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AGL2014-56369-C2-2-R

Financiado

VALIDACION GENETICA Y FUNCIONAL DE QTLS, GENES Y REDES GENICAS Y ESTUDIO DEL EFE...

VALIDACION GENETICA Y FUNCIONAL DE QTLS, GENES Y REDES GENICAS Y ESTUDIO DEL EFECTO DEL MICROBIOMA EN EL CRECIMIENTO, DEPOSICION DE GRASA Y CALIDAD DE LA CARNE EN PORCINO. S2 EL CONOCIMIENTO DE LOS GENES QUE AFECTAN CALIDAD DE LA CARNE, INCLUYENDO ASPECTOS SENSORIALES, NUTRICIONALES Y RELACIONADOS CON LA SALUD HUMANA, ES FUNDAMENTAL PARA MEJORAR LA CALIDAD DE LOS PRODUCTOS DERIVADOS DEL CERDO SIN AFECT... ver más

01/01/2014

CENTRE RECERCA EN...

212K€

Presupuesto del proyecto: 212K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2014-01-01

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Participantes

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMI...

Lider

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB...

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 212K€

Descripción del proyecto EL CONOCIMIENTO DE LOS GENES QUE AFECTAN CALIDAD DE LA CARNE, INCLUYENDO ASPECTOS SENSORIALES, NUTRICIONALES Y RELACIONADOS CON LA SALUD HUMANA, ES FUNDAMENTAL PARA MEJORAR LA CALIDAD DE LOS PRODUCTOS DERIVADOS DEL CERDO SIN AFECTAR AL RENDIMIENTO PRODUCTIVO, LA SELECCION GENOMICA ES CONSIDERADA POR LA INDUSTRIA PORCINA UNA HERRAMIENTA UTIL PARA MEJORAR ESTE TIPO DE CARACTERES, SIN EMBARGO, SU IMPLEMENTACION EN ESTA ESPECIE PRESENTA INCONVENIENTES, SIENDO RECOMENDABLE CENTRARSE EN LA IDENTIFICACION DE LAS VARIANTES CAUSALES (QTN) SUBYACENTES A QTL CON EFECTOS MODERADOS Y CONSISTENTES A LO LARGO DE GENERACIONES, RAZAS O LINEAS, EL CAMINO DEL QTL AL QTN REQUIERE DE ENSAYOS RIGUROSOS Y VALIDACION DE LOS EFECTOS DE QTL Y SNPS EN DIFERENTES FONDOS GENETICOS, ESTUDIOS PREVIOS BASADOS EN EL CRUCE EXPERIMENTAL IBERICO X LANDRACE NOS PERMITIERON IDENTIFICAR REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS CON CRECIMIENTO, DEPOSICION DE GRASA, COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS Y CONTENIDO DE COLAGENO EN MUSCULO, INCLUSO, VARIAS REGIONES QTL SE ESTUDIARON EN PROFUNDIDAD MEDIANTE ANALISIS DE GENES CANDIDATOS, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE LA PROPUESTA ACTUAL ES LA VALIDACION DE ESOS QTL Y MUTACIONES EN GENES CANDIDATOS EN DIFERENTES FONDOS GENETICOS, UTILIZANDO HERRAMIENTAS DE GENOMICA Y TRANSCRIPTOMICA, CON EL FIN DE IDENTIFICAR CON EXITO QTN, ESTOS ENFOQUES SE COMPLEMENTARAN CON UNA APROXIMACION METAGENOMICA, QUE HA ABIERTO NUEVAS VIAS DE INVESTIGACION MEDIANTE EL ANALISIS DE LA HETEROGENEIDAD DEL GENOMA Y DE LOS CAMBIOS EN LA DIVERSIDAD DEL MICROBIOMA QUE PODRIAN AFECTAR A CARACTERES DE INTERES, NUESTRO PLAN DE TRABAJO SE ORGANIZA EN TRES BLOQUES: WP1) ANALISIS DE QTL Y EXPRESION DE GENES EN DOS RETROCRUZAMIENTOS EXPERIMENTALES, LA DETECCION DE QTL SE LLEVARA A CABO MEDIANTE EL GENOTIPADO CON EL PORCINE SNP60 BEADCHIP, Y SE COMPARARA MEDIANTE RNA-SEQ Y QPCR EL TRANSCRIPTOMA DE ANIMALES DIVERGENTES PARA LOS CARACTERES ANALIZADOS; WP2) VALIDACION GENETICA Y FUNCIONAL DE POLIMORFISMOS EN GENES CANDIDATOS POSICIONALES, LOS POLIMORFISMOS CANDIDATOS DE ANALISIS PREVIOS Y LOS IDENTIFICADOS EN WP1 SERAN VALIDADOS EN POBLACIONES EXPERIMENTALES Y COMERCIALES, LA VALIDACION GENETICA SE LLEVARA A CABO A TRAVES DEL GENOTIPADO DE 256 SNPS EN UN CHIP OPENARRAY, SEGUIDO DE ANALISIS DE ASOCIACION, AQUELLOS QTN PUTATIVOS VALIDADOS EN DIVERSOS FONDOS GENETICOS SE EVALUARAN FUNCIONALMENTE A TRAVES DE ESTUDIOS IN SILICO Y ENFOQUES MOLECULARES, TALES COMO ANALISIS DE EXPRESION GENICA Y METILACION; WP3) METAGENOMICA INTESTINAL, EL MICROBIOMA INTESTINAL DEL CERDO SE ANALIZARA CONDICIONADO A LA EDAD Y A LA LOCALIZACION A LO LARGO DEL INTESTINO EN UN EXPERIMENTO CON CERDOS DE RAZA IBERICA, ADEMAS, SE ANALIZARA EL MICROBIOMA INTESTINAL DE CERDOS COMERCIALES DUROC X IBERICO CON EL FIN DE ESTUDIAR LA RELACION ENTRE MICROBIOMA Y EL CRECIMIENTO, LA DEPOSICION GRASA Y LA COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS, LA SECUENCIACION DE AMPLICONES DEL GEN RRNA 16S SE REALIZARA PARA ESTIMAR LA DIVERSIDAD Y ABUNDANCIA DEL MICROBIOMA, FINALMENTE, SE LLEVARA A CABO LA SECUENCIACION MASIVA DEL METAGENOMA DE AQUELLAS MUESTRAS QUE PRESENTEN DIFERENCIAS INTERESANTES, ESTOS ESTUDIOS PROPORCIONARAN INFORMACION BIOLOGICA SOBRE LA BASE GENETICA DEL CRECIMIENTO, DEPOSICION GRASA Y CALIDAD DE CARNE EN PORCINO, ADEMAS DE PARA ENFERMEDADES RELACIONADAS CON OBESIDAD EN HUMANO, MAS AUN, SE ESPERA OBTENER MARCADORES ESPECIFICOS, EN ALTO DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO CON MUTACIONES CAUSALES O INCLUSO QTN, UTILES EN LA MEJORA GENETICA PORCINA, QTL\GEN\METAGENOMA\MICROBIOMA\TRANSCRIPTOMA\PRODUCCIÓN\CALIDAD DE CARNE

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