ANALISIS GENOMICO DEL EFECTO MODERADOR DE VARIACION COMUN EN EL FENOTIPO CONTINU...
ANALISIS GENOMICO DEL EFECTO MODERADOR DE VARIACION COMUN EN EL FENOTIPO CONTINUO DE LAS PSICOSIS:NUEVA APROXIMACION BASADA EN POLYGENIC RISK SCORES BASADA EN RUTAS BIOLOGICAS
ANTECEDENTES: DURANTE LAS ULTIMAS DECADAS LA PSIQUIATRIA GENETICA HA TRATADO DE IDENTIFICAR LOS GENES RESPONSABLES DE LAS PSICOSIS MEDIANTE ESTRATEGIAS LINEALES QUE PRETENDIAN ASOCIAR EL GENOTIPO CON EL FENOTIPO MEDIANTE EL ESTUDI...
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Descripción del proyecto
ANTECEDENTES: DURANTE LAS ULTIMAS DECADAS LA PSIQUIATRIA GENETICA HA TRATADO DE IDENTIFICAR LOS GENES RESPONSABLES DE LAS PSICOSIS MEDIANTE ESTRATEGIAS LINEALES QUE PRETENDIAN ASOCIAR EL GENOTIPO CON EL FENOTIPO MEDIANTE EL ESTUDIO DE GENES CANDIDATOS, SIN EMBARGO, ESTAS ESTRATEGIAS NO HAN TENIDO EN CUENTA LA NATURALEZA EXTREMADAMENTE POLIGENICA DE LAS PSICOSIS EN QUE EXISTEN MILES DE VARIANTES GENETICAS IMPLICADAS EN INTERACCION ENTRE ELLAS (GXG) Y CON FACTORES AMBIENTALES DE RIESGO (GXE), LAS MODERNAS TECNICAS DE GENOTIPADO MASIVO NOS PERMITEN PODER CALCULAR POLYGENIC RISK SCORES (PRS) QUE ESTIMAN EL PERFIL DE RIESGO GENETICO INDIVIDUAL, ESTOS PRS SE PUEDEN APLICAR PARA: I) LA PREDICCION DE LA CONDICION CASO-CONTROL, II) INVESTIGAR FENOTIPOS INTERMEDIOS Y III) EL ESTUDIO DE VIAS BIOLOGICAS CONCRETAS, ASI COMO INTERACCIONES GEN-GEN E INTERACCIONES GEN-AMBIENTE,LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO SON:1) ESTUDIAR EL IMPACTO SOBRE EL FENOTIPO DE FACTORES GENETICOS MEDIANTE PRS EN I) LA EXPRESION DEL FENOTIPO CONTINUO DE LAS PSICOSIS Y II) LA EXPRESION DEL FENOTIPO CONTINUO DE LAS PSICOSIS A LO LARGO DEL DIA MEDIANTE EXPERIENCE SAMPLING METHODOLOGY (ESM) Y III) VARIABLES COMO LA PERSISTENCIA Y APARICION DE EXPERIENCIAS PSICOTICAS Y SINTOMAS, 2) ANALIZAR LAS ASOCIACIONES ENTRE LA VARIABILIDAD GENETICA Y LOS FACTORES PERSONA (P), CALCULAR PRS EN GRUPOS DE GENES IMPLICADOS EN VIAS BIOLOGICAS IMPLICADAS EN LA REGULACION DEL EMOCIONAL Y DEL ESTRES Y VINCULACION SOCIAL Y ESTUDIAR SU RELACION CON ENDOFENOTIPOS COMO LA SENSIBILIDAD SUBJETIVA AL ESTRES O SALIENCIA3) INVESTIGAR EL PAPEL MODERADOR DE LOS GENES EN LA ASOCIACION ENTRE ESTRES TEMPRANO (TRAUMA EN LA INFANCIA) Y I) EL FENOTIPO CONTINUO DE LAS PSICOSIS Y II) LA EXPRESION DEL FENOTIPO CONTINUO A LO LARGO DEL DIA MEDIANTE ESM, IDENTIFICAR VIAS BIOLOGICAS QUE CONTRIBUYEN TANTO AL RIESGO COMO A LA SALIENCIA ANALIZANDO GRUPOS DE GENES IMPLICADOS EN ESTAS VIAS QUE PUEDEN TANTO PROTEGER COMO CONFERIR RIESGO,4) ESTIMAR EL IMPACTO DE LAS INTERACCIONES EPISTATICAS (INTERACCION GEN-GEN) SOBRE LOS FACTORES P Y SOBRE EL FENOTIPO, METODO: GENOTIPADO MEDIANTE EL ILLUMINA INFINIUM GLOBAL SCREENING ARRAY EN UNA MUESTRA FORMADA POR CONTROLES, INDIVIDUOS CON ALTOS NIVELES DE ESQUIZOTIPIA, INDIVIDUOS DE ALTO RIESGO SUBCLINICO Y PRIMEROS EPISODIOS (VER METODOLOGIA DEL SUBPROYECTO 1), SE CALCULARA EL PRS BASANDONOS EN EL META-ANALISIS RECIENTE DEL SCZ GWAS DEL PSYCHIATRIC GENOMICS CONSORTIUM, LOS PRS SE CALCULAR I) GLOBALMENTE (GENOME-WIDE) Y II) PARA RUTAS BIOLOGICAS DE INTERES (GENE-SETS), LOS VIAS DE INTERES SE DEFINIRAN SEGUN NUESTRAS HIPOTESIS PSICOBIOLOGICA Y DE ACUERDO CON LA INFORMACION DISPONIBLE EN BASES DE DATOS PUBLICAS COMO: THE GENE ONTOLOGY CONSORTIUM (HTTP://GENEONTOLOGY,ORG/), THE KYOTO ENCYCLOPEDIA OF GENES AND GENOMES (HTTP://WWW,GENOME,JP/KEGG/) AND THE REACTOME PATHWAYS (HTTP://WWW,REACTOME,ORG/), PSICOSIS\GENES\GEN-AMBIENTE\FENOTIPO\FACTORES PERSONALES\POLYGENIC RISK SCORE
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