Descripción del proyecto
LAS MODIFICACIONES DE RNA SON ELEMENTOS CLAVE EN LA REGULACION CELULAR, QUE TIENEN UN GRAN IMPACTO EN EL PROCESAMIENTO DE ARN, SU ESTABILIDAD, TRADUCCION Y LOCALIZACION, Y QUE PUEDEN AFECTAR DECISIONES VITALES TANTO A NIVEL DE CELULA COMO DE ORGANISMO, TALES COMO LA DIFERENCIACION CELULAR O LA DETERMINACION DEL SEXO. MUTACIONES EN UNA GRAN MAYORIA DE GENES DE MODIFICACION DE RNA ESTAN ASOCIADOS A DIVERSAS ENFERMEDADES HUMANAS, CON UNA SOBRERREPRESENTACION DE ENFERMEDADES NEUROLOGICAS. A PESAR DE QUE LA ASOCIACION ENTRE LA DESREGULACION DE LA MAQUINARIA DE MODIFICACION DEL ARN Y LA DISFUNCION NEUROLOGICA ESTA BIEN DOCUMENTADA, TODAVIA NO SE COMPRENDE COMO DICHA DESREGULACION PUEDE CAUSAR ESTAS ENFERMEDADES. PARA RESPONDER ESTA PREGUNTA, NECESITAMOS CON URGENCIA MAPAS TRANSCRIPTOMICOS DE LAS DIVERSAS MODIFICACIONES DE ARN DE FORMA SISTEMATICA. EN ESTE PROYECTO, PROPONGO MAPEAR LAS POBLACIONES DE ARNT Y ARNM Y CARACTERIZAR SU DINAMICA EN LOS PROCESOS DE DIFERENCIACION Y ACTIVACION NEURONAL, USANDO PARA ELLO LA TECNOLOGIA DE SECUENCIACION DE ARN DIRECTO POR NANOPOROS, PARA PODER CARACTERIZAR DE FORMA SIMULTANEA LA DINAMICA TANTO DE LAS ABUNDANCIAS DE ARNT Y ARNM COMO DE SUS MODIFICACIONES, CON UNA RESOLUCION DE NUCLEOTIDO Y MOLECULA. CONCRETAMENTE, PRODUCIREMOS LOS PRIMEROS MAPAS DE SECUENCIACION DE ARN NATIVO EN: (I) DIVERSOS TIPOS CELULARES PRESENTES EN EL CEREBRO (CELULAS NEURONALES Y NO NEURONALES), (II) DIVERSOS ESTADOS DE ACTIVACION NEURONAL; (III) DIFERENTES BIOTIPOS DE ARN (ARNT Y ARNM), Y (IV) EN ARNS CON DIFERENTE LOCALIZACION SUBCELULAR (SOMA/DENDRITAS). USANDO ESTA APROXIMACION SISTEMATICA, ESPERAMOS REVELAR CUALES SON LAS MODIFICACIONES DE ARN QUE ESTAN SIGNIFICATIVAMENTE ENRIQUECIDAS EN LOS DISTINTOS TIPOS DE CELULAS NEURONALES Y CONDICIONES, PARA PODER ASI GUIAR FUTURA INVESTIGACION QUE CARACTERICE EL PAPEL QUE JUEGAN LAS MODIFICACIONES DE ARN EN DIVERSAS ENFERMEDADES NEUROLOGICAS. ECUENCIACION DE NANOPOROS\EPITRANSCRIPTOMA\ACTIVACION NEURONAL\EFICIENCIA DE TRADUCCION\NEURONA\ARN DE TRANSFERENCIA\MODIFICACIONES DE ARN