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PID2019-108797RB-I00

Financiado

DESARROLLO DE UN MODELO TOTAL DE ENSAMBLAJE DE COMUNIDADES MICROBIANAS MEDIANTE...

DESARROLLO DE UN MODELO TOTAL DE ENSAMBLAJE DE COMUNIDADES MICROBIANAS MEDIANTE EL USO CONJUNTO DE SEÑAL FILOGENETICA Y EXPERIMENTACION AVANZADA IN SILICO, IN VITRO E IN VIVO LAS COMUNIDADES MICROBIANAS JUEGAN ROLES ESENCIALES Y PREPONDERANTES EN LOS PROCESOS ECOSISTEMICOS, DESAFORTUNADAMENTE, LAS REGLAS QUE GOBIERNAN SU ENSAMBLAJE TODAVIA NO SE COMPRENDEN BIEN, A PESAR DEL CONSENSO ACTUAL DE QUE DICHO... ver más

01/01/2019

UAM

194K€

Presupuesto del proyecto: 194K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 3182

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01

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Participantes

UAM

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID

Total investigadores 3182

Presupuesto del proyecto 194K€

Descripción del proyecto LAS COMUNIDADES MICROBIANAS JUEGAN ROLES ESENCIALES Y PREPONDERANTES EN LOS PROCESOS ECOSISTEMICOS, DESAFORTUNADAMENTE, LAS REGLAS QUE GOBIERNAN SU ENSAMBLAJE TODAVIA NO SE COMPRENDEN BIEN, A PESAR DEL CONSENSO ACTUAL DE QUE DICHO CONOCIMIENTO MEJORARIA EN GRAN MEDIDA NUESTRA CAPACIDAD PARA COMPRENDER Y MODIFICAR LAS COMUNIDADES MICROBIANAS, IMPACTANDO POSITIVAMENTE, POR EJEMPLO, LA AGRICULTURA, LA ATENCION MEDICA Y MUCHAS PRACTICAS AMBIENTALES, EN LOS ULTIMOS AÑOS HEMOS VISTO EL RECONOCIMIENTO PROGRESIVO DEL PAPEL QUE LA SINTESIS DE VELLEND DE LA ECOLOGIA DE COMUNIDADES PUEDE DESEMPEÑAR EN NUESTRA COMPRENSION DEL ENSAMBLAJE COMUNITARIO EN ECOSISTEMAS MICROBIANOS, SIN EMBARGO, TODAVIA CARECIAMOS DE UN MODELO DE ENSAMBLAJE COMUNITARIO TEORICAMENTE SOLIDO, CAPAZ DE RECAPITULAR PATRONES OBSERVADOS DE DIVERSIDAD MICROBIANA Y CON CAPACIDADES PREDICTIVAS CON RESPECTO A LA COMPOSICION DE LA COMUNIDAD Y EL PAPEL ECOFISIOLOGICO DE SUS MIEMBROS, ESTE PROYECTO SE BASA EN UN MARCO CONCEPTUAL PROPUESTO RECIENTEMENTE POR EL IP PARA EL ENSAMBLAJE CON RESTRICCION FILOGENETICA DE COMUNIDADES MICROBIANAS, EL MARCO SINTETIZA LOS HECHOS DE QUE LOS PROCESOS DETERMINISTAS BASADOS EN RASGOS TIENEN MAS COMUNMENTE UN IMPACTO SIGNIFICATIVO EN EL ENSAMBLAJE DE LAS COMUNIDADES MICROBIANAS, LAS COMUNIDADES MICROBIANAS GENERALMENTE MUESTRAN UNA SEÑAL FILOGENETICA SIGNIFICATIVA, Y QUE LOS RASGOS MICROBIANOS Y LA COHERENCIA ECOLOGICA ESTAN, EN CIERTA MEDIDA, CONSERVADOS FILOGENETICAMENTE, PRODUCIENDO UN NUEVO MODELO DE ENSAMBLAJE PARA LAS COMUNIDADES MICROBIANAS, EL OBJETIVO GENERAL DEL PROYECTO ES: PRIMERO, PROBAR LA VALIDEZ DE LAS REGLAS DE ENSAMBLAJE Y LAS PREDICCIONES DEL MODELO, Y SEGUNDO, PROPORCIONAR UNA PRUEBA DE CONCEPTO QUE DEMUESTRE SU UTILIDAD CON UN CASO REAL NATURAL IN VIVO,TENIENDO EN CUENTA LOS OBJETIVOS GENERALES MENCIONADOS ANTERIORMENTE, PROPONEMOS LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS PARA EL PROYECTO: DESARROLLAR UNA HERRAMIENTA BIOINFORMATICA MEJORADA PARA EL ANALISIS APROPIADO DE COMUNIDADES MICROBIANAS DENTRO DEL MARCO CONCEPTUAL PROPUESTO, PROBAR LA VALIDEZ DE LAS PREDICCIONES DEL MARCO PARA COMUNIDADES COMPLEJAS NATURALES, EXAMINAR LAS PREDICCIONES CONTRA CONJUNTOS DE DATOS METAGENOMICOS (SHOTGUN) DE COMUNIDADES NATURALES SIMPLES, TESTAR LAS PREDICCIONES CONTRA UNA COMUNIDAD ARTIFICIAL SIMPLE Y DISECCIONAR GENETICAMENTE LAS INTERACCIONES ENTRE SUS POBLACIONES, ANALIZAR LAS REGLAS DE ENSAMBLAJE PREDICHAS CONTRA PATRONES NATURALES OBSERVADOS, E IMPLEMENTAR UN INNOVADOR SISTEMA EXPERIMENTAL DONDE LAS PREDICCIONES DEL MARCO E HIPOTESIS EMERGENTES PUEDAN SER PROBADAS,ADEMAS DE TECNICAS GENERALES EN MICROBIOLOGIA, BIOLOGIA MOLECULAR Y BIOINFORMATICA, ASI COMO HERRAMIENTAS ESTANDAR DE ANOTACION Y COMPARACION DE (META)GENOMAS, ESTE PROYECTO HARA USO DE ANALISIS DE REDES, SIMULACIONES METABOLICAS Y DE ENSAMBLAJE, Y, SIGNIFICATIVAMENTE, UNA ESTRATEGIA INNOVADORA PARA LA DISECCION GENETICA DE INTERACCIONES ENTRE POBLACIONES BASADA EN CULTUROMICA Y SECUENCIACION DE MUTANTES POR TRANSPOSICION, ECOLOGIA MICROBIANA\METAGENOMICA

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