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AGL2017-88702-C2-2-R

Financiado

CARACTERIZACION BIOINFORMATICA DE LA FORMACION DE TRICOMAS Y LA RESISTENCIA A PL...

CARACTERIZACION BIOINFORMATICA DE LA FORMACION DE TRICOMAS Y LA RESISTENCIA A PLAGAS EN TOMATE: EPIGENOMICA Y EPITRANCRIPTOMICA EL PROYECTO SE BASA EN RESULTADOS PREVIOS OBTENIDOS EN UN PROYECTO COORDINADO EN VIGOR ENTRE LOS GRUPOS SOLICITANTES Y RESPONDE A UNO DE LOS RETOS PARA LA SOCIEDAD RECOGIDOS EN EL PLAN ESTATAL I+D+I, EL TOMATE (SOLANUM LYCOPERSICU... ver más

01/01/2017

UGR

115K€

Presupuesto del proyecto: 115K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 5507

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01

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Participantes

UGR

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA

Total investigadores 5507

Presupuesto del proyecto 115K€

Descripción del proyecto EL PROYECTO SE BASA EN RESULTADOS PREVIOS OBTENIDOS EN UN PROYECTO COORDINADO EN VIGOR ENTRE LOS GRUPOS SOLICITANTES Y RESPONDE A UNO DE LOS RETOS PARA LA SOCIEDAD RECOGIDOS EN EL PLAN ESTATAL I+D+I, EL TOMATE (SOLANUM LYCOPERSICUM L,) ES UNA HORTICOLA DE GRAN IMPORTANCIA SOCIO-ECONOMICA, FORMANDO PARTE DE LA DIETA MEDITERRANEA, SU MEJORA GENETICA SE BASA EN UN AMPLIO CONOCIMIENTO AGRONOMICO Y GENETICO, SI BIEN SE CONSIDERA QUE ES TOLERANTE A ESTRESES ABIOTICOS, LA ESPECIE CULTIVADA ES SUSCEPTIBLE A PLAGAS DEBIDO A LA DISMINUCION DE VARIABILIDAD GENETICA POR LA DOMESTICACION, POR ELLO, PARA INTRODUCIR CARACTERES DE RESISTENCIA EN LOS CULTIVARES SUSCEPTIBLES ES NECESARIO RECURRIR A ESPECIES SILVESTRES EMPARENTADAS, EN ESTE PROYECTO QUEREMOS CONOCER POR QUE UNAS PLANTAS SON MAS RESISTENTES A LAS PLAGAS INTERPONIENDO BARRERAS FISICAS Y QUIMICAS, COMO SON LOS TRICOMAS Y LOS EXUDADOS QUE ESTOS PRODUCEN, PROPONEMOS ESTUDIAR ESPECIES SILVESTRES Y PLANTAS MUTANTES DE LA ESPECIE CULTIVADA CON MAS TRICOMAS, EN ESTRECHA COLABORACION CON EL GRUPO DE LA UAL, ANALIZAREMOS LOS CAMBIOS QUE OCURREN EN EL GENOMA, EL EPIGENOMA Y EL EPITRANSCRIPTOMA PARA ENTENDER SU RESISTENCIA A LAS PLAGAS DE LA ARAÑA ROJA Y EL ESCARABAJO DE LA PATATA, MEDIANTE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS DE DESARROLLO PROPIO, Y QUE HEMOS ADAPTADO A LA INVESTIGACION EN GENOMICA DE TOMATE DURANTE EL ACTUAL PROYECTO EN VIGOR, ABORDAREMOS LOS SIGUIENTES OBJETIVOS: 1) ELABORACION DE MAPAS DE METILACION DE ALTA RESOLUCION, RELACIONANDOLOS CON LA DENSIDAD DE TRICOMAS; 2) IDENTIFICACION DE REGIONES DIFERENCIALMENTE METILADAS (RMDS), DE CITOSINAS DIFERENCIALMENTE METILADAS (DMCS) Y DE MICRORNAS QUE PODAMOS ENSAYAR COMO (EPI) BIOMARCADORES POTENCIALES DE LA RESISTENCIA A AMBAS PLAGAS; 3) ANALISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE TO-937, UNA ACCESION DE S, PIMPINELLIFOLIUM UTILIZADA COMO DONADORA DE CARACTERES DE CALIDAD DEL FRUTO Y DE RESISTENCIA A PLAGAS COMO LA ARAÑA ROJA; 4) ALTERACIONES EN EL EPIGENOMA Y TRANSCRIPTOMA DE LOS MUTANTES HAIRPLUS, QUE TIENEN UNA ALTA DENSIDAD DE TRICOMAS Y CUYO GEN RESPONSABLE HA SIDO CLONADO POR EL GRUPO DE LA UAL; Y 5) ANALISIS DEL EPITRANSCRIPTOMA DE LOS MUTANTES HAIRPLUS, UN OBJETIVO AMBICIOSO Y NOVEDOSO, PUESTO QUE EN EL MISMO QUEREMOS CARACTERIZAR LAS MODIFICACIONES QUE OCURREN EN LOS TRANSCRITOS DE LAS PLANTAS HAIRPLUS USANDO LA TECNOLOGIA DE SECUENCIACION POR NANOPORO, EL GRUPO DE LA UAL OBTENDRA LAS MUESTRAS CONTROL Y PROBLEMA, MIENTRAS QUE NUESTRO GRUPO DE LA UGR-UMA REALIZARA LOS ANALISIS PERTINENTES, TODOS ESTOS ANALISIS REQUERIRAN SEGUIR MEJORANDO Y ADAPTANDO PARA TOMATE TANTO EL SOFTWARE COMO LAS BASES DE DATOS QUE HEMOS DESARROLLADO EN EL PROYECTO EN VIGOR: NGSMETHDB, METHFLOW, SRNABENCH, ASI COMO DESARROLLAR HERRAMIENTAS NUEVAS ESPECIFICAS PARA LA EPITRANSCRIPTOMICA DE LA RESISTENCIA A LAS PLAGAS, PARA ALMACENAR LOS (EPI) BIOMARCADORES QUE ENCONTREMOS, SE PROPONE SEGUIR DESARROLLANDO LA BASE DE DATOS ESPECIFICA DE TOMATE (TOEPIDB), ASEGURANDO SU COMPATIBILIDAD Y CONECTIVIDAD CON LAS BASES DE DATOS GENOMICAS DE SOLANACEAS, POR ULTIMO, SE PROPONE CARACTERIZAR Y CLASIFICAR LOS (EPI) BIOMARCADORES RELACIONADOS CON LA RESISTENCIA MEDIANTE TECNICAS DE CLASIFICACION AUTOMATICA Y DE SELECCION DE ATRIBUTOS CON OBJETO DE IDENTIFICAR FENOTIPOS RESISTENTES Y NO-RESISTENTES, DETERMINANDO EL VALOR PREDICTIVO DE LOS (EPI) BIOMARCADORES DE RESISTENCIA A PLAGAS, EPIMARCADORES\EPITRANSCRIPTÓMICA\BIOINFORMÁTICA

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