Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO, FUNDAMENTADO EN LA EXPERIENCIA PREVIA Y POTENCIALIDAD DEL GRUPO INVESTIGADOR, TIENE COMO FINALIDAD EL DESARROLLO DE BIOSENSORES BASADOS EN SONDAS DE ACIDOS NUCLEICOS PARA GENOTIPAR VIRUS RNA Y PARA CARACTERIZAR LA ESTRUCTURA NATIVA DEL RNA GENOMICO VIRAL,LOS BIOSENSORES DE GENOTIPADO PERMITIRAN DISCRIMINAR ENTRE VARIANTES VIRALES QUE UNICAMENTE SE DIFERENCIAN EN UNA MUTACION, SE DESARROLLARAN MICROARRAYS DE DNA ENFOCADOS PRINCIPALMENTE A LA DETECCION DE MUTACIONES EN GENES DEL VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA TIPO 1 (HIV-1) RELACIONADOS CON RESISTENCIA A FARMACOS ANTIVIRALES, EN SEGUNDO LUGAR SE CONSTRUIRAN MICROARRAYS CON OLIGOMEROS DE ACIDO NUCLEICO PEPTIDICO (PNA), UN POLIMERO ARTIFICIAL ANALOGO A LOS ACIDOS NUCLEICOS NATURALES QUE OFRECE IMPORTANTES VENTAJAS COMO SONDA EN BIOSENSORES DE GENOTIPADO, EN TERCER LUGAR SE DESARROLLARAN BIOSENSORES BASADOS EN PNA ALTERNATIVOS A LOS MICROARRAYS, QUE NO REQUIERAN EL MARCAJE DE LA MOLECULA DIANA, EN ESTE CASO, COMO METODOS DE DETECCION DE LA HIBRIDACION PNA-DNA SE UTILIZARA UNO OPTICO (ESPECTROSCOPIA INFRARROJA) Y OTRO MECANICO (MEDIDA DE DEFLEXION DIFERENCIAL DE MICROPALANCAS EN SISTEMAS DE HUMEDAD CONTROLADA), QUE EN EL TRABAJO PREVIO DEL GRUPO HAN DEMOSTRADO GRAN SENSIBILIDAD Y ESPECIFICIDAD, TODOS LOS BIOSENSORES DE GENOTIPADO CONSTRUIDOS SE EVALUARAN POR SU POTENCIALIDAD PARA DETECTAR TANTO LAS VARIANTES GENETICAS MAYORITARIAS COMO LOS GENOMAS MINORITARIOS PRESENTES EN LOS VIRUS ESTUDIADOS,EL DESARROLLO DE BIOSENSORES DE ESTRUCTURA REQUERIRA LA OPTIMIZACION DE LA TECNOLOGIA DE MICROARRAYS DE DNA PARA PERMITIR LA HIBRIDACION DE MOLECULAS DE RNA EN CONDICIONES NATIVAS, CON ELLOS SE ESTUDIARA LA ESTRUCTURA NATIVA DEL RNA DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C (HCV) Y DEL VIRUS DE LA FIEBRE AFTOSA (FMDV), EN CONCRETO SUS EXTREMOS 5¿ ALTAMENTE ESTRUCTURADOS QUE CONTIENEN LOS ELEMENTOS DE ENTRADA INTERNA DEL RIBOSOMA (IRES), LOS MICROARRAYS PROPORCIONARAN INFORMACION SOBRE LA ACCESIBILIDAD DEL RNA NATIVO A LA HIBRIDACION CON LAS SONDAS DE DNA INMOVILIZADAS, SUS RESULTADOS SERAN CORRELACIONADOS CON LOS QUE GENEREMOS MEDIANTE DOS TECNOLOGIAS ALTERNATIVAS Y COMPLEMENTARIAS: LA VISUALIZACION POR MICROSCOPIA DE FUERZA ATOMICA (AFM) DEL RNA ADSORBIDO SOBRE SUPERFICIES, Y LA ACCESIBILIDAD DE LOS NUCLEOTIDOS DEL RNA A REACTIVOS QUIMICOS MODIFICADORES EN DISOLUCION (SHAPE),SE ESPERA QUE LAS TECNOLOGIAS DESARROLLADAS A LO LARGO DE ESTE PROYECTO GENEREN CONOCIMIENTO Y DISPOSITIVOS BIOSENSORES DE UTILIDAD EN DIVERSOS CAMPOS DE LA BIOTECNOLOGIA Y LA VIROLOGIA