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VARMET

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Variational Metadynamics

We propose to extend the time scale accessible to atomistic-based simulation methods from the current range to millisecond and beyond without special-purpose machines. We shall do this by combining and extending two recent deve... ver más

31/12/2020

USI

2M€

Presupuesto del proyecto: 2M€

Líder del proyecto

UNIVERSITA DELLA SVIZZERA ITALIANA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 2 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2020-12-31

ERC-ADG-2014: ERC Advanced Grant

I+D

Cerrada hace 10 años

0% 100% 100%

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No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

2 Participantes

USI

2.49M€ | Lider

ISTOBAL

417.60K€ | Participante

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Duración del proyecto: 65 meses Fecha Inicio: 2015-07-29
Fecha Fin: 2020-12-31

Líder del proyecto

UNIVERSITA DELLA SVIZZERA ITALIANA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 2M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto We propose to extend the time scale accessible to atomistic-based simulation methods from the current range to millisecond and beyond without special-purpose machines. We shall do this by combining and extending two recent developments: a recent reformulation of the enhanced sampling problem into a powerful variational principle that opens a wealth of possibilities and provides a novel and fruitful standpoint for new developments; and a procedure for extracting rates from enhanced runs. We shall apply the methods thus developed to two major problems of great practical interest. One is the lifetime of a ligand-protein bound state. This quantity is not easily accessible experimentally and yet it is crucial in drug design to determine the potency of a drug. We plan to develop a viable and widely applicable way to compute it. The other is a study of crystallization from solution, for which we wish to determine the nucleation mechanism and nucleation rates and understand and control crystal growth. These are all issues of great relevance in engineering, pharmacology and nanotechnology. Besides being relevant on their own merits, these two applications present different challenges to the enhanced methods. We also believe that new methods should not be developed in an abstract way but in close interaction with real-life applications.

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