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CTQ2015-74621-JIN

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DISEÑO DE BIOCIDAS INNOVADORES A PARTIR DE LA ELUCIDACION DEL MECANISMO DE OLIGO...

DISEÑO DE BIOCIDAS INNOVADORES A PARTIR DE LA ELUCIDACION DEL MECANISMO DE OLIGOMEROS CON PROPIEDADES ANTIMICROBIANAS EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS DESARROLLAR UNA ESTRATEGIA PARA EL DISEÑO RACIONAL DE OLIGOMEROS ANTIMICROBIANOS BASADO EN LA COMPRENSION DE SU MECANISMO DE ACCION A NIVEL DE LA MEMBRANA, DESDE UN ENFOQUE SINERGICO IN-SILICO/IN-VITRO,... ver más

01/01/2015

USC

204K€

Presupuesto del proyecto: 204K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 235

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 235

Presupuesto del proyecto 204K€

Descripción del proyecto EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS DESARROLLAR UNA ESTRATEGIA PARA EL DISEÑO RACIONAL DE OLIGOMEROS ANTIMICROBIANOS BASADO EN LA COMPRENSION DE SU MECANISMO DE ACCION A NIVEL DE LA MEMBRANA, DESDE UN ENFOQUE SINERGICO IN-SILICO/IN-VITRO, LA CLAVE PARA QUE ESTE ENFOQUE TENGA EXITO ES LA APLICACION DE METODOLOGIAS EMERGENTES: COARSE GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) Y MD ACELERADA CON GPUS AL NEXO QUE UNE AMBAS APROXIMACIONES, QUE PERMITIRA UNA EXPLORACION SIN PRECEDENTES DE LOS FENOMENOS A NIVEL DE MESO-ESCALA DE LAS MOLECULAS ANTIMICROBIANAS Y DE SU INTERACCION CON LAS MEMBRANAS,UTILIZANDO ESTE ENFOQUE SE ESTUDIARAN LOS MECANISMOS DE ACCION DE PEPTIDOS ANTIMICROBIANOS (AMPS) Y MOLECULAS AUTO-ENSAMBLADAS "INTELIGENTES" (CICLOPEPTIDOS, MOLECULAS ORGANICAS, CICLODEXTRINAS, POLIMEROS, CLUSTERES ATOMICOS-AQCS, ETC) CON EL OBJETIVO FINAL DE OBTENER INFORMACION QUE PUEDA SER USADA PARA EL DISEÑO DE NUEVOS AGENTES ANTIBACTERIANOS MEJORADOS QUE REDUZCAN TANTO LA TOXICIDAD COMO LA APARICION DE RESISTENCIAS, SE INVESTIGARAN TRES GRANDES BLOQUES DE DIFERENTES MOLECULAS ANTIMICROBIANAS:EN EL PRIMER BLOQUE NOS CENTRAREMOS EN ENTIDADES FORMADORAS DE POROS TRANSMEMBRANA, COMO NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUESTOS POR CICLOPEPTIDOS, ESTUDIAREMOS SU MECANISMO DE INTERACCION CON LA MEMBRANA Y EL TRANSPORTE A TRAVES DE SUS CAVIDADES, SE DESARROLLARAN PARAMETROS CG DE ESTOS PEPTIDOS Y SE UTILIZARAN COMO NANOPOROS BIOMIMETICOS, MODELOS DE CANALES BIOLOGICOS, LO QUE AYUDARA AL DISEÑO DE NUEVAS TERAPIAS PARA CANALOPATIAS, ENFERMEDADES PROVOCADAS POR UN FUNCIONAMIENTO INCORRECTO DE DETERMINADO TIPO DE PROTEINAS, LLEVAREMOS A CABO UNA COMPARATIVA DE METODOS COMPUTACIONALES PARA LA OBTENCION DE CONSTANTES CINETICAS EN EL TRANSPORTE TRANSMEMBRANA DE IONES (BXD Y ABAD-SANSOM),EL SEGUNDO BLOQUE SE ENFOCA EN MOLECULAS ANTIMICROBIANAS CON MECANISMOS DISRUPTIVOS DE LA MEMBRANA, COMO LOS NANOTUBOS PEPTIDICOS, CICLODEXTRINAS O ENTIDADES POLIMERICAS, DESARROLLAREMOS UNA BASE DE DATOS A PARTIR DE SIMULACIONES SISTEMATICAS DE MD DE PEPTIDOS ANTIMICROBIANOS, ANALIZANDO DISTINTOS CAMPOS DE FUERZA Y CONDICIONES DE MEMBRANA: UNA VERSION BASICA Y GRATUITA, PARA UN USUARIO ESTANDAR Y OTRA VERSION PROFESIONAL PARA UN USUARIO MAS ESPECIALIZADO QUE BUSQUE ANALISIS O SISTEMAS CONCRETOS,EN EL ULTIMO BLOQUE CONSIDERAREMOS OTRAS MOLECULAS ANTIMICROBIANAS CON MECANISMOS DIFERENTES O DESCONOCIDOS, COMO LOS AQCS O HIDROFOBINAS, ACEITES ESENCIALES, COMPUESTOS NATURALES Y MOLECULAS SINTETICAS, EN EL MARCO DE INTERES INDUSTRIAL O UNA ETN EUROPEA, RESPECTIVAMENTE,EL PRESENTE PROYECTO ESTA CONCEBIDO EN UN ESCENARIO TOTALMENTE INTERDISCIPLINAR EN DONDE SE TRATARA DE COMBINAR UN SOLIDO ENFOQUE COMPUTACIONAL, INNOVADOR EN EL CAMPO DE LOS AGENTES ANTIMICROBIANOS, CON DIFERENTES COLABORACIONES EXPERIMENTALES DE GRUPOS ESPECIALIZADOS EN EL DESARROLLO DE MOLECULAS ANTIMICROBIANAS A NIVEL NACIONAL E INTERNACIONAL, EL ENFOQUE PROPUESTO BASADO EN LA SINERGIA ENTRE METODOS IN-SILICO/IN-VITRO SE BENEFICIARA ENORMEMENTE DE UN ESCENARIO TAN INTERDISCIPLINAR POSIBILITANDO UN AVANCE SIGNIFICATIVO EN LA VALIDACION DE METODOS COMPUTACIONALES PARA PROBAR/VERIFICAR LAS PREDICCIONES IN-SILICO, ADEMAS, COMO PARTE DEL COMITE DE GESTION EN LA ACCION EUROPEA COST CM1306,SERA POSIBLE UN INTERCAMBIO DE INFORMACION EXCEPCIONAL Y COLABORATIVO ENTRE GRUPOS EXPERIMENTALES Y TEORICOS, MAXIMIZANDO ASI EL IMPACTO DE LAS ACTIVIDADES DE INVESTIGACION DE ESTA PROPUESTA, OLIGÓMEROS ANTIMICROBIANOS\AMPS\MEMBRANA\NANOPOROS\DINÁMICA MOLECULAR\COARSE-GRAINED\GPU\AUTOENSAMBLAJE

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