Descripción del proyecto
P, FLUORESCENS F113 FUE AISLADA DE LA RIZOSFERA DE REMOLACHA Y SU CAPACIDAD PARA PRODUCIR ANTIBIOTICOS Y ANTIFUNGICOS LA CONVIRTIO EN UNA ESTIRPE DE INTERES BIOTECNOLOGICO, LA SECUENCIACION DE SU GENOMA HA REVELADO MULTIPLES PROPIEDADES QUE LE PERMITEN PERSISTIR EN UN NICHO ECOLOGICO CAMBIANTE COMO ES EL RIZOSFERICO TALES COMO, SU CAPACIDAD DE UTILIZAR NITRATO Y NITRITO COMO ACEPTOR FINAL DE ELECTRONES, LA CAPACIDAD DE UTILIZAR MULTIPLES FORMAS DE CARBONO, LA PRODUCCION DE METABOLITOS SECUNDARIOS Y LA DIVERSIDAD DE SUS SISTEMAS DE SECRECION (REDONDO-NIETO ET AL,, 2012 Y 2013), TAMBIEN SE HA OBSERVADO QUE F113 PUEDE INTERESAR COMO PROMOTORA DIRECTA DEL CRECIMIENTO VEGETAL YA QUE PRESENTA UNA ALTA ACTIVIDAD ACC DEAMINASA (REDONDO-NIETO ET AL 2013), LOS USOS DE F113 EN SISTEMAS INTEGRADOS PLANTA/MICROORGANISMO DEPENDEN DE LA EFICACIA DE LA COLONIZACION Y SU PERSISTENCIA EN LA RIZOSFERA, DURANTE LOS ULTIMOS 15 AÑOS HEMOS ESTADO ESTUDIANDO CARACTERES IMPORTANTES PARA UNA COLONIZACION COMPETITIVA: LA VARIACION DE FASE, EL MOVIMIENTO Y LA CAPACIDAD PARA FORMAR BIOPELICULAS (SANCHEZ-CONTRERAS ET AL 2002; CAPDEVILA ET AL 2004; MARTINEZ-GRANERO ET AL 2005, 2006, 2012, 2014A Y 14B; REDONDO-NIETO ET AL 2008; NAVAZO ET AL 2009; BARAHONA ET AL 2010), EL CONOCIMIENTO ADQUIRIDO SOBRE LA RED DE SEÑALIZACION QUE REGULA ESTOS CARACTERES NOS HA PERMITIDO DISEÑAR ESTIRPES MAS COMPETITIVAS QUE PRESENTAN MEJORADA LA CAPACIDAD DE BIOCONTROL (BARAHONA ET AL 2011) Y PERMITE QUE EN EL PRESENTE PROYECTO NOS PLANTEEMOS LA BUSQUEDA DE ESTAS CARACTERISTICAS EN CEPAS NATURALES PARA SER UTILIZADAS COMO POSIBLES INOCULANTES, LA VERSATILIDAD DE RESPUESTA DE F113 A LAS CONDICIONES AMBIENTALES, INCLUYENDO LA VARIACION DE FASE Y LA MODULACION DEL ESTILO DE VIDA, PERMITE A LA BACTERIA AUMENTAR SU CAPACIDAD DE COMPETIR Y COLONIZAR LA RIZOSFERA, UNO DE LOS PROTAGONISTAS PRINCIPALES DE ESTA RESPUESTA DE ADAPTACION AL AMBIENTE ES LA MOLECULA SEÑAL DIGMPC QUE ESTA IMPLICADA EN LA RED DE SEÑALIZACION QUE REGULA EL ESTILO DE VIDA MOVIL O SESIL DE F113 (NAVAZO ET AL 2009; MARTINEZ-GRANERO ET AL 2014), EL FACTOR SIGMA ALGU Y LA PROTEINA AMRZ FORMAN UN NODO CENTRAL EN EL SISTEMA DE SEÑALIZACION DE RESPUESTA QUE ADEMAS DE TENER OTRAS FUNCIONES ACTUAN MODULANDO LOS NIVELES DE DIGMPC (MARTINEZ-GRANERO ET AL 2012; 2014A Y 2014B), EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS SEGUIR ANALIZANDO LA COMPLEJA RED SEÑALIZACION QUE REGULA EL MOVIMIENTO QUIMIOTACTICO, ANALIZAR EL PAPEL DEL REGULADOR GLOBAL AMRZ EN LA RESPUESTA A LAS CONDICIONES AMBIENTALES, ESTUDIAR DESDE EL PUNTO DE VISTA GENOMICO EL PROCESO DE VARIACION DE FASE, ESTUDIAR LA DIVERSIDAD GENETICA DENTRO DEL COMPLEJO DE ESPECIES DE PSEUDOMONAS FLUORESCENS Y APLICAR ESTOS CONOCIMIENTOS PARA AISLAR Y CARACTERIZAR NUEVOS INOCULANTES CON APLICACIONES AGRICOLAS, LA EXPERIENCIA ADQUIRIDA TRAS LA SECUENCIACION Y ENSAMBLAJE DEL GENOMA DE F113 Y LOS ANALISIS DE RNASEQ QUE NOS ENCONTRAMOS REALIZANDO CON F113 CRECIDA EN DIFERENTES CONDICIONES NOS PERMITEN PODER AFRONTAR EN ESTE PROYECTO DESDE UNA PERSPECTIVA GENOMICA, LA COLABORACION CON J, MALONE (JOHN INNES CENTRE, NORWICH, REINO UNIDO) NOS PERMITIRA ABORDAR BIOQUIMICAMENTE EL PAPEL DEL DIGMPC EN EL PROCESO DE COLONIZACION, LA PARTICIPACION COMO EPOS DE DOS EMPRESAS DEL SECTOR AGRICOLA, PERMITIRA LA TRANSFERENCIA DE CONOCIMIENTO SOBRE EL DISEÑO DE NUEVOS INOCULANTES PARA PROMOVER EL CRECIMIENTO DE LA PLANTA Y CONTROLAR LAS PLAGAS CON EL OBJETO DE DESARROLLAR UNA AGRICULTURA MAS SOSTENIBLE, PSEUDOMONAS\RIZOSFERA\COLONIZACIÓN\DIGMPC\MOVILIDAD\COMPETITIVIDAD\PROMOCIÓN DEL CRECIMIENTO DE PLANTAS (PG