Descripción del proyecto
LA DEGRADACION DE LOS SUELOS POR LA COEXISTENCIA DE DIVERSOS ESTRESES ABIOTICOS ES UNO DE LOS FACTORES MAS LIMITANTES DE LA PRODUCTIVIDAD EN SISTEMAS AGRICOLAS MEDITERRANEOS, EL MANEJO INTEGRADO DE LAS PLANTAS Y DE LA MICROBIOTA ASOCIADA A SUS RAICES ES UNA ALTERNATIVA RECONOCIDA AL SIMPLE DESARROLLO DE CULTIVARES TOLERANTES A ESTRES PARA INCREMENTAR LA PRODUCCION DE COSECHA EN CONDICIONES MEDIOAMBIENTALES SUBOPTIMAS, EN ESTE SENTIDO, LA SIMBIOSIS FIJADORA DE NITROGENO RHIZOBIA-LEGUMINOSA ES UN MODELO DE REFERENCIA PARA EL ESTUDIO DE ASPECTOS FUNDAMENTALES Y APLICADOS DE LAS INTERACCIONES BENEFICIOSAS PLANTA-MICROORGANISMO POR SU IMPORTANCIA EN LA PRACTICA AGRICOLA SOSTENIBLE Y EN LA PROTECCION DEL MEDIOAMBIENTE, ES AMPLIAMENTE RECONOCIDO QUE LAS FUNCIONES QUE CONTRIBUYEN A LA ADAPTACION DE LOS RHIZOBIA A CONDICIONES SEVERAS MEJORAN EN ULTIMO TERMINO EL RENDIMIENTO GLOBAL DE LA INTERACCION SIMBIOTICA EN TALES CONDICIONES,UTILIZANDO TECNOLOGIA POST-GENOMICA PARA EL ESTUDIO DE LA CEPA DE REFERENCIA SINORHIZOBIUM MELILOTI RM1021 (SIMBIONTE DE LA LEGUMINOSA FORRAJERA ALFALFA) Y DE UNA COLECCION DE AISLADOS ADAPTADOS DE FORMA NATURAL A UN ECOSISTEMA DEGRADADO (REGION DEL MAR DE ARAL), NOSOTROS HEMOS IDENTIFICADO PREVIAMENTE UNA SERIE DE GENES ESTRUCTURALES Y REGULADORES IMPLICADOS EN LA ADAPTACION DEL MICROSIMBIONTE Y LA EFICIENCIA DE LA SIMBIOSIS BAJO ESTRES ABIOTICO, EN ESTE PROYECTO, SE INVESTIGARA EN PROFUNDIDAD LA FUNCION DE DOS GRUPOS DE REGULADORES DE RESPUESTA A ESTRES PREVIAMENTE IDENTIFICADOS; FACTORES DE TRANSCRIPCION (TFS) Y RNAS NO CODIFICANTES (SRNAS), CODIFICADOS EN LAS PORCIONES ADQUIRIDA Y COMPARTIDA, RESPECTIVAMENTE, DEL GENOMA DE S, MELILOTI,EL OBJETIVO GENERAL DEL PROYECTO SERA DISECCIONAR LAS CASCADAS DE SEÑALIZACION MEDIADAS POR TFS Y SRNAS QUE CONTROLAN LAS RESPUESTAS FISIOLOGICAS DEL MICROSIMBIONTE AL ESTRES ABIOTICO Y SUS MECANISMOS DE REGULACION ASOCIADOS ASI COMO EVALUAR EL IMPACTO DE LOS TFS Y LOS SRNAS EN LA EFICIENCIA DE SIMBIOSIS ESTABLECIDAS EN CONDICIONES MEDIOAMBIENTALES SUBOPTIMAS, OBJETIVOS ESPECIFICOS DEL PROYECTO SERAN: I) IDENTIFICACION DE LA PORCION DEL GENOMA COMPARTIDA POR EL AISLADO AK21 RESISTENTE A ESTRES Y LA CEPA MODELO DE REFERENCIA RM1021 ASI COMO LOS FENOTIPOS DE ADAPTACION ASOCIADOS AL CONJUNTO DE GENES ESPECIFICO DE AK21, II) CARACTERIZACION IN SILICO DE LOS TFS CODIFICADOS POR LA PORCION ACCESORIA DEL GENOMA DE S, MELILOTI, III) ESTUDIO DE LA CONTRIBUCION DE LOS TFS Y SRNAS SELECCIONADOS AL RENDIMIENTO ECOLOGICO DE S, MELILOTI EN ESTRES ABIOTICO, UTILIZANDO CARACTERIZACION FENOTIPICA DE ALTO RENDIMIENTO DE LOS CORRESPONDIENTES MUTANTES Y UN AMPLIO ESPECTRO DE ENSAYOS SIMBIOTICOS, IV) CARACTERIZACION DE COMPLEJOS SRNA-PROTEINA (SRNPS) Y DETERMINACION DE SUS PATRONES DE ACUMULACION INTRACELULAR TANTO EN BACTERIAS EN VIDA LIBRE COMO SIMBIOTICAS, V) IDENTIFICACION DE LOS ELEMENTOS GENETICOS ANTERIORES Y POSTERIORES A LOS TFS Y SRNAS EN LAS CASCADAS DE SEÑALIZACION MEDIADAS POR ESTOS Y MAS CONCRETAMENTE LOS MRNAS DIANA DE LOS RIBORREGULADORES EN ESTUDIO, Y VI) ESTABLECIMIENTO DE MODELOS DE CIRCUITOS REGULADORES EN S, MELILOTI QUE INTEGREN FUNCIONES DE ADAPTACION ADQUIRIDAS (UNICAS DE DETERMINADAS CEPAS) Y COMPARTIDAS (COMUNES A TODAS LAS CEPAS DE LA ESPECIE), LEGUMINOSAS\SIMBIOSIS\FIJACION DE NITROGENO\ESTRES ABIOTICO\RHIZOBIA\FACTORES DE TRANSCRIPCION\SRNAS\GENOMICA FUNCIONAL