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TEC2015-69076-P

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DESARROLLO DE NANOSUPERFICIES Y ALGORITMOS DE PROCESADO PARA LA OBTENCION Y TRAT...

DESARROLLO DE NANOSUPERFICIES Y ALGORITMOS DE PROCESADO PARA LA OBTENCION Y TRATAMIENTO DE IMAGENES METABOLICAS MEDIANTE LASER DESORPTION IONIZATION MASS SPECTROMETRY (LDI-MS) EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES EL DESARROLLO DE NUEVAS NANO SUPERFICIES Y HERRAMIENTAS DE PROCESADO DE DATOS PARA LA OBTENCION DE IMAGENES DE ESPECTROMETRIA DE MASAS (MSI, EN INGLES) DE TEJIDOS BIOLOGICOS MEDIANTE IONIZACIO... ver más

01/01/2015

URV

158K€

Presupuesto del proyecto: 158K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD ROVIRA I VIRGILI No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 8

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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URV

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD ROVIRA I VIRGILI No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 8

Presupuesto del proyecto 158K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES EL DESARROLLO DE NUEVAS NANO SUPERFICIES Y HERRAMIENTAS DE PROCESADO DE DATOS PARA LA OBTENCION DE IMAGENES DE ESPECTROMETRIA DE MASAS (MSI, EN INGLES) DE TEJIDOS BIOLOGICOS MEDIANTE IONIZACION/DESORCION POR LASER (LDI, EN INGLES) Y SU APLICACION EN METABOLOMICA,MSI SE HA DESARROLLADO EN EL CONTEXTO DE ESTUDIOS DE PROTEOMICA Y PERMITE LA LOCALIZACION DE MOLECULAS DE ELEVADO/MEDIO PESO MOLECULAR EN CORTES DE TEJIDOS SIENDO DE GRAN UTILIZAD EN EL AMBITO BIOMEDICO, SIN EMBARGO, EL USO DE LA TECNICA EN ESTUDIOS METABOLOMICOS ES REDUCIDO DEBIDO A LAS INTERFERENCIAS EN LA ZONA DE BAJO PESO MOLECULAR (METABOLITOS) QUE GENERAN LAS MATRICES ORGANICAS USADAS GENERALMENTE PARA FAVORECER LA IONIZACION, EN ESTE PROYECTO OFRECEMOS UNA ALTERNATIVA INNOVADORA SUSTITUYENDO LAS MATRICES ORGANICAS POR NANO CAPAS DE DIFERENTES METALES Y OXIDOS METALICOS DEPOSITADAS MEDIANTE PULVERIZACION CATODICA O EVAPORACION TERMICA SOBRE LOS TEJIDOS, ALTERNATIVAMENTE, TAMBIEN SE EXPLORARA VIABILIDAD DE UTILIZAR DIFERENTES SUPERFICIES NANOESTRUCTURADAS COMO SUSTRATO PARA LA IONIZACION, ESTAS SUPERFICIES SE FUNCIONALIZARAN MEDIANTE DISTINTOS PLASMAS DE RF PARA FACILITAR LA IONIZACION, LA APLICACION DE ESTAS TECNICAS DE FABRICACION Y FUNCIONALIZACION DE SUPERFICIES EN EL AMBITO DEL MSI ES ESCASA, POR LO QUE ESTE PROYECTO IMPLICARA POR PRIMERA VEZ LA EXPLORACION DE LA VIABILIDAD DE MUCHAS DE ESTAS TECNOLOGIAS TANTO EN EL AMBITO DE MSI COMO DE LA METABOLOMICA,POR OTRA PARTE, EL PROCESADO DE LAS IMAGENES OBTENIDAS ES MUY COMPLEJO DEBIDO, A LA ELEVADA CANTIDAD DE DATOS GENERADOS Y A LA FORMACION DE ADUCTOS O IONES DE FRAGMENTACION DE UN MISMO METABOLITO, PROBLEMAS TAN SOLO PARCIALMENTE RESUELTOS HASTA LA FECHA, LA VISUALIZACION DE LAS MSI CONSISTE, GENERALMENTE, EN LA REPRESENTACION DE LA CONCENTRACION DE UN ION EN UNA SUPERFICIE, CODIFICADA EN UNA ESCALA DE COLORES SEGUN SU ABUNDANCIA, ESTA ESTRATEGIA ES UTIL EN ESTUDIOS DIRIGIDOS, PERO NO EN ESTUDIOS EN LOS QUE QUEREMOS DETECTAR LAS REGIONES DE UN TEJIDO QUE TIENEN UNA COMPOSICION MOLECULAR PARECIDA (SEGMENTACION), PARA ELLO, PROPONEMOS UTILIZAR TECNICAS DE ANALISIS MULTIVARIANTE NO SUPERVISADAS (KNN, O REDES NEURONALES HOPFIELD O SOM) ASI COMO (SEMI)SUPERVISADAS (FUZZYARTMAP, SVMS, REDES NEURONALES PROBABILISTICAS, ETC,), TOMANDO COMO MODELO DE ENTRENAMIENTO IMAGENES HISTOLOGICAS OBTENIDAS EN CORTES CONSECUTIVOS, ADEMAS, MEDIANTE TECNICAS DE CORRELACION ESPACIAL ENTRE PIXELS VECINOS, AGRUPAREMOS LOS IONES PROCEDENTES DEL MISMO COMPUESTO Y OBTENDREMOS SU DISTRIBUCION EN LA SUPERFICIE DEL TEJIDO, LOS ALGORITMOS DESARROLLADOS, DEBIDO A LA GRAN DIMENSION DE LOS FICHEROS, UTILIZARAN TECNICAS ASOCIADAS AL DENOMINADO CAMPO DEL BIG DATA Y FORMARAN PARTE DE UN APLICATIVO EN R, QUE CONTENDRA HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS DESDE LAS ETAPAS DE PRE-PROCESADO DE ESPECTROS A LA SEGMENTACION Y VISUALIZACION DE IMAGENES, LAS TECNOLOGIAS DESARROLLAS SE APLICARAN AL ESTUDIO DE LAS ENFERMEDADES METABOLICAS Y LA TOXICOLOGIA, ANALIZANDO TEJIDOS DE MODELOS ANIMALES, POR UNA PARTE, SE ESTUDIARA LA MORFOLOGIA Y COMPOSICION METABOLICA DEL HIGADO GRASO Y DE LOS ISLOTES PANCREATICOS EN RATAS MODIFICADAS GENETICAMENTE PARA ACELERAR LA APARICION DE DIABETES (KOS APOE Y IAPP-TG) Y LOS RESULTADOS SE COMPARARAN CON RATAS CONTROLES (WILD TYPE), LOS EXPERIMENTOS EN TOXICOLOGIA CONSISTIRAN EN LA DETECCION, EN CEREBRO DE RATONES, DE MARCADORES DE EXPOSICION A PESTICIDAS Y AL TABACO DE TERCERA GENERACION, NANOSUPERFICIES\DESROBCIÓN-IONIZACIÓN-LASER\PROCESADO IMÁGENES\CÁLCULO MULTIVARIANTE\IMÁGENES DE ESPECTROMETRÍA DE MASAS

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