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SPACE4AMPS

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Chemical Space for Antimicrobials on a Peptide Basis

Multidrug resistant (MDR) bacteria represent a global public health threat against which new drugs are urgently needed. Antimicrobial peptides (AMPs), mostly derived from naturally occurring linear or cyclic peptides, can contribu... ver más

31/12/2025

UNIVERSITAET BERN

2M€

Presupuesto del proyecto: 2M€

Líder del proyecto

UNIVERSITAET BERN No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 2 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2020-05-27

ERC-2019-ADG: ERC Advanced Grant

I+D

Cerrada hace 5 años

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Información adicional privada

No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

2 Participantes

UNIVERSITAET BERN

2.50M€ | Lider

SMB SYSTEMS

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Duración del proyecto: 67 meses Fecha Inicio: 2020-05-27
Fecha Fin: 2025-12-31

Líder del proyecto

UNIVERSITAET BERN No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 2M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Multidrug resistant (MDR) bacteria represent a global public health threat against which new drugs are urgently needed. Antimicrobial peptides (AMPs), mostly derived from naturally occurring linear or cyclic peptides, can contribute to solving the problem. AMPs are already in clinical use, do not easily lead to resistance, and can rely on a strong manufacturing sector and established protocols for clinical development. However, most AMPs are degraded by proteases and have poor pharmacokinetics. SPACE4AMPS aims to identify new AMPs with diverse peptide chain topologies and building blocks and with the following characteristics: i) Broad activity spectrum, ii) High activity, iii) Low probability for induced resistance, iv) Low proteolysis, v) Better pharmacokinetics. To reach its goal SPACE4AMPS will create computational tools to explore the extremely vast chemical space of large molecules such as peptides and natural products, which now lies within reach of the latest computer hardware developments. To better understand antimicrobial drugs, we will design a molecular fingerprint relating antimicrobial activity to molecular structure and use it to draw a tree-map of the antimicrobial chemical space. We will enrich this map with new compounds from generative models using neural networks. To identify new AMPs, we will use a genetic algorithm carrying out cycles of molecule generation and similarity calculations to select cyclic peptides and peptide dendrimers including lipidated, peptoid (N-alkyl glycines) and N-methylated residues, synthesize and test these molecules against MDR bacteria, fungi and parasites, screen actives for toxicity, and study their structure and mode of action. By its ground-breaking and unprecedented computational/synthetic/biological approach, SPACE4AMPS can help solve the antibiotics crisis, revolutionize knowledge on antimicrobial compounds, and create new methods enabling computer-aided drug discovery for large molecules.

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