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BFU2008-01046

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DETECCION DE LA SELECCION NATURAL EN GENES CANDIDATOS: APROXIMACION A LAS BASES...

DETECCION DE LA SELECCION NATURAL EN GENES CANDIDATOS: APROXIMACION A LAS BASES DE LA ADAPTACION HUMANA LA DIVERSIDAD GENETICA ACTUAL DE LOS HUMANOS MODERNOS ES EL RESULTADO DE NUESTRA HISTORIA DEMOGRAFICA, Y DE EFECTOS SELECTIVOS QUE HAN ADAPTADO LAS DISTINTAS POBLACIONES HUMANAS A SUS RESPECTIVOS AMBIENTES, LA DISPONIBILIDAD DE IN... ver más

01/01/2008

UPF

109K€

Presupuesto del proyecto: 109K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 322

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UPF

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 322

Presupuesto del proyecto 109K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LA DIVERSIDAD GENETICA ACTUAL DE LOS HUMANOS MODERNOS ES EL RESULTADO DE NUESTRA HISTORIA DEMOGRAFICA, Y DE EFECTOS SELECTIVOS QUE HAN ADAPTADO LAS DISTINTAS POBLACIONES HUMANAS A SUS RESPECTIVOS AMBIENTES, LA DISPONIBILIDAD DE INFORMACION DE FRECUENCIAS ALELICAS DE SNPS QUE ABARCAN TODO EL GENOMA PARA DIFERENTES POBLACIONES, COMO LOS ANALIZADOS POR LA COMPAÑIA PERLEGEN O EL PROPIO PROYECTO INTERNACIONAL HAPMAP, HA PERMITIDO UN ABORDAJE GENOMICO DE LA DETECCION DE LA SELECCION NATURAL EN LA ESPECIE HUMANA, SE HAN PUBLICADO VARIOS ESTUDIOS QUE, A PARTIR DE LA DIFERENCIACION ENTRE POBLACIONES O MEDIANTE EL DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO ALREDEDOR DE CADA SNP, PROPORCIONAN LISTAS DE GENES CANDIDATOS A HABER SUFRIDO SELECCION POSITIVA EN UNA O MAS POBLACIONES HUMANAS SIN QUE SE HAYA PROPUESTO NINGUN TIPO DE INFERENCIA BIOLOGICA O FUNCIONAL, LOS INDICIOS DE SELECION EN DICHAS REGIONES GENICAS PUEDEN SER EL RESULTADO DE ERROR DE TIPO I Y EN TODO CASO, SE HAN OBTENIDO UTILIZANDO INFORMACION GENOMICA PARCIAL Y SIN UNA POSIBILIDAD CLARA DE INVESTIGAR LOS CAMBIOS FUNCIONALES RELACIONADOS CON LA PRESUNTA ADAPTACION, PROPONEMOS FILTRAR UNAS 20 REGIONES GENICAS A PARTIR DE ESTOS CANDIDATOS Y RESECUENCIARLAS EN 60 INDIVIDUOS (20 EUROPEOS, 20 ASIATICOS Y 20 YORUBAS), SE PRIORIZARAN AQUELLAS REGIONES CON FUNCIONES RELACIONADAS CON CARACTERES QUE PUEDAN HABER SIDO POTENCIALMENTE SELECCIONADOS COMO LOS RELACIONADOS CON LA NUTRICION, EL METABOLISMO, LA ENFERMEDAD, O LA INTERACCION CON PATOGENOS, ENTRE OTROS, EN ESTAS REGIONES PRESELECCIONADAS SE INTENTARA BUSCAR ADICIONALMENTE LA PRESENCIA DE VARIANTES GENETICAS POTENCIALMENTE FUNCIONALES (CAMBIOS NO SINONIMOS, ETC), Y DAR REFERENCIA A AQUELLAS REGIONES EN LAS QUE LOS SNPS GENOTIPADOS EN ELLAS MUESTREN UN PATRON DE FRECUENCIAS ALELICAS COMPATIBLES CON UN BARRIDO SELECTIVO, LA RESECUENCIACION NOS PERMITIRA DETERMINAR EL ESPECTRO COMPLETO Y NO SESGADO DE LAS FRECUENCIAS DE LAS DISTINTAS VARIANTES GENETICAS DE ESTAS REGIONES Y PODER APLICAR LOS TESTS CLASICO DE NEUTRALIDAD (COMO, POR EJEMPLO, LA D DE TAJIMA) PERMITIENDO ASI ACEPTAR O RECHAZAR LA EVOLUCION NEUTRA, EN AQUELLAS REGIONES GENICAS EN LAS QUE SE CONFIRME LA HUELLA DE LA SELECCION NATURAL, INTENTAREMOS POR ULTIMO DISEÑAR ESTUDIOS FUNCIONALES O DE EXPRESION PARA DETERMINAR LAS BASES MOLECULARES DE LA ADAPTACION FUNCIONAL QUE HAN SIDO OBJETO DE SELECCION POSITIVA, Selección\adaptación\poblaciones humanas\secuenciación

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