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BIO2011-27069

Financiado

UNDERSTANDING THE MECHANISMS OF THE DISEASE AND PRIORITIZING CANDIDATE GENES UND...

UNDERSTANDING THE MECHANISMS OF THE DISEASE AND PRIORITIZING CANDIDATE GENES UNDER A SYSTEMS PERSPECTIVE ES UN HECHO ACEPTADO EL QUE LA FUNCION CELULAR SE LLEVA A CABO MEDIANTE LA ACTIVIDAD COOPERATIVA DE UNA SERIE DE GENES Y SUS REGULADORES AGRUPADOS EN LO QUE CONOCEMOS COMO MODULOS FUNCIONALES. A PESAR DE QUE ESTAMOS AUN MUY LEJOS... ver más

01/01/2011

Fundación de la Co...

272K€

Presupuesto del proyecto: 272K€

Líder del proyecto

Fundación de la Comunidad Valenciana Centro d... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 130K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01

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Participantes

Fundación de la Comunidad Va...

Lider

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Líder del proyecto

Fundación de la Comunidad Valenciana Centro d...

TRL 4-5 | 130K€

Presupuesto del proyecto 272K€

Descripción del proyecto ES UN HECHO ACEPTADO EL QUE LA FUNCION CELULAR SE LLEVA A CABO MEDIANTE LA ACTIVIDAD COOPERATIVA DE UNA SERIE DE GENES Y SUS REGULADORES AGRUPADOS EN LO QUE CONOCEMOS COMO MODULOS FUNCIONALES. A PESAR DE QUE ESTAMOS AUN MUY LEJOS DE TENER UN CONOCIMIENTO DETALLADO DE LA INTRINCADA RED DE RELACIONES EXISTENTE ENTRE LAS MOLECULAS QUE DEFINE TODOS LOS ASPECTOS DEL COMPORTAMIENTO CELULAR, EXISTEN DEFINICIONES OPERATIVAS PARA UN CONJUNTO REDUCIDO DE MODULOS FUNCIONALES QUE PUEDEN USARSE PARA CARACTERIZAR FENOTIPOS O RESPUESTAS CELULARES.EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO CONSISTE EN CONCEPTUALIZAR ESTOS MODULOS CAPACES DE EXPLICAR ALGUNAS FUNCIONES DE IMPORTANCIA A NIVEL CELULAR. INICIALMENTE SE USARAN DISTINTAS DEFINICIONES ESTANDAR DE MODULOS, COMO KEGG, BIOCARTA REACTOME Y OTROS, QUE SERAN POSTERIORMENTE COMPLEMENTADOS CON INFORMACION SOBRE INTERACCIONES FUNCIONALES, REGULATORIAS Y FISICAS ENTRE LAS MOLECULAS QUE DEFINEN EL MODULO. SE USARAN DATOS GENOMICOS DE DISTINTA NATURALEZA (VARIANTES, EXPRESION GENICA, METILACION, ETC.) OBTENIDOS CON DIFERENTES PLATAFORMAS (GENOTIPADO, MICROARRAYS DE EXPRESION, SECUENCIACION DE NUEVA GENERACION, ETC.) PARA INTERPRETAR LOS CAMBIOS EN LA FUNCIONALIDAD DEL MODULO ASOCIADOS A LOS DISTINTOS EXPERIMENTOS. LOS MODELOS DE LOS MODULOS FUNCIONALES PUEDEN SER USADOS PARA: I) INTERPRETAR UNA OBSERVACION EMPIRICA (EXPRESION GENICA, VARIACION, CAMBIOS EPIGENETICOS, ETC.) II) BUSCAR MARCADORES BASADOS EN MODULOS PARA IMPLEMENTAR UN NUEVO CONCEPTOS DE MEDICINA PERSONALIZADA BASADA EN LA FUNCION III) EN GENERAL, HIPOTETIZAR EL EFECTO DE UN CAMBIO EN EL SISTEMA (DISFUNCION/KO, SOBRE-EXPRESION U OTROS), PROPORCIONANDO ASI UNA HERRAMIENTA PARA LA BIOLOGIA SINTETICA III) EN PARTICULAR, ENCONTRAR CAMBIOS QUE REVIERTAN EN LO POSIBLE Y CON UN MINIMO DE EFECTOS SECUNDARIOS LA PERDIDA DE UNA FUNCION. LAS POSIBILIDADES DE INFERENCIA OFRECIDAS POR LOS MODELOS SE APLICARAN EN UN CONJUNTO DE ESCENARIOS QUE INCLUYEN: I) ENCONTRAR GENES CANDIDATOS BASADOS EN SU EFECTO SOBRE LA FUNCIONALIDAD ASOCIADA A LA ENFERMEDAD O EL RASGO ESTUDIADO, II) COMPRENDER LOS MECANISMOS DE ACCION DE LOS FARMACOS INTERPRETANDO LOS CAMBIOS DE PERFIL DE EXPRESION GENICA O EL ESPECTRO DE MUTACIONES. III) PREDECIR EL EFECTO COMBINADO DE VARIOS FARMACOS O SUS EFECTOS ADVERSOS, IV) SUGERIR CANDIDATOS PARA REPOSICIONAMIENTO DE FARMACOS AND V) ESTUDIAR GENES Y REGULADORES INVOLUCRADOS EN REPROGRAMACION CELULAREL PROYECTO REQUIERE DE UN ESFUERZO IMPORTANTE EN EL DESARROLLO DE SOFTWARE PARA EL ANALISIS DE DICHOS DATOS, QUE SERAN POSTERIORMENTE IMPLEMENTADOS EN EL DOMINIO PUBLICO. TAMBIEN SE EXPLORARAN TECNICAS COMO EL CLOUD O LAS GPU IOLOGIA DE SISTEMAS\EFECTOS SECUNDARIOS\REPOSICIONAMIENTO DE FARMACOS\REGULACION\PATHWAYS\MODELADO\MEDICINA PERSONALIZADA\MECANISMO DE ACCION\BIOLOGIA SINTETICA\GENES CANDIDATOS

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