Descripción del proyecto
LAS TECNICAS DE IMAGENES DE ESPECTROSCOPIA DE MASAS (IEM) ESTAN EMERGIENDO DE FORMA FULGURANTE PORQUE PERMITEN MEDIR EFICAZMENTE COMPUESTOS (LIPIDOS, PEPTIDO, PROTEINAS, ETC,) EN TEJIDOS VEGETALES O ANIMALES, ESTA TECNICA SE DENOMINA TAMBIEN HISTOLOGIA MOLECULAR Y SE UTILIZA YA EN APLICACIONES CLINICAS (SOBRE TODO EN CANCER), EN APLICACIONES CON MODELOS ANIMALES, EN TECNOLOGIAS DE ALIMENTOS, ETC, SOBRE TODO EN EL AMBITO DE LA PROTEOMICA, LA METABOLOMICA ESPACIAL CONSISTE EN LA DETECCION DE COMPUESTOS DE BAJO PESO MOLECULAR Y SU LOCALIZACION EN UNA SUPERFICIE, EL DESARROLLO DE LA TECNICA ES REDUCIDO DEBIDO A LAS INTERFERENCIAS QUE GENERAN LAS MATRICES ORGANICAS EN LA ZONA DE BAJA DEL ESPECTRO, COMO SUSTITUTO, SE DESARROLLAN LAS SUPERFICIES DE ESTADO SOLIDO BASADAS EN SILICIO NEGRO Y METALES (BASICAMENTE AU Y AG), EN ESTE PROYECTO, SE DISEÑARAN, FABRICARAN Y FUNCIONALIZARAN ESTAS SUPERFICIES PARA AUMENTAR EL RENDIMIENTO DEL PROCESO DE DESORCION/IONIZACION Y PARA HACERLAS SELECTIVAS HACIA UN COMPUESTO O UNA FAMILIA DE COMPUESTOS DETERMINADOS, PARA ELLO SE UTILIZARAN LOS PROCESOS DE DEPOSICION Y ATAQUE SECO (RIE), DE PULVERIZACION MEDIANTE RF Y DE EVAPORACION TERMICA, SE PONDRA A PUNTO TAMBIEN LA TECNICA DE IMPRIMACION DE TEJIDOS SOBRE ESTAS SUPERFICIES,OTRA LIMITACION IMPORTANTE DE LA TECNICA ES LA AUSENCIA DE HERRAMIENTAS DE SOFTWARE PARA ANALISIS NO DIRIGIDOS, SERIA DESEABLE TENER HERRAMIENTAS INTEGRADAS DE VISUALIZACION, PRE-PROCESADO Y ANALISIS MULTIVARIANTE DE IMAGENES, QUE PERMITAN UNA CORRECTA SEGMENTACION Y CLASIFICACION DE IMAGENES, Y QUE PERMITAN LA DETERMINACION DE BIOMARCADORES, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS ELABORAR UN PAQUETE EN R, DE LIBRE ACCESO, QUE IMPLEMENTE EL FLUJO COMPLETO DE PROCESADO DE IEM, SE UTILIZARAN LAS TECNICAS DE APRENDIZAJE MAQUINA, TANTO EN APROXIMACIONES SUPERVISADAS (EN EL CASO DE QUE SE DISPONGAN DE IMAGENES HISTOLOGICAS PREVIAS) COMO NO SUPERVISADAS (ANALISIS NO DIRIGIDO), OTRA FUNCIONALIDAD DEL PAQUETE SERA LA DETERMINACION DE LOS METABOLITOS CLAVE, A PARTIR DE LA APLICACION DE TECNICAS ESTADISTICAS DE FILTRADO DE IONES, LA PRIMERA APLICACION CONSISTE EN UTILIZAR LAS TECNICAS DESARROLLADAS A MEJORAR EL PRONOSTICO DE LOS PACIENTES CON CANCER DE VEJIGA, CONSIDERADOS DE ALTO RIESGO, A PARTIR DE LAS IEM SE DETERMINARA LA HETEROGENEIDAD INTRA-TUMOR Y SE RELACIONARA CON LA EVOLUCION Y SUPERVIVENCIA DEL PACIENTE, CON LA FINALIDAD DE ENCONTRAR COMPUESTOS MARCADORES DE PRONOSTICO, QUE PUEDAN AYUDARNOS A MEJORAR EL TRATAMIENTO A APLICAR, LOS MARCADORES EN TEJIDO SE COMPLEMENTARAN CON EL ANALISIS METABOLOMICO EN ORINA Y SERUM DEL MISMO PACIENTE, LA SEGUNDA APLICACION ESTUDIA LA PROGRESION DE LA DIABETES TIPO 2 EN MODELOS ANIMALES, SE CARACTERIZARA EL PERFIL METABOLICO DE LOS ISLOTES DE LANGERHANS DIRECTAMENTE EN PANCREAS (SIN AISLARLOS), COMPARANDO ANIMALES SANOS Y ANIMALES DIABETICOS, LA TECNICA DE NP DE AU DESARROLLADA EN EL GRUPO PREVIAMENTE CREEMOS QUE SERA IDEAL POR SU ELEVADA RESOLUCION ESPACIAL, FLEXIBILIDAD Y SENSIBILIDAD, LA TECNICA IEM SE COMPLEMENTARA CON LA ADQUISICION DE IMAGENES DE CELULAS BETA (LAS CELULAS PRODUCTORAS DE INSULINA) MEDIANTE SERS (SURFACE-ENHANCED RAMAN ESPECTROSCOPY), QUE PERMITE RESOLUCIONES ESPACIALES POR DEBAJO DE LA MICRA, SE REALIZARAN TAMBIEN EXPERIMENTOS DE METABOLOMICA CON EXTRACTOS DEL MISMO TEJIDO, PARA LA BUSQUEDA DE BIOMARCADORES DE PROGRESION HACIA DIABETES TIPO 2, PROCESADO DE IMÁGENES\METABOLOMICA ESPACIAL\NANOSUPERFICIES FUNCIONALIZADAS\IMÁGENES DE ESPECTROMETRIA DE MASAS