Descripción del proyecto
EN CONTRASTE CON LOS AMBIENTES ACUATICOS HIPERSALINOS (LAGOS SALINOS, SALINAS), LOS SUELOS HIPERSALINOS HAN SIDO OBJETO DE MUCHA MENOR ATENCION, SIENDO EN ESTOS ULTIMOS AÑOS CUANDO SE HAN REALIZADO VARIOS ESTUDIOS ACERCA DE SU DIVERSIDAD MICROBIANA, EN UN PROYECTO PREVIO, NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION HA ESTUDIADO UN SUELO SALINO, LOCALIZADO EN LAS MARISMAS DEL ODIEL (HUELVA), MEDIANTE LA UTILIZACION DE TECNICAS TANTO DEPENDIENTES COMO INDEPENDIENTES DE CULTIVO, COMPARANDOLO CON SISTEMAS ACUATICOS (SALINAS) ESA MISMA ZONA GEOGRAFICA,EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO CONSISTE EN DETERMINAR LAS CARACTERISTICAS FISIOLOGICAS, ECOLOGICAS Y GENOMICAS ASOCIADAS A LOS MICROORGANISMOS HALOFILOS DE AMBIENTES TERRESTRES Y ACUATICOS HIPERSALINOS, CON EL FIN DE INCLUIR EN EL CONCEPTO DE MICROORGANISMO HALOFILO LAS PECULIARIDADES Y CARACTERISTICAS DE LOS HALOFILOS TERRESTRES, Y DE PROPONER UNA CLASIFICACION DE ESTOS SEGUN SU COMPORTAMIENTO FRENTE A LA SALINIDAD O, ALTERNATIVAMENTE, FRENTE A LA ACTIVIDAD DE AGUA DEL AMBIENTE SALINO,LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS DEL PRESENTE PROYECTO SON:1, DETERMINAR EL RANGO SALINO DE LA COMUNIDAD MICROBIANA DE UN SUELO SALINO EN SU CONJUNTO, EN VEZ DEL GENERALMENTE UTILIZADO RANGO INDIVIDUAL DE LOS AISLADOS, ASI, SE ANALIZARA LA DIVERSIDAD MICROBIANA TRAS LA INCUBACION DE LOS SUELOS CON DIFERENTES CONCENTRACIONES SALINAS MEDIANTE SECUENCIACION DE AMPLICONES 16S RRNA Y LA POSTERIOR IDENTIFICACION Y ANALISIS DE LOS OTUS (UNIDADES TAXONOMICAS OPERATIVAS) OBTENIDOS, LA DETECCION DE UN MISMO OTU EN UN MISMO SUELO INCUBADO A DIFERENTES SALINIDADES PERMITIRA ESTABLECER SU RANGO DE CRECIMIENTO A DISTINTAS CONCENTRACIONES SALINAS Y DE TOLERANCIA A DIFERENTES ACTIVIDADES DE AGUA, ASI COMO DELINEAR EL CONCEPTO DE HALOFILO DE SISTEMAS TERRESTRES Y ESTABLECER EN CONCORDANCIA UNA CLASIFICACION DE ESTOS,2, CONSTRUIR REDES DE CO-OCURRENCIA MICROBIANA (CO-OCCURRENCE MICROBIAL NETWORKS), PARA DETERMINAR LOS MICROORGANISMOS MAS RELEVANTES EN LOS SUELOS SALINOS OBJETO DE ESTUDIO, TENIENDO EN CUENTA QUE EN DICHOS SUELOS SE DETERMINARAN DIFERENTES PARAMETROS FISICOQUIMICOS, DICHAS REDES DE ASOCIACION PERMITIRAN ESTABLECER LAS VARIABLES AMBIENTALES QUE PUEDAN AFECTAR A LAS INTERACCIONES ENTRE LA MICROBIOTA PRESENTE EN DICHOS SUELOS,3, ESTUDIOS PREVIOS EN ESTOS SUELOS SALINOS HAN PUESTO DE MANIFIESTO QUE SU DIVERSIDAD MICROBIANA ES MAYOR QUE LA EXISTENTE EN AMBIENTES ACUATICOS HIPERSALINOS, LO QUE HACE MUY COMPLEJO Y LIMITADO EL PROCESO DE OBTENCION DE LOS GENOMAS ENSAMBLADOS A PARTIR DE METAGENOMAS (MAGS), CUANDO DICHAS BASES DE DATOS METAGENOMICAS ESTAN CONSTITUIDAS POR SECUENCIAS CORTAS (ILLUMINA O PIROSECUENCIACION), CON LA FINALIDAD DE OBTENER MAGS MICROBIANOS DE ALTA CALIDAD Y PODER EMPLEARLOS EN SUBSIGUIENTES ANALISIS GENOMICOS, SE UTILIZARA UNA ESTRATEGIA BASADA EN LA OBTENCION DE BASES DE DATOS METAGENOMICAS MIXTAS FORMADAS POR SECUENCIAS CORTAS (ILLUMINA) Y LARGAS (MEDIANTE LA TECNOLOGIA DE NANOPORE),4, UN ULTIMO OBJETIVO SERA EL AISLAMIENTO Y CARACTERIZACION DE MICROORGANISMOS NO CULTIVADOS (ARQUEAS Y BACTERIAS) A PARTIR DE DICHOS SUELOS HIPERSALINOS MEDIANTE LA UTILIZACION DE NUEVAS METODOLOGIAS (CULTUROMICS), QUE INCLUYEN EL DISEÑO DE DIFERENTES MEDIOS Y CONDICIONES DE CULTIVO ACOPLADAS AL SEGUIMIENTO DEL CRECIMIENTO CELULAR MEDIANTE ESPECTROFOTOMETRIA Y CITOMETRIA DE FLUJO, TECNICAS DE DILUCION A EXTINCION Y RECREACION DE AMBIENTES NATURALES EN CONDICIONES DE LABORATORIO, SUELOS HIPERSALINOS\MICROORGANISMOS EXTREMOFILOS\HALOFILOS\METAGENOMICA\MICROBIOTA DE SUELOS SALINOS\MAGS\CULTUROMICS