CASSETTE OMEGA2 (COMO PARTE DE LA MAQUINARIA OMEGA2 Y DELTA2 O PARTICION PARAB), LOS RESULTADOS DE LOS WPS 1 A 3 NOS PERMITIRAN: I) ENTENDER LA RELACION ENTRE LOS CHECKPOINTS DE DAÑO AL DNA Y LA ACUMULACION DE C-DI-AMP, II) IDENTIFICAR LOS COMPONENTES Y RECONSTITUIR IN VITRO LAS ETAPAS PRE-, SINAPTICA Y POSTSINAPTICA DE LA HR Y ENTENDER COMO ESTOS COMPONENTES SON CONTROLADOS DURANTE EL RS, III) IDENTIFICAR HOTSPOTS DE RS Y SUS CUELLOS DE BOTELLA SUSCEPTIBLES DE INHIBICION, CON LOS WPS 4 Y 5 ESPERAMOS ENTENDER: I) LA RELACION ENTRE HR Y HGT EN LA DERIVA GENETICA DE ESPECIES BACTERIANAS, II) LOS FACTOR/ES DE HR QUE CONTROLA/N LA TRANSFORMACION NATURAL Y LA TRANSDUCCION MEDIADA POR FAGO, (III) LA GENERACION DE PARTICULAS TRANSDUCTORAS, IV) FACTOR/ES CODIFICADOS EN VIRUS U HOSPEDADOR QUE MODULAN LA TRANSDUCCION, V) RELACION ENTRE HR Y LA GENERACION DE PARTICULAS TRANSDUCTORAS, DEL WP 6 ESPERAMOS IDENTIFICAR COMPUESTOS ARTIFICIALES QUE PODRIAN CONTRIBUIR A INHIBIR DNA HELICASAS, DEL WP 7 ESPERAMOS COMPRENDER: I) LOS EFECTOS DE ZETA EN EL MECANISMO DE ACCION DE ANTIBIOTICOS Y EN LA PERSISTENCIA A MULTIPLES ANTIBIOTICOS, II) LA RELACION ENTRE LA SINTESIS DE URIDINA DIFOSFATO N-ACETILGLUCOSAMINA, (P)PPGPP, C-DI-AMP, Y LA ACTIVIDAD DE LA TOXINA ZETA, III) BUSCAR FACTORES QUE COMPROMETAN LA INTERACCION TOXINA-ANTITOXINA COMO DIANA PARA BUSCAR E IDENTIFICAR NUEVOS COMPUESTOS ADYUVANTES PARA TERAPIA ANTIBACTERIANA, Y IV) DESCIFRAR LOS MECANISMOS DE PARTICION PLASMIDICA, NUESTRO OBJETIVO FINAL ES APORTAR EVIDENCIAS PARA CONTROLAR HGT, REVERTIR LA ADQUISION Y DISEMINACION DE FACTORES DE VIRULENCIA, Y DESARROLLAR NUEVAS HERRAMIENTAS PARA ERRADICAR LA PERSISTENCIA ANTIBACTERIANA, ESTRÉS REPLICATIVO\CONTROLADORES\TRANSFERENCIA GÉNICA HORIZONTAL\RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS\TOLERANCIA A ANTIBIÓTICOS