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ATR2023-145559

Financiado
Biodiversidad
LA CRISIS DE LA BIODIVERSIDAD, PROVOCADA POR EL CAMBIO CLIMATICO INDUCIDO POR EL HOMBRE Y EL USO DEL SUELO, DEPENDE DE UNA EVALUACION Y UN INVENTARIO PRECISOS DE LA BIODIVERSIDAD ACTUAL. LA BIODIVERSIDAD, COMO MEDIDA, SE BASA TANT... LA CRISIS DE LA BIODIVERSIDAD, PROVOCADA POR EL CAMBIO CLIMATICO INDUCIDO POR EL HOMBRE Y EL USO DEL SUELO, DEPENDE DE UNA EVALUACION Y UN INVENTARIO PRECISOS DE LA BIODIVERSIDAD ACTUAL. LA BIODIVERSIDAD, COMO MEDIDA, SE BASA TANTO EN EL NUMERO DE ESPECIES COMO EN LA VARIACION DE LAS ESPECIES. HISTORICAMENTE, LAS ESPECIES SE DEFINIAN E IDENTIFICABAN UNICAMENTE A PARTIR DE CARACTERISTICAS MORFOLOGICAS RECONOCIBLES POR EL SER HUMANO. SIN EMBARGO, EN LAS ULTIMAS DECADAS HEMOS APRENDIDO QUE MUCHAS DE LAS LLAMADAS "MORFOESPECIES" REPRESENTAN EN REALIDAD MULTIPLES ESPECIES DISTINTAS, MIENTRAS QUE OTRAS ESPECIES QUE ANTES SE CONSIDERABAN DISTINTAS EN REALIDAD SOLO REPRESENTAN VARIANTES DE LA MISMA ESPECIE. UNA ALTERNATIVA MODERNA A LA IDENTIFICACION Y DISTINCION DE ESPECIES POR RASGOS MORFOLOGICOS ES LA DELIMITACION DE ESPECIES A PARTIR DE DATOS DE SECUENCIAS GENOMICAS.LAS TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION ACTUALES, MAS ACCESIBLES Y BARATAS, PERMITEN SECUENCIAR GENOMAS COMPLETOS DE MUCHOS INDIVIDUOS DE VARIAS POBLACIONES PARA ESTUDIAR LA DELIMITACION DE ESPECIES. LA SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO PRODUCE CONJUNTOS DE DATOS EXTREMADAMENTE GRANDES, POR EJEMPLO, TABLAS CON CIENTOS DE FILAS (MUESTRAS DE INDIVIDUOS) Y CIENTOS DE MILLONES DE COLUMNAS (SITIOS DE NUCLEOTIDOS EN EL GENOMA). LAS HERRAMIENTAS ESTADISTICAS ACTUALES PARA LA DELIMITACION DE ESPECIES NO PUEDEN MANEJAR TALES CANTIDADES DE DATOS DE MANERA EFICIENTE; O BIEN SE TOMAN ATAJOS DE MODELIZACION SEVEROS CON UNA ENORME PERDIDA DE POTENCIA ESTADISTICA, O BIEN LOS MODELOS SOFISTICADOS REQUIEREN ENORMES CANTIDADES DE POTENCIA COMPUTACIONAL, SI ES QUE FUNCIONAN.EN ESTE PROYECTO DESARROLLARE METODOS NOVEDOSOS PARA LA DELIMITACION DE ESPECIES UTILIZANDO DATOS DE POLIMORFISMO GENOMICO (ES DECIR, UTILIZANDO LA FRECUENCIA DE NUCLEOTIDOS DENTRO DE UNA POBLACION PARA TODO EL GENOMA). MI ENFOQUE SE BASA EN LOS RELATIVAMENTE NUEVOS MODELOS FILOGENETICOS CONSCIENTES DEL POLIMORFISMO (POMO), INTRODUCIDOS POR PRIMERA VEZ EN 2013, Y AMPLIA ESTOS MODELOS PARA INFERIR (I) LOS TIEMPOS DE DIVISION DE LA POBLACION, (II) LAS RELACIONES ANCESTRALES-DESCENDIENTES ENTRE LAS POBLACIONES, Y (III) LAS DELIMITACIONES DE ESPECIES. ESTO INCLUYE LA DERIVACION DE NUEVOS MODELOS ESTADISTICOS, EL DESARROLLO DE METODOS DE INFERENCIA ESTADISTICA Y LA IMPLEMENTACION DE SOFTWARE INFORMATICO EFICIENTE. DEMOSTRARE EL USO DE ESTOS NUEVOS MODELOS EN UN ESTUDIO DE CASO SOBRE LUCIERNAGAS. EN PRIMER LUGAR, ESTIMARE EL TIEMPO DE DIVISION ENTRE LA POBLACION DE LUCIERNAGAS DEL ESTE Y EL OESTE DE LA PENINSULA IBERICA Y HACIA LAS POBLACIONES CENTROEUROPEAS, PREGUNTANDOME SI ESTA EXPANSION SE HA PRODUCIDO ANTES, DURANTE O DESPUES DE LA ULTIMA GLACIACION. EN SEGUNDO LUGAR, DEDUCIRE SI LA POBLACION ANCESTRAL SE ORIGINO EN LA PENINSULA IBERICA Y LUEGO MIGRO A EUROPA CENTRAL O VICEVERSA. POR ULTIMO, COMPROBARE SI ESTAS POBLACIONES REPRESENTAN ESPECIES DISTINTAS UTILIZANDO EL NOVEDOSO ENFOQUE DE DELIMITACION DE ESPECIES. DELIMITACION DE ESPECIES\LUCIERNAGAS\GENOMICA\BAYESIANO\MAXIMA VEROSIMILITUD ver más
01/01/2023
CSIC
871K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2023-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 871K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M