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AGL2012-40228-C02-01

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USO DE LA SECUENCIA GENOMICA PARA LA CARACTERIZACION DE LA VARIABILIDAD INTRACLO...

USO DE LA SECUENCIA GENOMICA PARA LA CARACTERIZACION DE LA VARIABILIDAD INTRACLONAL E INTERESPECIFICA EN MELOCOTONERO Y ALMENDRO EL MELOCOTONERO (PRUNUS PERSICA) ES UNA ESPECIE CON UN BAJO NIVEL DE VARIABILIDAD GENETICA, LO QUE ES UN FACTOR LIMITANTE PARA SU MEJORA. ADEMAS DE LA VARIABILIDAD INTRAESPECIFICA QUE ES LA HABITUALMENTE USADA EN MEJORA COMERCIAL... ver más

01/01/2012

CENTRE RECERCA EN...

246K€

Presupuesto del proyecto: 246K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2012-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 246K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL MELOCOTONERO (PRUNUS PERSICA) ES UNA ESPECIE CON UN BAJO NIVEL DE VARIABILIDAD GENETICA, LO QUE ES UN FACTOR LIMITANTE PARA SU MEJORA. ADEMAS DE LA VARIABILIDAD INTRAESPECIFICA QUE ES LA HABITUALMENTE USADA EN MEJORA COMERCIAL EXISTEN OTRAS FUENTES DE VARIACION QUE ESTE PROYECTO PRETENDE EXPLORAR. LA VARIABILIDAD INTRACLONAL, SOBRE LA QUE NO SE DISPONE PRACTICAMENTE DE NINGUNA INFORMACION, Y LA VARIABILIDAD INTERESPECIFICA, UNA IMPORTANTE FUENTE DE NUEVOS GENES QUE HA SIDO POCO ANALIZADA Y EXPLOTADA. EL ALMENDRO (P. DULCIS) ES UNA ESPECIE COMPATIBLE CON EL MELOCOTONERO Y CON MUY ELEVADO NIVEL DE VARIABILIDAD GENETICA POR LO QUE ES UNO DE LOS POSIBLES DONADORES PARA ENRIQUECER EL GENOMA DEL MELOCOTONERO. EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS EN PRIMER LUGAR USAR LA VARIABILIDAD INTRACLONAL PARA IDENTIFICAR LA MUTACION CAUSANTE DE LA DIFERENCIA ENTRE UNA VARIEDAD Y SU MUTANTE EN DOS CASOS: LA MUTACION DE FRUTO VELLOSO (MELOCOTON A FRUTO GLABRO (NECTARINA) Y LA DE FLORACION TEMPRANA A TARDIA EN ALMENDRO. ESTE ANALISIS, BASADO EN LA COMPARACION DE LA RESECUENCIA DE VARIEDADES Y MUTANTES, NOS PERMITIRA TAMBIEN OBTENER UNA PRIMERA ESTIMACION CUANTITATIVA Y CUALITATIVA DE LA VARIABILIDAD INTRACLONAL A NIVEL DEL TODO EL GENOMA. CONTINUAREMOS TAMBIEN CON EL ESTUDIO GENETICO DE LA VARIABILIDAD FENOTIPICA QUE EL ALMENDRO PUEDE APORTAR AL MELOCOTONERO CON LA GENERACION DE UNA COLECCION DE LINEAS CASI-ISOGENICAS (NILS) DE FRAGMENTOS CROMOSOMICOS DE ALMENDRO EN MELOCOTONERO Y DE RESECUENCIAR LOS INDIVIDUOS DE UNA POBLACION DEL PRIMER RETROCRUZAMIENTO ENTRE (ALMENDRO X MELOCOTONERO) X MELOCOTONERO, LO QUE NOS PERMITIRA ESTABLECER LA POSICION PRECISA DE TODAS LAS RECOMBINACIONES DE CADA INDIVIDUO Y EL MAPEO DE PRECISION DE LOS GENES/QTLS RESPONSABLES DE UN AMPLIO CONJUNTO DE CARACTERES CUYOS DATOS SE OBTENDRAN EN PARTE DENTRO DEL PROYECTO. FINALMENTE, LA REALIZACION DE ESTAS ACTIVIDADES REQUIEREN EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS ADECUADAS, PARTICULARMENTE SECUENCIAS DE REFERENCIA DE ALTA CALIDAD PARA PODER REALIZAR LAS ESTRATEGIAS DE RESECUENCIA DE MANERA ADECUADA. PARA ELLO SE SECUENCIARAN DE NOVO DOS GENOMAS, EL DEL MELOCOTONERO CV. COFRENTES 3 Y EL DEL ALMENDRO CV. TEXAS. EL PRIMERO PERMITIRA COMPARAR EN DETALLE DOS SECUENCIAS DEL GENOMA DE MELOCOTON Y DETECTAR LA EXTENSION Y TIPO DE LOS VARIANTES ESTRUCTURALES QUE EXISTEN ENTRE AMBOS, Y EL SEGUNDO LA COMPARACION ENTRE DOS ESPECIES DIVERSAS POR SU HISTORIA PERO MUY PROXIMAS DESDE EL PUNTO DE VISTA EVOLUTIVO.

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