Descripción del proyecto
LAS MOLECULAS DE ARN NO SON SIMPLES INTERMEDIARIOS ENTRE EL ADN Y LAS PROTEINAS; SON MOLECULAS FUNCIONALES QUE JUEGAN PAPELES ESENCIALES EN MULTIPLES PROCESOS BIOLOGICOS, PARA REALIZAR SUS FUNCIONES, LAS MOLECULAS DE ARN DEBEN SER REGULADAS CON GRAN DETALLE EN EL ESPACIO Y TIEMPO, Y SEGUN LAS SEÑALES CELULARES DEL MOMENTO, LAS MODIFICACIONES DE ARN EXPANDEN EL LENGUAJE DEL ARN, ACTUANDO COMO UNA CAPA DE REGULACION DEL ARN, CONSTITUYENDO UNA PLATAFORMA VERSATIL CAPAZ DE MODIFICAR LA FUNCION DE LAS MOLECULAS DE ARN CON GRAN RESOLUCION, ESTAS MODIFICACIONES, TIPICAMENTE PRESENTES EN FORMA DE METILACIONES, PUEDEN SER DINAMICAS Y REVERSIBLES, IMPACTANDO EL PROCESAMIENTO, ESTABILIDAD, TRADUCCION Y LOCALIZACION DEL ARN, LA CRECIENTE IMPORTANCIA QUE SE HA OTORGADO EN ESTOS ULTIMOS AÑOS A ESTA CAPA REGULATORIA HA DADO LUGAR A LA CREACION DE UN NUEVO CAMPO DE INVESTIGACION: LA EPITRANSCRIPTOMICA,A TRAVES DEL ACOPLAMIENTO DE LA IMMUNOPRECIPITACION MEDIADA POR ANTICUERPOS ESPECIFICOS CONTRA MODIFICACIONES DE ARN JUNTO CON LA SECUENCIACION DE SEGUNDA GENERACION, SE HAN PODIDO OBTENER MAPAS TRANSCRIPTOMICOS PARA VARIAS MODIFICACIONES DE ARN COMO, POR EJEMPLO, LA N6-METILADENOSINA (M6A), QUE ES LA MODIFICACION MAS ABUNDANTE EN LOS ARN MENSAJEROS, SIN EMBARGO, LA FALTA DE METODOS PARA DETECTAR Y MAPEAR MUCHAS MODIFICACIONES DE RNA IMPIDE QUE AVANCE RAPIDAMENTE EL CONOCIMIENTO Y COMPRENSION DE LAS FUNCIONES DE ESTA IMPORTANTE CAPA REGULADORA, ESTE ES EL CASO DE LA 3-METILCITOSINA (M3C), QUE SE SABE QUE DESEMPEÑA UNA FUNCION ESENCIAL EN LA DIFERENCIACION CELULAR, Y QUE ESTA PRESENTE EN LAS MOLECULAS DE ARN MENSAJERO, PERO CUYA FUNCION TODAVIA ESTA POR DESCUBRIR, DEBIDO A LA FALTA DE METODOLOGIAS PARA SU MAPEO, PARA DESCUBRIR EL PAPEL DE LA 3-METILCITOSINA EN ARN MENSAJEROS Y EN LA DIFERENCIACION CELULAR, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS DESARROLLAR UNA NUEVA METODOLOGIA PARA PRODUCIR MAPAS TRANSCRIPTOMICOS DE M3C EN ARN MENSAJEROS, NUESTRO METODO ESTA BASADO EN LA COMBINACION DE DOS ESTRATEGIAS: I) IMMUNOPRECIPITACION DEL ARN USANDO UN ANTICUERPO CONTRA M3C EN ADN, EL CUAL TIENE REACTIVIDAD CRUZADA CON LAS MODIFICACIONES DE M3C EN EL ARN; Y II) DETECCION BIOINFORMATICA DE MODIFICACIONES M3C USANDO PATRONES DE ERRORES NO ALEATORIOS, QUE SERVIRAN PARA VALIDAR LAS REGIONES TRANSCRIPTOMICAS PREDICHAS USANDO LA ESTRATEGIA DE IMMUNOPRECIPITACION, DE LA MISMA FORMA QUE LA DISPONIBILIDAD DE MAPAS TRANSCRIPTOMICOS PARA LAS MODIFICACIONES M6A HAN REVOLUCIONADO COMPLETAMENTE NUESTRA VISION Y CONOCIMIENTO DEL EPITRANSCRIPTOMA, CON ESTE PROYECTO PRETENDEMOS QUE LA DISPONIBILIDAD DE MAPAS TRANSCRIPTOMICOS DE 3-METILCITOSINA REVOLUCIONE NUESTRA COMPRENSION DE ESTA MODIFICACION, TANTO A NIVEL MOLECULAR COMO CELULAR, REVELANDO MECANISMOS MEDIANTE LOS CUALES ESTAS MODIFICACIONES DESENCADENAN LA DIFERENCIACION DE CELULAS MESENQUIMATICAS, MODIFICACIONES DE ARN\EPITRANSCRIPTOMA\3-METILCITOSINA\IMMUNOPRECIPITACIÓN\BIOINFORMÁTICA\MÉTODOS DE DETECCIÓN