Descripción del proyecto
EL PROCESO DE TRADUCCION MEDIADO POR EL RIBOSOMA SE BASA EN EL CODIGO GENETICO, CODIGO POR EL CUAL CADA TRIPLETE DE NUCLEOTIDOS SE LEE SIEMPRE DE LA MISMA MANERA DURANTE TODO EL CICLO DE LA SINTESIS DE PROTEINAS, EN GENERAL, SE PRODUCEN POCOS ERRORES, SIENDO LA FIDELIDAD DEL PROCESO MUY ALTA, SORPRENDENTEMENTE, SIN EMBARGO, HAY OCASIONES EN LAS QUE SECUENCIAS DEFINIDAS EN EL PROPIO ARNM Y OTROSFACTORES QUE ACTUAN EN TRANS ESTIMULAN AL RIBOSOMA PARA IGNORAR ESTE CODIGO, ESTOS MECANISMOS DE RECODIFICACION SON UTILIZADOS POR MULTIPLES ORGANISMOS TANTO PARA AMPLIAR LA CAPACIDAD DE CODIFICACION DE LOS GENOMAS, COMO PARA DIVERSIFICAR LOS MECANISMOS DE REGULACION DE EXPRESION GENICA A NIVEL POST-TRANSCRIPCIONAL,LA PRESENTE PROPUESTA CONSISTE EN LA CARACTERIZACION ESTRUCTURAL, MEDIANTE CRIO-ME Y EL PROCESAMIENTO DE IMAGENES, DE ESTE TIPO DE MECANISMOS DE RECODIFICACION, ES DECIR, DE LA REPROGRAMACION DE LA TRADUCCION DE ARNM POR REGLAS DE LECTURA NO ESTANDARIZADAS, TENIENDO EN CUENTA QUE MULTIPLES TRASTORNOS GENETICOS HEREDITARIOS Y MUCHAS FORMAS DE CANCER SON CAUSADOS POR LA TERMINACION PREMATURA DE LA SINTESIS DE PROTEINAS, LA RELEVANCIA DEL PROYECTO QUEDA MANIFIESTA, EN ESTE SENTIDO, SE DEBEN HACER GRANDES ESFUERZOS PARA DESCUBRIR Y DESARROLLAR TERAPIAS DE SUPRESION, DE FORMA QUE SE PUEDAN RECODIFICAR CODONES DE PARADA PREMATUROS Y PERMITIR LA PRODUCCION DE LAS PROTEINAS COMPLETAS, EN CONCRETO, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS CARACTERIZAR UNO DE ESTOS PROCESOS DE RECODIFICACION, DEL TIPO DENOMINADO HOPPING O BYPASSING QUE ACONTECE DURANTE LA TRADUCCION DE LA PROTEINA DE FUSION GP60 DEL FAGO T4, LA CUAL PRESENTA DOS MARCOS DE LECTURA SEPARADOS, HEMOS SELECCIONADO ESTE CASO EN PARTICULAR PORQUE REPRESENTA UN SISTEMA MODELO IDEAL PARA EL ESTUDIO DE COMO LAS SEÑALES DE RECODIFICACION REPROGRAMAN LOS RIBOSOMAS, DICHO PROCESO SE INICIA EN EL CODON ADYACENTE A UN CODON DE TERMINACION Y CONSISTE EN LA DISOCIACION DE LAS INTERACCIONES ENTRE CODON Y ANTICODON EN EL SITIO P, SEGUIDO DE UN SALTO DE UN FRAGMENTO DEL ARNM (50 NUCLEOTIDOS) QUE ES IGNORADO, Y EL POSTERIOR RESTABLECIMIENTO DE LAS INTERACCIONES EN EL SITIO P, ANALIZANDO COMO EL RIBOSOMA ES CAPAZ DE IGNORAR ESTA SECUENCIA, QUEREMOS ELUCIDAR COMO Y POR QUE SE PUEDE ANULAR LA CO-LINEALIDAD REGULAR DEL ARNM Y LAS SECUENCIAS DE PROTEINAS, POR LO TANTO, LA CONTRIBUCION ESPERADA DEL PROYECTO SE CENTRA EN EL MECANISMO POR EL CUAL LOS ARNT PERMANECEN COLOCADOS CORRECTAMENTE EN EL RIBOSOMA Y PERMITEN MANTENER FIELMENTE EL MARCO DE LECTURA DE TRADUCCION, EL TRABAJO PROPORCIONARA INFORMACION ACERCA DE LOS FACTORES CIS Y TRANS QUE MODULAN EL PROCESO DE BYPASSING Y QUE PODRIAN SER COMUNES A OTROS EVENTOS DE RECODIFICACION, EN DEFINITIVA, QUEREMOS ESTUDIAR FENOMENOS DE RECODIFICACION PARA DETERMINAR DONDE SE PRODUCEN, COMPRENDER SU SIGNIFICADO FUNCIONAL, DILUCIDAR LOS EVENTOS DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR IMPLICADOS, Y SI ES DESEABLE Y POSIBLE, DISEÑAR ESTRATEGIAS DE INTERVENCION A TRAVES DE TERAPIAS DE SUPRESION, RIBOSOMA\CRIO-ME\ESTRUCTURA\RECODIFICACIÓN\TRADUCCIÓN\RECONOCIMIENTO MOLECULAR.