Descripción del proyecto
LA RAZA PORCINA IBERICA ES EL TIPO RACIAL MAS IMPORTANTE DE CERDO MEDITERRANEO, TANTO EN TAMAÑO DE POBLACION COMO EN IMPORTANCIA ECONOMICA. EN LA NORMA DE CALIDAD DE SU CARNE Y PRODUCTOS ELABORADOS SE DIFERENCIAN DOS TIPOS DE PRODUCCION DE ACUERDO CON SU ORIGEN RACIAL: CERDOS 100% IBERICOS Y CRUZADOS CON DUROC, SIENDO OBLIGADO EL EMPLEO DE MADRES IBERICAS. MAYORITARIAMENTE, LOS PRIMEROS SE ENGORDAN EN EL SISTEMA EXTENSIVO DE MONTANERA (SOLO 5% DEL TOTAL EN 2014) Y LOS SEGUNDOS MEDIANTE CEBO CON PIENSO (69% DEL TOTAL EN 2014). LA EFICIENCIA ALIMENTARIA DURANTE EL ENGORDE Y LOS CARACTERES REPRODUCTIVOS DE LAS LINEAS IBERICAS MATERNAS SON DOS DE LOS CARACTERES DE MAYOR IMPORTANCIA POR SU INFLUENCIA EN LOS COSTES DE PRODUCCION. LA EFICIENCIA ALIMENTARIA RESIDUAL (RFI) ES UNA MEDIDA DE LA EFICIENCIA ALIMENTARIA QUE SE CALCULA COMO LA DIFERENCIA ENTRE EL ALIMENTO CONSUMIDO Y EL CONSUMO PREDICHO SEGUN LOS REQUERIMIENTOS DE PRODUCCION Y MANTENIMIENTO. SE SABE POCO ACERCA DE LAS CAUSAS DE LA VARIACION EN RFI PORQUE UN AUMENTO EN LA EFICIENCIA ALIMENTARIA PODRIA DEBERSE A MUCHOS PROCESOS METABOLICOS DIFERENTES. EL CONOCIMIENTO ES AUN MAS DEFICIENTE A PESOS DE SACRIFICIO ELEVADOS. EN EL OBJETIVO 1 DEL PROYECTO, SE INVESTIGA LA BASE MOLECULAR DE LA EFICIENCIA ALIMENTARIA RESIDUAL EN ANIMALES CRUZADOS DE DUROC X IBERICO SACRIFICADOS A 150 KG. SE UTILIZARAN UN TOTAL DE 224 CERDOS Y EL NUEVO CHIP DE GENOTIPADO AFFYMETRIX 600K PARA BUSCAR MEDIANTE GWAS LAS REGIONES CROMOSOMICAS ASOCIADAS A ESTE CARACTER. ASIMISMO SE INVESTIGARA LA RELACION ENTRE RFI CON LA CALIDAD DE CARNE Y CARACTERES RELATIVOS A ROBUSTEZ Y BIENESTAR. SE INTENTARAN IDENTIFICAR LAS MUTACIONES CAUSALES PARA RFI ESTABLECIENDO UN MAPA MAS FINO DE DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO DE LAS REGIONES DETECTADAS, MEDIANTE EL GENOTIPADO POR OPEN ARRAY DE SNPS ADICIONALES IDENTIFICADOS A PARTIR DE SECUENCIAS GENOMICAS (20X) DE CERDOS IBERICOS Y DUROC YA DISPONIBLES. EN EL OBJETIVO 2, SE REALIZARA LA SECUENCIACION DE 300 REPRODUCTORES DE LA ESTIRPE IBERICA TORBISCAL. SE DESARROLLARAN METODOS BASADOS EN INFORMACION DE PARIENTES PARA UTILIZAR EFICIENTEMENTE LA SECUENCIACION A BAJA COBERTURA (4X), INFIRIENDO LOS SEGMENTOS PERDIDOS. LOS NUEVOS METODOS ESTADISTICOS COMBINARAN LA INFORMACION GENEALOGICA CON LAS TECNICAS DE SECUENCIACION NGS, PERMITIENDO LA OBTENCION DE SECUENCIAS GENOMICAS UTILES DE UN GRAN NUMERO DE ANIMALES A BAJO COSTE. A PARTIR DE ESTAS SECUENCIAS SE INVESTIGARA MEDIANTE GWAS LA BASE MOLECULAR DE CARACTERES REPRODUCTIVOS, PARA LO QUE SE DESARROLLARAN NUEVOS METODOS ESTADISTICOS (OBJETIVO 3). LA SINGULARIDAD GENETICA DEL CERDO IBERICO, QUE NO PRESENTA INTROGRESION DE ALELOS ASIATICOS, OFRECE UNA OPORTUNIDAD UNICA PARA IDENTIFICAR NUEVOS POLIMORFISMOS ASOCIADOS CON EL TAMAÑO DE CAMADA. LOGRAR LOS OBJETIVOS 1 A 3 GENERARA UNA GRAN CANTIDAD DE INFORMACION (SECUENCIAS Y FENOTIPOS) QUE SERAN USADOS EN EL OBJETIVO 4 PARA CONSTRUIR UN REPOSITORIO DE SECUENCIAS DE DNA Y FENOTIPOS QUE SE HARA PUBLICO A LA COMUNIDAD CIENTIFICA. ERDO IBERICO\GENÉTICA MOLECULAR\GWAS\SNP\SEQUENCIACIÓN\TAMAÑO DE CAMADA\REPRODUCCIÓN\EFICIENCIA ALIMENTARIA