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CGL2015-67849-P

Financiado
DESARROLLO Y APLICACION DE HERRAMIENTAS DE SECUENCIACION MASIVA E INFERENCIA BAY...
DESARROLLO Y APLICACION DE HERRAMIENTAS DE SECUENCIACION MASIVA E INFERENCIA BAYESIANA PARA DETECTAR LA HUELLA FILOGENETICA DE LA EXTINCION A DIFERENTES ESCALAS EVOLUTIVAS EL INFORME DEL AÑO 2014 DEL PANEL INTERGUBERNAMENTAL PARA EL CAMBIO CLIMATICO PRESENTA EVIDENCIA SOLIDA DEL CALENTAMIENTO GLOBAL DEL PLANETA, AUNQUE ESTE CALENTAMIENTO SE HA ATRIBUIDO A LA ACTIVIDAD HUMANA, LA TIERRA HA EXPERIMENT... EL INFORME DEL AÑO 2014 DEL PANEL INTERGUBERNAMENTAL PARA EL CAMBIO CLIMATICO PRESENTA EVIDENCIA SOLIDA DEL CALENTAMIENTO GLOBAL DEL PLANETA, AUNQUE ESTE CALENTAMIENTO SE HA ATRIBUIDO A LA ACTIVIDAD HUMANA, LA TIERRA HA EXPERIMENTADO OTROS PERIODOS SIMILARES DE CALENTAMIENTO EN EL PASADO, CON EFECTO EN LAS TASAS DE DIVERSIFICACION Y CAMBIOS EN LOS NIVELES DE BIODIVERSIDAD, LAS PLANTAS ESTAN INTIMAMENTE LIGADAS A CONDICIONES AMBIENTALES, ENTENDER SU RESPUESTA EVOLUTIVA A EVENTOS GEOLOGICOS DE CAMBIO CLIMATICO NOS PUEDE AYUDAR A ENTENDER EL IMPACTO DE FUTUROS CAMBIOS AMBIENTALES EN PATRONES DE ENSAMBLAJE BIOTICO,LA MAYORIA DE ESTUDIOS SOBRE CAMBIO CLIMATICO SE ENFOCAN EN LA PERDIDA DE DIVERSIDAD A ESCALA MACROEVOLUTIVA Y MACROECOLOGICA Y EN RESPUESTAS A NIVEL DEMOGRAFICO DE LAS ESPECIES POR ACTIVIDAD ATROPOGENICA Y PERTURBACIONES RECIENTES EN EL CLIMA (NIVEL MICROEVOLUTIVO), SIN EMBARGO, PARA ENTENDER EL EFECTO EVOLUTIVO A LARGO PLAZO DEL CAMBIO CLIMATICO ES NECESARIO UN ENFOQUE QUE COMBINE LAS ESCALAS MICRO Y MACROEVOLUTIVAS, DESDE POBLACIONES HASTA ESPECIES, INTEGRAR AMBAS ESCALAS ES DIFICIL PORQUE REQUIERE COMBINAR MULTIPLES DISCIPLINAS Y ENFOQUES ANALITICOS, PERO AVANCES RECIENTES LO HAN HECHO POSIBLE, ESPECIALMENTE EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS DE SECUENCIACION MASIVA (NGS), QUE HAN PERMITIDO MULTIPLICAR EL NUMERO DE GENES, INDIVIDUOS, O ESPECIES MUESTREADAS, ESTA REVOLUCION MOLECULAR HA IDO EN PARALELO A NUEVOS AVANCES ANALITICOS Y AL CRECIMIENTO EXPONENCIAL DE LA BIOINFORMATICA, LO QUE NOS PERMITE EXPLORAR LOS PATRONES Y PROCESOS DE ENSAMBLAJE BIOTICO A DIFERENTES ESCALAS ESPACIOTEMPORALES,EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES UTILIZAR ESTOS AVANCES CIENTIFICOS —ASI COMO OTROS NUEVOS DESARROLLADOS AQUI— PARA ANALIZAR LOS EFECTOS A LARGO PLAZO DEL CAMBIO CLIMATICO HISTORICO Y LA EXTINCION EN VARIOS LINAJES DE PLANTAS A DISTINTA ESCALA EVOLUTIVA, EN PARTICULAR, NOS CENTRAREMOS EN EL CONTINENTE AFRICANO Y EN CINCO LINAJES NO TROPICALES CON UN PATRON COMUN DE DISTRIBUCION DISYUNTA EN EL CONTINENTE, LA LLAMADA RAND FLORA, QUE HA SIDO EXPLICADA POR ELEVADAS TASAS DE EXTINCION ASOCIADAS A ARIDIFICACION A LO LARGO DEL TIEMPO, ESTO SE HARA MEDIANTE: A) LA RECONSTRUCCION DE RELACIONES FILOGENETICAS UTILIZANDO UNA NOVEDOSA HERRAMIENTA NGS, ENRIQUECIMIENTO DIRIGIDO ACOPLADO A BARRIDO GENOMICO (HYB-SEQ), QUE PERMITE GENERAR GRANDES CANTIDADES DE DATOS GENOMICOS CON RESOLUCION A DIFERENTES ESCALAS EVOLUTIVAS; B) LA INFERENCIA DEL PAPEL DEL MEDIO AMBIENTE Y EL NICHO CLIMATICO EN LA FORMACION DE ESTAS DISYUNCIONES EMPLEANDO HERRAMIENTAS DE MODELIZACION DE NICHO, DATOS PALEOCLIMATICOS Y MODELOS DE SIMULACION ESPACIAL; C) LA ESTIMACION DE TASAS DE EXTINCION A PARTIR DE FILOGENIAS MEDIANTE MODELOS MACROEVOLUTIVOS EN UN MARCO ESTADISTICO BAYESIANO; Y D) EL DESARROLLO DE UN NUEVO METODO DE ANALISIS BAYESIANO PARA INFERIR EVENTOS DE EXTINCION MASIVA A PARTIR DE DATOS BIOGEOGRAFICOS DENTRO DE Y ENTRE LINAJES, ESTO NOS PERMITIRA ESTUDIAR EL EFECTO DE LA EXTINCION MEDIADA POR CAMBIO CLIMATICO EN TRAYECTORIAS EVOLUTIVAS A DIFERENTES ESCALAS, DESDE LA EXTINCION DE ESPECIES Y LA PERDIDA DE DIVERSIDAD HASTA EL DECLIVE POBLACIONAL EN TIEMPOS MAS RECIENTES, EL ENFOQUE EN UN CONTINENTE QUE HASTA AHORA HA RECIBIDO POCA ATENCION EN EL CONTEXTO DE LA CRISIS DE LA DIVERSIDAD PERMITIRA INCREMENTAR EL CONOCIMIENTO DISPONIBLE EN ESTA REGION Y PODRIA PROPORCIONAR HERRAMIENTAS A GESTORES DE CONSERVACION PARA PALIAR LOS EFECTOS DE LA ARIDIFICACION EN LA PERDIDA DE DIVERSIDAD TÉCNICAS SECUENCIACIÓN MASIVA\BIOGEOGRAFÍA BAYESIANA\EXTINCIÓN\ÁFRICA\CAMBIO CLIMÁTICO\DIVERSIFICACIÓN ver más
01/01/2015
CSIC
225K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 225K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M