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BFU2008-01046

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DETECCION DE LA SELECCION NATURAL EN GENES CANDIDATOS: APROXIMACION A LAS BASES...

DETECCION DE LA SELECCION NATURAL EN GENES CANDIDATOS: APROXIMACION A LAS BASES DE LA ADAPTACION HUMANA LA DIVERSIDAD GENETICA ACTUAL DE LOS HUMANOS MODERNOS ES EL RESULTADO DE NUESTRA HISTORIA DEMOGRAFICA, Y DE EFECTOS SELECTIVOS QUE HAN ADAPTADO LAS DISTINTAS POBLACIONES HUMANAS A SUS RESPECTIVOS AMBIENTES, LA DISPONIBILIDAD DE IN... ver más

01/01/2008

UPF

109K€

Presupuesto del proyecto: 109K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Presupuesto del proyecto 109K€

Descripción del proyecto LA DIVERSIDAD GENETICA ACTUAL DE LOS HUMANOS MODERNOS ES EL RESULTADO DE NUESTRA HISTORIA DEMOGRAFICA, Y DE EFECTOS SELECTIVOS QUE HAN ADAPTADO LAS DISTINTAS POBLACIONES HUMANAS A SUS RESPECTIVOS AMBIENTES, LA DISPONIBILIDAD DE INFORMACION DE FRECUENCIAS ALELICAS DE SNPS QUE ABARCAN TODO EL GENOMA PARA DIFERENTES POBLACIONES, COMO LOS ANALIZADOS POR LA COMPAÑIA PERLEGEN O EL PROPIO PROYECTO INTERNACIONAL HAPMAP, HA PERMITIDO UN ABORDAJE GENOMICO DE LA DETECCION DE LA SELECCION NATURAL EN LA ESPECIE HUMANA, SE HAN PUBLICADO VARIOS ESTUDIOS QUE, A PARTIR DE LA DIFERENCIACION ENTRE POBLACIONES O MEDIANTE EL DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO ALREDEDOR DE CADA SNP, PROPORCIONAN LISTAS DE GENES CANDIDATOS A HABER SUFRIDO SELECCION POSITIVA EN UNA O MAS POBLACIONES HUMANAS SIN QUE SE HAYA PROPUESTO NINGUN TIPO DE INFERENCIA BIOLOGICA O FUNCIONAL, LOS INDICIOS DE SELECION EN DICHAS REGIONES GENICAS PUEDEN SER EL RESULTADO DE ERROR DE TIPO I Y EN TODO CASO, SE HAN OBTENIDO UTILIZANDO INFORMACION GENOMICA PARCIAL Y SIN UNA POSIBILIDAD CLARA DE INVESTIGAR LOS CAMBIOS FUNCIONALES RELACIONADOS CON LA PRESUNTA ADAPTACION, PROPONEMOS FILTRAR UNAS 20 REGIONES GENICAS A PARTIR DE ESTOS CANDIDATOS Y RESECUENCIARLAS EN 60 INDIVIDUOS (20 EUROPEOS, 20 ASIATICOS Y 20 YORUBAS), SE PRIORIZARAN AQUELLAS REGIONES CON FUNCIONES RELACIONADAS CON CARACTERES QUE PUEDAN HABER SIDO POTENCIALMENTE SELECCIONADOS COMO LOS RELACIONADOS CON LA NUTRICION, EL METABOLISMO, LA ENFERMEDAD, O LA INTERACCION CON PATOGENOS, ENTRE OTROS, EN ESTAS REGIONES PRESELECCIONADAS SE INTENTARA BUSCAR ADICIONALMENTE LA PRESENCIA DE VARIANTES GENETICAS POTENCIALMENTE FUNCIONALES (CAMBIOS NO SINONIMOS, ETC), Y DAR REFERENCIA A AQUELLAS REGIONES EN LAS QUE LOS SNPS GENOTIPADOS EN ELLAS MUESTREN UN PATRON DE FRECUENCIAS ALELICAS COMPATIBLES CON UN BARRIDO SELECTIVO, LA RESECUENCIACION NOS PERMITIRA DETERMINAR EL ESPECTRO COMPLETO Y NO SESGADO DE LAS FRECUENCIAS DE LAS DISTINTAS VARIANTES GENETICAS DE ESTAS REGIONES Y PODER APLICAR LOS TESTS CLASICO DE NEUTRALIDAD (COMO, POR EJEMPLO, LA D DE TAJIMA) PERMITIENDO ASI ACEPTAR O RECHAZAR LA EVOLUCION NEUTRA, EN AQUELLAS REGIONES GENICAS EN LAS QUE SE CONFIRME LA HUELLA DE LA SELECCION NATURAL, INTENTAREMOS POR ULTIMO DISEÑAR ESTUDIOS FUNCIONALES O DE EXPRESION PARA DETERMINAR LAS BASES MOLECULARES DE LA ADAPTACION FUNCIONAL QUE HAN SIDO OBJETO DE SELECCION POSITIVA, Selección\adaptación\poblaciones humanas\secuenciación

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