Descripción del proyecto
LA BIODIVERSIDAD MICROBIANA ESTA DOMINADA POR UNA GRAN CANTIDAD DE ORGANISMOS POCO ABUNDANTES QUE APENAS HEMOS EMPEZADO A COMPRENDER: "THE RARE BIOSPHERE". SIN EMBARGO, AUNQUE SE SABE QUE LAS ESPECIES POCO ABUNDANTES MODULAN EL CICLO NATURAL DE LOS NUTRIENTES, DETERMINAN LA RESISTENCIA DE LOS ECOSISTEMAS A LOS CONTAMINANTES Y REPERCUTEN EN LA TOLERANCIA DE LOS HABITATS NATURALES AL CAMBIO CLIMATICO, IGNORAMOS PROFUNDAMENTE LOS MECANISMOS QUE RIGEN ESOS PROCESOS. LAS RAZONES DE ESTE DESCONOCIMIENTO SON MULTIPLES: EN PRIMER LUGAR, CARECEMOS DE ENFOQUES QUE PERMITAN UNA EXPLORACION FILOGENETICAMENTE AMPLIA, DE ALTO RENDIMIENTO Y DE GRAN PROFUNDIDAD DE LA BIOSFERA RARA; Y, EN SEGUNDO LUGAR, LOS CRIBADOS GENOMICOS FUNCIONALES ADOLECEN DE LA FALTA DE UN MARCO CONCEPTUAL Y METODOLOGICO QUE COMPATIBILICE LA NOCION GENOMICA DE FUNCION Y LA IDEA DE CARACTERES ECOLOGICOS Y FUNCIONALES. ESTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO ESTUDIAR LOS PAPELES ECOLOGICOS DE LA BIOSFERA RARA DESDE UNA PERSPECTIVA DE GENOMICA FUNCIONAL MEDIANTE (1) EL DESARROLLO DE UN NUEVO ENFOQUE PARA REVELAR EL REPERTORIO FUNCIONAL DE LA BIOSFERA RARA BASADO EN ESTRATEGIAS DE SECUENCIACION DIRIGIDA, (2) EL DESARROLLO DE UN MARCO FILOGENOMICO PARA DELINEAR LA NOVEDAD FUNCIONAL Y LA DIVERSIDAD EN LA BIOSFERA RARA, Y (3) LA MODELIZACION DE LA DINAMICA FUNCIONAL DE LA BIOSFERA RARA BAJO EL CAMBIO AMBIENTAL EN EL MICROBIOMA DEL SUELO Y OTROS ECOSISTEMAS NATURALES, INCLUYENDO AMBIENTES EXTREMOS Y AREAS CONTAMINADAS. ELLO NOS PERMITIRA INVESTIGAR UNA CUESTION DE LARGA DATA EN EL CAMPO DE LA GENOMICA MICROBIANA: ¿COMO SE RELACIONA LA BIOSFERA RARA CON EL FUNCIONAMIENTO ECOLOGICO? IODIVERSIDAD MICROBIANA\METAGENOMICA\GENOMICA FUNCIONAL\GENOMICA Y ECOLOGIA MICROBIANA