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TIN2012-31377

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ADQUISICION DE CONOCIMIENTO EN FARMACOPROTEOMICA MEDIANTE METODOS AVANZADOS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL DE ACUERDO AL INFORME MOYA-ANGELER, PUBLICADO EN 2008, LA INDUSTRIA FARMACEUTICA ESPAÑOLA INVIRTIO 844 MILLONES DE EUROS EN INVESTIGACION EN 2006, DE LOS CUALES UN 17% SE DEDICO A INVESTIGACION BASICA. EN EUROPA, EL SECTOR FARMAC... ver más

01/01/2012

UPC

39K€

Presupuesto del proyecto: 39K€

Líder del proyecto

Universidad Politécnica de Cataluña No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 9

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2012-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

Universidad Politécnica de Cataluña No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 9

Presupuesto del proyecto 39K€

Descripción del proyecto DE ACUERDO AL INFORME MOYA-ANGELER, PUBLICADO EN 2008, LA INDUSTRIA FARMACEUTICA ESPAÑOLA INVIRTIO 844 MILLONES DE EUROS EN INVESTIGACION EN 2006, DE LOS CUALES UN 17% SE DEDICO A INVESTIGACION BASICA. EN EUROPA, EL SECTOR FARMACEUTICO LIDERA LAS CIFRAS DE REINVERSION DE VENTAS EN FORMA DE INVESTIGACION, CON UN 15.3% (2007), POR ENCIMA DEL SECTOR INFORMATICO. EN ESPAÑA, ESTA CIFRA SE REDUCE A UN MERO 6.6%, PRINCIPALMENTE POR EL PEQUEÑO TAMAÑO DE LAS COMPAÑIAS Y LA ATOMIZACION DEL SECTOR. EN ESTE CONTEXTO, LOS CENTROS EXTERNOS DE INVESTIGACION, INCLUYENDO UNIVERSIDADES, DEBERIAN JUGAR UN PAPEL COMPLEMENTARIO CLAVE.SE PODRIA DECIR QUE LA INVESTIGACION EN FARMACOS HA TENIDO UN PAPEL PREDOMINANTE EN EL AVANCE DE LA MEDICINA DURANTE LAS ULTIMAS DECADAS. UNA DE LAS AREAS PRINCIPALES DE INVESTIGACION FARMACOLOGICA ESTA RELACIONADA CON EL ESTUDIO DE PROTEINAS. LA FARMACOLOGIA DEPENDE CADA VEZ MAS DE LOS AVANCES EN GENOMICA Y PROTEOMICA, LO QUE IMPLICA EL RETO DE ENCONTRAR METODOS ROBUSTOS PARA EL ANALISIS DE LOS DATOS COMPLEJOS QUE GENERAN. TAL RETO NOS INCITA A IR MAS ALLA DE LA ESTADISTICA TRADICIONAL PARA RECURRIR A ENFOQUES DEL CAMPO DE LA INTELIGENCIA ARTIFICIAL, INCLUYENDO EL APRENDIZAJE AUTOMATICO Y EL RECONOCIMIENTO DE PATRONES ESTADISTICO, ENTRE OTROS. EL USO DE PRINCIPIOS SOLIDOS DE TEORIA ESTADISTICA ES ESENCIAL PARA CONFIAR EN LA BASE DE EVIDENCIA OBTENIDA MEDIANTE ESTOS ENFOQUES. LOS METODOS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO ESTADISTICO SERAN UNO DE LOS FUNDAMENTOS DE ESTE PROYECTO.MAS DEL 50% DE LOS FARMACOS TIENEN COMO DIANA APENAS CUATRO FAMILIAS DE PROTEINAS, DE LAS QUE UN 30% CORRESPONDEN A LA SUPERFAMILIA DE LOS GPCRS. LAS GPCR REGULAN LA FUNCIONALIDAD DE LA MAYORIA DE LAS CELULAS Y SERAN EL OBJETO DEL PROYECTO. SE DESCONOCE LA ESTRUCTURA 3D DE LA MAYORIA DE ESTAS PROTEINAS, PERO EN CAMBIO HAY MUCHA INFORMACION DISPONIBLE DE SUS SECUENCIAS DE AMINO ACIDOS. EL AGRUPAMIENTO Y CLASIFICACION AUTOMATICOS DE LAS GPCR EN FAMILIAS Y ESTAS A SU VEZ EN TIPOS Y SUBTIPOS EN BASE A SUS SECUENCIAS, PUEDEN CONTRIBUIR DE FORMA SIGNIFICATIVA A DILUCIDAR AQUELLAS DE SUS PROPIEDADES FARMACOLOGICAMENTE RELEVANTES.NO HAY FORMA BIOLOGICAMENTE RELEVANTE DE REPRESENTAR LAS SECUENCIAS SIMBOLICAS DE LAS PROTEINAS MEDIANTE VECTORES REALES. ESTO NO IMPIDE QUE SE PUEDAN ANALIZAR CON METODOS ADECUADOS. ENTRE ESTOS SE CUENTAN TECNICAS PROVENIENTES DEL APRENDIZAJE AUTOMATICO ESTADISTICO Y, EN PARTICULAR, METODOS KERNEL. POR OTRO LADO, LA VISUALIZACION DE SECUENCIAS DE PROTEINAS DE ALTA DIMENSIONALIDAD PUEDE SER UNA HERRAMIENTA CLAVE PARA LA EXPLORACION Y ANALISIS DE LAS MISMAS.EL OBJETIVO CENTRAL DEL PROYECTO SERA PUES DUAL: POR UN LADO, EL DISEÑO DE METODOS BASADOS EN LA INTELIGENCIA ARTIFICIAL PARA EL ANALISIS DE DATOS SECUENCIALES CORRESPONDIENTES A GPCRS. POR OTRO LADO, Y DADO QUE ESTA INVESTIGACION TIENE EL FIN ULTIMO DE SER UTIL EN EL DISEÑO DE FARMACOS Y EN LA COMPRENSION DE LOS PROCESOS MOLECULARES INVOLUCRADOS, PRETENDEMOS APLICAR LOS METODOS DESARROLLADOS A PROBLEMAS DE FARMACOPROTEOMICA TALES COMO SUBTIPIFICACION DE GPCRS, HETEROMERIZACION Y DEORFANIZACION DE RECEPTORES, Y ANALISIS DE PROTEINAS NO-ALINEADAS. PARA LA CONSECUCION DE ESTE OBJETIVO CONTAMOS CON LA COLABORACION DEL GRUPO DE INVESTIGACION SYSTEMS PHARMACOLOGY AND BIOINFORMATICS DE LA UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA (UAB) Y CON EL APOYO DE LA COMPAÑIA FARMACEUTICA ESTEVE Y DE OTRAS DOS COMPAÑIAS RELEVANTES EN EL CONTEXTO BIOMEDICO: SABIRMEDICAL S.L. E INTELLIGENT PHARMA, S.L.

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