BASES DE LA INTERACCION BENEFICIOSA ENTRE PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS Y LA RIZOSFER...
BASES DE LA INTERACCION BENEFICIOSA ENTRE PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS Y LA RIZOSFERA DEL AGUACATE
EN ESTA SOLICITUD, SE ESTUDIARAN LAS INTERACCIONES BENEFICIOSAS QUE TIENEN LUGAR ENTRE LAS CEPAS DE PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS Y LA RAIZ DEL AGUACATE. P. CHLORORAPHIS ES UN GRUPO BACTERIANO CON ALGUNAS CEPAS CON ACTIVIDAD DE CONTROL...
EN ESTA SOLICITUD, SE ESTUDIARAN LAS INTERACCIONES BENEFICIOSAS QUE TIENEN LUGAR ENTRE LAS CEPAS DE PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS Y LA RAIZ DEL AGUACATE. P. CHLORORAPHIS ES UN GRUPO BACTERIANO CON ALGUNAS CEPAS CON ACTIVIDAD DE CONTROL BIOLOGICO, Y QUE SE HA AISLADO DE FORMA REPETIDA EN RAICES SANAS DE AGUACATE, SUGIRIENDO UNA FUERTE ADAPTACION A LA RIZOSFERA DEL AGUACATE. ASI, ASPECTOS COMO LA COLONIZACION BACTERIANA DE LAS RAICES, LAS INTERACCIONES MULTITROFICAS EN LA RIZOSFERA Y EL ABORDAJE DESDE UN PUNTO DE VISTA HOLISTICO, A NIVEL DEL MICROBIOMA DE LA RIZOSFERA DEL AGUACATE, AYUDARAN A PROFUNDIZAR EN EL PAPEL BENEFICIOSO DE P. CHLORORAPHIS DURANTE LA INTERACCION CON LAS RAICES DE LAS PLANTAS.PARA ELLO, SE UTILIZARAN DIFERENTES ESCALAS DE APROXIMACION:A NIVEL DE GENES, SE ANALIZARAN LAS BASES GENETICAS DE LOS PROCESOS CLAVES PARA INICIAR LA COLONIZACION BACTERIANA DE LA RAIZ DE LAS PLANTAS POR LA BACTERIA MODELO P. CHLORORAPHIS PCL1606 (PCPCL1606), MEDIANTE DOS APROXIMACIONES. UN ENFOQUE GENERAL, MEDIANTE EL USO DE MUTAGENESIS ALEATORIA CON TN5, Y EL POSTERIOR ANALISIS FENOTIPICO DE LOS MUTANTES, CENTRARA LA BUSQUEDA EN FENOTIPOS FUNCIONALES RELACIONADOS CON LA COLONIZACION. LOS RESULTADOS INDICARAN AQUELLOS GENES RELEVANTES IMPLICADOS EN LA COLONIZACION Y SUS FENOTIPOS ASOCIADOS (MOTILIDAD, QUIMIOTAXIS, BIOPELICULA). ADEMAS, UN SEGUNDO ENFOQUE ESTUDIARA EL PAPEL DE UN CLUSTER DE GENES DE PCPCL1606, SUPUESTAMENTE IMPLICADO EN LA ADHESION TEMPRANA. SE CONSTRUIRAN MUTANTES POR DELECION EN CADA UNO DE LOS GENES, Y EL ANALISIS DE LOS FENOTIPOS ASOCIADOS A LA COLONIZACION DE RAICES DE PLANTAS O HIFAS DE ROSELLINIA NECATRIX, PERMITIRAN ASIGNAR FUNCIONES A ESTOS GENES DURANTE LAS INTERACCIONES EN LA RIZOSFERA DEL AGUACATE.A MAYOR ESCALA, SE PROFUNDIZARA EN LAS INTERACCIONES DE P. CHLORORAPHIS CUANDO FORMA PARTE DE UNA COMUNIDAD MICROBIANA. PARA ELLO, SE ENSAMBLARAN DIFERENTES CEPAS RIZOSFERICAS BENEFICIOSAS DE P. CHLORORAPHIS EN UNA COMUNIDAD SINTETICA (SYNTCOM). ESTA SYNTCOM SE UTILIZARA COMO UNA HERRAMIENTA FACIL Y BASICA BASADA EN EL MICROBIOMA, DE REDUCIDA COMPLEJIDAD, QUE PERMITE EL ESTUDIO DE LAS INTERACCIONES ENTRE LOS DIFERENTES MICROORGANISMOS A NIVEL DE COMUNIDAD MICROBIANA. SE ANALIZARAN LAS INTERACCIONES CON LAS RAICES DEL AGUACATE, ESPECIALMENTE DURANTE EL BIOCONTROL FRENTE AL PATOGENO FUNGICO R. NECATRIX. MEDIANTE GENOMICA FUNCIONAL, LOS GENES DESTACADOS REVELARAN LAS POSIBLES ACTIVIDADES QUE TIENEN LUGAR DURANTE LAS INTERACCIONES MULTITROFICAS, QUE SE CONFIRMARAN Y COMPARARA EL COMPORTAMIENTO DE CEPAS INDIVIDUALES FRENTE A LA SYNTCOM.FINALMENTE, SE ESTUDIARA LA PRESENCIA DE P. CHLORORAPHIS Y LA BIODIVERSIDAD DEL SUELO, Y EL MICROBIOMA ASOCIADO AL AGUACATE, CUANDO SE ENCUENTREN BAJO DIFERENTES ESTRESES BIOTICO Y ABIOTICO, CONDICIONES AMBIENTALES Y TIPOS DE SUELO. LAS COMUNIDADES MICROBIANAS PRESENTES EN LA RIZOSFERA DE AGUACATE BAJO DISTINTAS CONDICIONES, LA ABUNDANCIA RELATIVA DE LOS GRUPOS MICROBIANOS PRESENTES, ASI COMO LAS ACTIVIDADES ESPERADAS Y SU ASOCIACION CON PLANTAS EN DIFERENTES ESCENARIOS, SEÑALARAN LAS POSIBLES FUNCIONES BENEFICIOSAS PARA ALGUNOS GRUPOS MICROBIANOS. SE CONFIRMARAN LOS RESULTADOS OBTENIDOS CON AISLADOS CULTIVABLES DE GRUPOS ESPECIFICOS, QUE SERAN ANALIZADOS PARA SUS ACTIVIDADES BENEFICIOSAS, Y COMPARADOS CON LAS DEL SUELO. SE PRESTARA ESPECIAL ATENCION AL GRUPO DE PSEUDOMONAS SPP., PERO SE TENDRAN EN CUENTA AQUELLOS OTROS GRUPOS DE PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS QUE MUESTREN POTENCIAL BENEFICIOSO. IODIVERSIDAD\AGUACATE\RIZOBACTERIA\COLONIZACION RADICULAR\INTERACCIONES PLANTA-MICROORGANISMO\INTERACCIONES MULTITROFICAS\BIOCONTROL\PSEUDOMONAS CHLORORAPHIS\MICROBIOMA\COMUNIDAD SINTETICAver más
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