Descripción del proyecto
LA METABOLOMICA ES UNA TECNOLOGIA AUN EMERGENTE QUE COMPLEMENTA A LAS OTRAS DISCIPLINAS OMICAS COMO LA GENOMICA, LA TRANSCRIPTOMICA Y LA PROTEOMICA, ACTUALMENTE, EL PRINCIPAL DESAFIO DE LA METABOLOMICA ES MAXIMIZAR LA CAPACIDAD DE DETECCION DE LOS METODOS ANALITICOS PARA LOGRAR LA IDENTIFICACION INEQUIVOCA DE MILES DE METABOLITOS Y GENERAR ASI RESULTADOS REPRESENTATIVOS DE METABOLOMAS COMPLEJOS, PARA ESTE PROPOSITO, LAS DOS ETAPAS CON MAYOR INCIDENCIA EN EL FLUJO DE TRABAJO METABOLOMICO SON LA DETECCION E IDENTIFICACION DE COMPUESTOS QUIMICOS CON ALTA RESOLUCION, LA ESPECTROMETRIA DE MASAS (MS) JUEGA UN PAPEL RELEVANTE GRACIAS A SUS ALTAS CAPACIDADES EN TERMINOS DE SENSIBILIDAD Y SELECTIVIDAD, PARTICULARMENTE CUANDO SE COMBINA CON CROMATOGRAFIA LIQUIDA (LC) COMO TECNICA DE SEPARACION,LA ADQUISICION DE DATOS ES UNA PARTE ESENCIAL DEL PROCESO ANALITICO PARA GARANTIZAR EL EXITO DE LA DETECCION Y POSTERIOR IDENTIFICACION DE METABOLITOS, GENERALMENTE, LA ADQUISICION DE DATOS EN LC-MS SE LLEVA A CABO MEDIANTE PROTOCOLOS CONVENCIONALES, QUE GENERALMENTE FAVORECEN LA DETECCION DE LOS METABOLITOS MAS CONCENTRADOS O AQUELLOS CON UNA MAYOR EFICIENCIA DE IONIZACION, SIN EMBARGO, LA ADQUISICION DE DATOS SE PUEDE OPTIMIZAR PARA MEJORAR EL RENDIMIENTO DE DETECCION OBTENIENDO SEÑALES REPRESENTATIVAS DE UN MAYOR NUMERO DE METABOLITOS, INCLUIDOS LOS PRESENTES A BAJA CONCENTRACION O CON UNA CAPACIDAD DE IONIZACION REDUCIDA, ESTE PROYECTO SE OCUPA DEL DISEÑO, LA OPTIMIZACION Y EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS DE ADQUISICION DE DATOS PARA MEJORAR EL RENDIMIENTO DE LA DETECCION E IDENTIFICACION, EN PARTICULAR, LAS ESTRATEGIAS SE BASARAN EN LA ADQUISICION INDEPENDIENTE DE DATOS (DIA) QUE SE HA UTILIZADO DE MANERA EFICIENTE EN ANALISIS PROTEOMICO EN LOS ULTIMOS AÑOS, PARTICULARMENTE, VAMOS A DISEÑAR UN MODO DE OPERACION GENERICO PARA LA IMPLEMENTACION DE DIA, INCLUIDO EL PRETRATAMIENTO DE DATOS, QUE ES UN ASPECTO FRECUENTEMENTE OLVIDADO EN LOS FLUJOS DE TRABAJO METABOLOMICO, DIA PERMITE OBTENER SIMULTANEAMENTE INFORMACION CUALITATIVA Y CUANTITATIVA EN UN UNICO ANALISIS CON POSIBILIDAD DE PROCESARLO DE FORMA DIRIGIDA (GRUPO DE COMPUESTOS CONOCIDO) Y NO DIRIGIDA (CARACTERIZACION DEL MAYOR NUMERO POSIBLE DE COMPUESTOS QUIMICOS), POR LO TANTO, EL FLUJO DE TRABAJO CONSIDERARA AMBAS SITUACIONES,LA METODOLOGIA GENERICA SE APLICARA A AREAS RELEVANTES DE LA METABOLOMICA NUTRICIONAL Y CLINICA PARA LA DETERMINACION DE CUATRO FAMILIAS QUIMICAS: LIPIDOS, ACILCARNITINAS, PRODUCTOS FINALES DEL METABOLISMO Y NUCLEOSIDOS, UN VALOR AÑADIDO DE ESTA PROPUESTA ES LA APLICACION DE LOS METODOS DE ADQUISICION A UN ESTUDIO CLINICO PARA DILUCIDAR EL IMPACTO DE LA DIETA EN ESTAS FAMILIAS QUIMICAS Y TAMBIEN PARA PROBAR LAS POSIBILIDADES REALES DE LOS MODOS DIA DESARROLLADOS,EL PROYECTO COMBINA INVESTIGACION BASICA Y APLICADA, ESTA PROPUESTA PERMITIRA DESARROLLAR HERRAMIENTAS METODOLOGICAS CON INCIDENCIA EN EL ANALISIS METABOLOMICO, ESENCIALMENTE EN LIPIDOMICA Y NUTRIMETABOLOMICA, POR OTRO LADO, ESTAS HERRAMIENTAS SE APLICARAN A UN ESTUDIO MODELO PARA PROBAR LAS POSIBILIDADES REALES DE ESTOS DESARROLLOS,LOS RESULTADOS DERIVADOS DE ESTE PROYECTO PUEDEN AYUDAR EN LA IMPLEMENTACION DE LOS MODOS DIA EN EL ANALISIS METABOLOMICO, LA ADQUISICION DE INFORMACION QUIMICA CUALITATIVA Y CUANTITATIVA EN UN UNICO ANALISIS ES EL PRINCIPAL PILAR PARA APOYAR LA APLICABILIDAD DE DIA NO COMO MODO DE ADQUISICION EXCLUSIVO, SINO COMO UNA HERRAMIENTA COMPLEMENTARIA PARA CUBRIR LAS LIMITACIONES DE DDA, ANALISIS QUIMICO\ESPECTROMETRIA DE MASAS\METABOLOMICA\CROMATOGRAFIA DE LIQUIDOS\DETECCION\IDENTIFICACION\ADQUISICION DE DATOS