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RTI2018-094176-R-C32

Financiado

ANALISIS DE LA VARIACION Y DEL CONTROL GENETICO DE LAS FISIOPATIAS POSTCOSECHA E...

ANALISIS DE LA VARIACION Y DEL CONTROL GENETICO DE LAS FISIOPATIAS POSTCOSECHA EN MELOCOTONERO USANDO HERRAMIENTAS GENOMICAS EXISTE UN ACUERDO CASI GLOBAL EN EL MUNDO CIENTIFICO DE QUE EL CAMBIO CLIMATICO ES UN HECHO QUE HOY NO PUEDE SER IGNORADO, EL IMPACTO DEL CAMBIO CLIMATICO AFECTARA LA CALIDAD DE LOS FRUTALES COMO EL MELOCOTONERO (PRUNUS PERSICA),... ver más

01/01/2018

CSIC

121K€

Presupuesto del proyecto: 121K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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CSIC

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 121K€

Descripción del proyecto EXISTE UN ACUERDO CASI GLOBAL EN EL MUNDO CIENTIFICO DE QUE EL CAMBIO CLIMATICO ES UN HECHO QUE HOY NO PUEDE SER IGNORADO, EL IMPACTO DEL CAMBIO CLIMATICO AFECTARA LA CALIDAD DE LOS FRUTALES COMO EL MELOCOTONERO (PRUNUS PERSICA), ESTOS CAMBIOS AUMENTARAN LA INCIDENCIA DE FISIOPATIAS POSTCOSECHA Y DE ENFERMEDADES YA EMERGENTES, ADEMAS, LA REDUCIDA BASE GENETICA DE LAS VARIEDADES MODERNAS ES UN OBSTACULO SERIO PARA MEJORAR LA PRODUCTIVIDAD DEL CULTIVO DEBIDO A SU VULNERABILIDAD A LOS NUEVOS ESTRESES BIOTICOS Y ABIOTICOS, ANTE ESTE ESCENARIO, EL OBJETIVO A LARGO PLAZO DEL SUBPROYECTO N,°3 DE POSTPEACHBREED ES IMPLANTAR LA GENOMICA EN LA MEJORA DE MELOCOTONERO PARA AUMENTAR LA CALIDAD Y PRODUCCION, CONTRIBUYENDO A UNA AGRICULTURA SOSTENIBLE QUE GARANTICE LA SEGURIDAD ALIMENTARIA Y NUTRICIONAL, EL MELOCOTONERO ES EL TERCER CULTIVO MAS IMPORTANTE ECONOMICAMENTE DENTRO DE LA FAMILIA DE LAS ROSACEAS, POR DETRAS DE MANZANA Y PERA, Y ESPAÑA ES EL SEGUNDO MAYOR PRODUCTOR DEL MUNDO, COMO RESULTADO DE LA MEJORA, SU DIVERSIDAD GENETICA SE HA REDUCIDO DRASTICAMENTE, LA INTRODUCCION DE NUEVA VARIACION GENETICA, DE PARENTALES SILVESTRES O VARIEDADES LOCALES, ES NECESARIO PARA LA MEJORA DE CARACTERES COMPLEJOS, CONTROLADOS POR MUCHOS GENES DE POCO EFECTO E INFLUENCIADOS POR INTERACCIONES GENOTIPO × AMBIENTE, COMO SON DAÑOS POR FRIO, MANCHA VITRESCENTE, CORKY SPOTO INFECCIONES COMO LA PODREDUMBRE PARDA PROVOCADA POR MONILINIA SPP, CLARAMENTE, LA BASE GENETICA DE ESTAS FISIOPATIAS Y LA RESISTENCIA A ENFERMEDADES SIGUE SIENDO DESCONOCIDA, EN ESTE SENTIDO, EL DESCUBRIMIENTO DE LA VARIACION GENETICA EN EL GERMOPLASMA Y LAS RELACIONES ENTRE INDIVIDUOS ES IMPORTANTE PARA LA COMPRENSION DE LA DIVERSIDAD GENETICA DISPONIBLE Y SU POTENCIAL PARA SU USO EN MEJORA, SIN EMBARGO, NO EXISTE UNA CARACTERIZACION FENOTIPICA Y GENETICA EXHAUSTIVA DE LAS COLECCIONES DE MELOCOTONERO DEL BANCO DE GERMOPLASMA NACIONAL, EN EL SUBP, N,°3, UTILIZAREMOS RECURSOS GENOMICOS EXISTENTES COMO EL CHIP COMERCIAL DE MELOCOTONERO 9K ILLUMINA SNP (IPSC), CON EL OBJETIVO DE INVESTIGAR LA VARIACION GENETICA EN LAS COLECCIONES NACIONALES DE GERMOPLASMA, LA REDUCCION SUBSTANCIAL DEL COSTE DE SECUENCIACION MASIVA, PERMITE EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS NOVEDOSAS, POR LO QUE EL SUBP, N,°3 USARA UN ENFOQUE HIBRIDO DE VANGUARDIA PARA LA (RE)-SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO DE MATERIAL SELECCIONADO, UTILIZANDO TECNOLOGIAS DE LECTURA CORTA (ILLUMINA) Y LECTURA LARGA (PACBIO), A TRAVES DE ESQUEMAS BIOINFORMATICOS DE TRABAJO, QUE EXPLOTAN HERRAMIENTAS EXISTENTES PARA ENSAMBLAR LECTURAS CORTAS Y LECTURAS LARGAS, Y USANDO LA SECUENCIA DEL GENOMA DE REFERENCIA, EL SUBP, N,°3 OBTENDRA GENOMAS DE ALTA CALIDAD Y DETECTARA VARIANTES GENETICAS RARAS, POCO FRECUENTES Y ALTAMENTE INFORMATIVAS, ADEMAS, GENERARA UN CHIP DE CON ~ 20000 MARCADORES, FINALMENTE, EN EL SUBP, N,°3 LLEVAREMOS A CABO ESTUDIOS DE ASOCIACION DE GENOMA COMPLETO PARA IDENTIFICAR Y CONFIRMAR REGIONES, Y ALELOS, CON UNA FUERTE ASOCIACION ENTRE EL GENOTIPO Y LAS DISTINTAS FISIOPATIAS ESTUDIADAS EN POSTPEACHBREED, SE DESARROLLARA UNA NUEVA BASE DE DATOS DE SNPS QUE ALBERGARA LA INFORMACION COMPLETA SOBRE CADA VARIANTE GENETICA OBTENIDA, EL SUBP, N,°3 SE ENFOCARA EN COMPRENDER Y DESCUBRIR LA VARIACION GENETICA ASOCIADA CON VARIAS FISIOPATIAS POSTCOSECHA DEL MELOCOTONERO Y ESPECIFICAMENTE EN PROPORCIONAR UN EFICIENTE SET DE HERRAMIENTAS CON BASE GENOMICA PARA LA IMPLEMENTACION DE LA MEJORA BASADA EN GENOMICA EN MELOCOTONERO EN ESPAÑA Y EN EL MUNDO MELOCOTONERO\DIVERSIDAD GENÉTICA\MAPEO POR ASOCIACIÓN\EFICIENCIA DE MEJORA\MODELOS MIXTOS\SECUENCIACIÓN DE GENOMA COMPLETO\ASOCIACIÓN DE GENOMA COMPLETO

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