Descripción del proyecto
EL GOCHU ASTURCELTA ES UNA RAZA PORCINA EN RIESGO EXTREMO, LA POBLACION ACTUAL DERIVA DE CUATRO FUNDADORES, LA ESTRICTA POLITICA DE APAREAMIENTOS APLICADA DESDE EL INICIO DEL PROGRAMA DE CONSERVACION EN 2002 HIZO QUE APARECIERAN EN EL LIBRO GENEALOGICO DE LA RAZA INDIVIDUOS ASIGNABLES TANTO A GENERACIONES DISCRETAS COMO A GENERACIONES SOLAPADAS, EL PROGRAMA DE CONSERVACION DE LA RAZA SE EVALUO EN UNA TESIS DEFENDIDA RECIENTEMENTE (MENENDEZ, 2017), ESTA TESIS CONCLUYO QUE EL PEDIGRI DEL GOCHU ASTURCELTA OFRECE UNA OPORTUNIDAD SINGULAR PARA LA REALIZACION DE ESTUDIOS QUE PERMITAN LA DIFERENCIACION DE LA IDENTIDAD POR ESTADO DE LA HOMOCIGOSIS DEBIDA A LA IDENTIDAD POR DESCENDENCIA (AUTOCIGOSIS) CAUSADA POR APAREAMIENTOS ENTRE PARIENTES, DEBIDO A LA DISPONIBILIDAD DE LA POBLACION FUNDADORA, SE CONSIDERABA AL GOCHU ASTURCELTA UN LABORATORIO VIVO QUE PERMITIRIA ESTIMAR PARAMETROS GENETICOS DE IMPORTANCIA EN CONSERVACION DE DIVERSIDAD GENETICA Y CALCULO DE TAMAÑO EFECTIVO COMO RATIOS DE MUTACION, DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO, RECOMBINACION O ELIMINACION DE ALELOS DELETEREOS, ESTO PODRIA REALIZARSE DE FORMA DIRECTA GRACIAS A LA DISPONIBILIDAD DE LA POBLACION FUNDADORA, EN ESTA MEMORIA SE PROPONE EL GENOTIPADO DE UNA MUESTRA DE INDIVIDUOS DE RAZA GOCHU ASTURCELTA CON HASTA CINCO GENERACIONES DISCRETAS O DIFERENTES PROFUNDIDADES DE GENERACIONES SOLAPADAS EN SU PEDIGRI CON CHIPS DE SNPS DE ALTA DENSIDAD, COMO EL AXIOM_PIGHDV1 (658,692 SNPS), CON EL OBJETIVO DE EVALUAR EL EFECTO DE LA AUTOCIGOSIS Y DIFERENTES PROCESOS GENOMICOS EN LA VARIABILIDAD GENOMICA Y LA CAPACIDAD EVOLUTIVA DE POBLACIONES GANADERAS EN RIESGO, PARA ALCANZAR ESTE OBJETIVO GENERAL, LA PRESENTE PROPUESTA SE ESTRUCTURA EN CINCO OBJETIVOS PARCIALES: 1) EVALUAR LA DIVERSIDAD GENOMICA EN UNA POBLACION GANADERA EN RIESGO EXTREMO (GOCHU ASTURCELTA) MEDIANTE CHIPS DE SNPS DE ALTA DENSIDAD; 2) EVALUAR LA VARIACION DE DIVERSIDAD GENOMICA Y TAMAÑO EFECTIVO EN DIFERENTES GENERACIONES O PERIODOS TEMPORALES; 3) EVALUAR RATIOS DE MUTACION, DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO, RECOMBINACION O ELIMINACION DE ALELOS DELETEREOS TANTO DENTRO Y ENTRE CROMOSOMAS COMO ENTRE GENERACIONES; 4) EVALUAR LA DINAMICA DE ALELOS DELETEREOS MEDIANTE LA IDENTIFICACION DE AREAS GENOMICAS SOMETIDAS A PURGA O BARRIDO GENOMICO; Y 5) IDENTIFICAR AREAS GENOMICAS EN QUE SE LOCALIZAN GENES DE IMPORTANCIA PARA LA CAPACIDAD DE ADAPTACION Y PROGRAMAS DE CRIA EN POBLACIONES GANADERAS, LA PRESENTE PROPUESTA SE REALIZA A PARTIR DE LA EXPERIENCIA OBTENIDA POR EL GRUPO PROPONENTE EN CONSERVACION DE RECURSOS GENETICOS Y PRETENDE DOTAR A LA RAZA PORCINA GOCHU ASTURCELTA DE VALOR CIENTIFICO DE INTERES GENERAL PARA ACRECENTAR EL INTERES SOCIAL DE SU CONSERVACION (MENENDEZ, 2017), LA EJECUCION DEL PRESENTE PROYECTO CONTRIBUIRA A INCREMENTAR EL CONOCIMIENTO DEL EFECTO DE LA DEMOGRAFIA Y POLITICA DE APAREAMIENTOS EN LA DIVERSIDAD GENOMICA DE POBLACIONES GANADERAS EN RIESGO BAJO PROGRAMAS DE CONSERVACION, EL CONOCIMIENTO GENERADO PERMITIRA DESARROLLAR NUEVAS ESTRATEGIAS PARA LA CONSERVACION DE RECURSOS GENETICOS GANADEROS QUE PODRAN AYUDAR A SATISFACER FUTURAS DEMANDAS ALIMENTARIAS, DIVERSIDAD GENOMICA\IDENTIDAD POR DESCENDENCIA\AUTOCIGOSIS\TAMAÑO EFECTIVO\MUTACION\RECOMBINACION\PURGA\ADAPTACION\CONSERVACION DE RECURSOS GENETICOS