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VSG-SWITCH

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What determines the hierarchy of VSG antigen switching in T. brucei?

Pathogens use antigenic variation to evade host antibodies and cause diseases in humans. Interestingly, in many species antigen switching occurs non-randomly in a hierarchical manner, with specific antigen genes selected in succes... ver más

31/08/2026

LMU MUENCHEN

174K€

Presupuesto del proyecto: 174K€

Líder del proyecto

LUDWIGMAXIMILIANSUNIVERSITAET MUENCHEN No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo HORIZON EUROPE notifico la concesión del proyecto el día 2023-04-26

HORIZON-MSCA-2022-PF-01-01: MSCA Postdoctoral Fellowships 2022 ExpectedOutcome:

I+D

Cerrada hace 2 años

0% 100% 100%

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1 Participantes

LMU MUENCHEN

173.85K€ | Lider

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Duración del proyecto: 40 meses Fecha Inicio: 2023-04-26
Fecha Fin: 2026-08-31

Líder del proyecto

LUDWIGMAXIMILIANSUNIVERSITAET MUENCHEN No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 174K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Pathogens use antigenic variation to evade host antibodies and cause diseases in humans. Interestingly, in many species antigen switching occurs non-randomly in a hierarchical manner, with specific antigen genes selected in succession. Trypanosoma brucei is a key model organism for the study of antigenic variation in which antigen switching hierarchies of its Variant Surface Glycoprotein (VSG) genes operate. However, how exactly this hierarchy is determined is unknown. Studies in T. brucei have indicated that the spatial positioning of VSG genes within the nucleus is important for controlling their activation. However, to date no systematic investigation of VSG gene nuclear positioning and antigen switching hierarchies has been performed. In this project, I would test the hypothesis that antigen switching hierarchies in trypanosomes are mediated by the spatial positioning of VSG genes in the nucleus. Using T. brucei cell lines in which different antigen switching pathways can be induced, I will determine whether silent VSGs in close spatial proximity to the active VSG before switch induction are selected next in the antigen switching pathway. This will be investigated by integrating a combination of Micro-C to monitor VSG nuclear positioning before and after switching followed by scRNA-seq. I will also develop a dCas9 artificial tethering system to tether silent VSGs either towards or away from the active VSG before switch induction to create a synthetic VSG switching hierarchy. These experiments will generate important insights into the mechanisms which control antigen switching and provide valuable tools for studying nuclear organisation in kinetoplastid parasites.

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