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PID2021-123600OR-C41

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COMPARACIONES GENOMICAS, TRANSCRIPTOMICAS Y FENOTIPICAS ENTRE ESPECIES DE XANTHO...

COMPARACIONES GENOMICAS, TRANSCRIPTOMICAS Y FENOTIPICAS ENTRE ESPECIES DE XANTHOMONAS DE HUESPEDES HERBACEOS Y LEÑOSOS DENTRO DE LA ESPECIE DE BACTERIAS XANTHOMONAS ARBORICOLA EXISTEN PATOVARES QUE INFECTAN DE FORMA ESPECIFICA PRUNUS SPP. (PV. PRUNI), NOGAL (PV. JUGLANDIS) Y AVELLANO (PV. CORYLINA); POR OTRO LADO, EL TOMATE Y EL PIMIENTO PUEDEN V... ver más

01/01/2021

CSIC

218K€

Presupuesto del proyecto: 218K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 218K€

Descripción del proyecto DENTRO DE LA ESPECIE DE BACTERIAS XANTHOMONAS ARBORICOLA EXISTEN PATOVARES QUE INFECTAN DE FORMA ESPECIFICA PRUNUS SPP. (PV. PRUNI), NOGAL (PV. JUGLANDIS) Y AVELLANO (PV. CORYLINA); POR OTRO LADO, EL TOMATE Y EL PIMIENTO PUEDEN VERSE AFECTADOS POR TRES ESPECIES DE ESTE MISMO GENERO, X. VESICATORIA, X. EUVESICATORIA Y X. HORTORUM. SE TRATA DE MODELOS DE XANTHOMONADS QUE SIENDO TAXONOMICAMENTE MUY PROXIMAS POSEEN PEQUEÑAS DIFERENCIAS QUE LAS HACEN DIVERGIR EN CUANTO AL HUESPED (X. ARBORICOLA); O BACTERIAS QUE PRESENTANDO MAYORES DIFERENCIAS EN CUANTO A SU GENOMA (XANTHOMONADS DE TOMATE/PIMIENTO) CONVERGEN EN UN MISMO HUESPED. ADEMAS, EN EL PRIMER CASO SON BACTERIAS NO SISTEMICAS EN LA PLANTA, NO TRASMISIBLES POR SEMILLAS, QUE INFECTAN PLANTAS LEÑOSAS; EN EL SEGUNDO CASO, SE TRATA DE BACTERIAS QUE INFECTAN HUESPEDES HERBACEOS SISTEMICAMENTE Y QUE SE TRANSMITEN POR SEMILLAS. EL SUBPROYECTO VA DIRIGIDO A DETERMINAR LAS DIFERENCIAS Y SIMILITUDES ENTRE LAS XANTHOMONAS DESCRITAS PARA DETERMINAR CUALES SON LOS MECANISMOS QUE RIGEN SUS MODOS DE ACCION EN LOS PROCESOS INFECTIVOS, PORQUE SOLO CON UN CONOCIMIENTO MAS PROFUNDO DE LAS RELACIONES PLANTA/PATOGENO SERA POSIBLE EL DESARROLLO DE NUEVOS METODOS DE CONTROL. PRIMERO SE REALIZARA UN ANALISIS DE GENOMICA COMPARATIVA, PARA LO CUAL SE OBTENDRAN SECUENCIAS DE ALTA CALIDAD DE GENOMAS DE CEPAS DE XANTHOMONADS QUE INFECTAN TOMATE Y PIMIENTO EN ESPAÑA, QUE SE SELECCIONARAN EN UN ESTUDIO PRELIMINAR, Y QUE SERAN COMPARADOS CON LOS GENOMAS DE LOS PATOVARES DE X. ARBORICOLA OBTENIDOS EN UN PROYECTO PREVIO. DE LOS RESULTADOS DE ESTE ANALISIS SE PODRAN DETERMINAR DE FORMA SUCINTA LOS GENES QUE DIFERENCIAN LAS XANTHOMONADS DE TOMATE/PIMIENTO DE LAS DE LOS PATOVARES DE X. ARBORICOLA DE ESPECIES LEÑOSAS. A CONTINUACION, SE REALIZARAN ESTUDIOS DE TRANSCRIPTOMICA PARA EVALUAR LAS DIFERENCIAS DE EXPRESION GENICA DE LOS DOS GRUPOS DE BACTERIAS EN DIFERENTES CONDICIONES, CUANDO ESTAN EN EL APOPLASTO O CUANDO SON INOCULADAS EN PLANTA Y SEMILLA DE HUESPED Y NO HUESPED. LOS ANALISIS DE GENOMICA Y TRANSCRIPTOMICA SERAN COMPLEMENTADOS POR ESTUDIOS FENOTIPICOS DONDE SE EVALUARAN ASPECTOS COMO LA COLONIZACION DE LAS BACTERIAS, LA FORMACION DE BIOPELICULAS Y LA MOTILIDAD BACTERIANA EN HUESPED O NO HUESPED. LOS RESULTADOS OBTENIDOS DE ESTOS ESTUDIOS ADEMAS DE SEÑALAR LOS MECANISMOS QUE RIGEN ESTAS INFECCIONES, AYUDARAN A LA SELECCION DE DIANAS ESPECIFICAS PARA LOS METODOS DE DETECCION DESARROLLADOS EN EL SUBPROYECTO 2 CON EL QUE SE COLABORARA INTENSAMENTE. CABE DESTACAR QUE EL SUBPROYECTO NO SOLO TRABAJARA EN PLANTA, SINO QUE PROFUNDIZARA EN LOS ESTUDIOS EN SEMILLA, POR EL INTERES QUE TIENEN PARA LA AGRICULTURA ESPAÑOLA ESTAS ENFERMEDADES EN TOMATE Y PIMIENTO, DONDE ESTA TRANSMISION SE PRODUCE. FINALMENTE, EL GRUPO RESPONSABLE DE ESTE SUBPROYECTO PARTICIPARA EN ACTIVIDADES RELACIONADAS CON LA BACTERIA Y SU RESPUESTA A LOS TRATAMIENTOS DE CONTROL EVALUADOS Y DESARROLLADOS POR LOS DIFERENTES SUBPROYECTOS QUE CONFORMAN LA PROPUESTA. ANTHOMONAS\INDUCCION DEFENSA\AVELLANO\NOGAL\PRUNUS\PIMIENTO\TOMATE\INTERACCION PLANTA/PATOGENO\BIOCONTROL

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