Se solicita para el Servicio de Secuenciación de la USAL un equipo de ultrasecuenciacion genómica de última generación para abordar proyectos con múltiples aplicaciones punteras en los campos de la genómica y de la transcriptómica...
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Descripción del proyecto
Se solicita para el Servicio de Secuenciación de la USAL un equipo de ultrasecuenciacion genómica de última generación para abordar proyectos con múltiples aplicaciones punteras en los campos de la genómica y de la transcriptómica, como son:- Secuenciación de novo de genomas de hasta 3 Gigabases (3Gb)- Secuenciación de material genético de muestras fósiles- Secuenciación de transcriptomas a nivel completo (SAGE, CAGE, GIS, cDNAs) y perfiles de expresión,- Identificación y cuantificación de RNA de pequeños tamaño (hasta 200 pb), p,ej, miRNAs- Secuenciación de fragmentos de DNA asociadas a proteinas (ChIP-Seq),- Secuenciación masiva de amplicones de menos de 500 pb para descubrimiento de SNPs y pequeñas inserciones o deleciones (indels),- Ultrasecuenciación de amplicones para identificar variantes minoritarias en muestras complejas (detección de mutaciones somáticas en cáncer o quasiespecies virales),- Estudio de polimorfismos, SNPs, indels y variaciones estructurales en grandes regiones del genoma,- Estudios de metagenómica y biodiversidad,- Estudios en epigenómica, estudiando cambios de patrón de metilación,Con el equipo solicitado se pretende dotar al Servicio de Secuenciación de la USAL del equipamiento necesario para abordar proyectos innovadores y de excelencia que solamente son posibles con la tecnología de nueva generación, Los beneficiarios de este equipamiento son múltiples como se describe posteriormente,
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