TOMOGRAFIA ELECTRONICA: COMPUTACION Y APLICACION EN NEUROBIOLOGIA
EL OBJETIVO GLOBAL DE ESTE SUBPROYECTO ES EL DESARROLLO DE NUEVOS METODOS COMPUTACIONALES PARA EL PROCESAMIENTO E INTERPRETACION DE VOLUMENES TRIDIMENSIONAL (3D) OBTENIDOS POR TOMOGRAFIA ELECTRONICA Y SU APLICACION EN EL ESTUDIO D...
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Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2012-01-01
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Descripción del proyecto
EL OBJETIVO GLOBAL DE ESTE SUBPROYECTO ES EL DESARROLLO DE NUEVOS METODOS COMPUTACIONALES PARA EL PROCESAMIENTO E INTERPRETACION DE VOLUMENES TRIDIMENSIONAL (3D) OBTENIDOS POR TOMOGRAFIA ELECTRONICA Y SU APLICACION EN EL ESTUDIO DE LAS ALTERACIONES DE LA ARQUITECTURA SUBCELULAR EN PROCESOS NEURODEGENERATIVOS. LA TOMOGRAFIA ELECTRONICA (TE) ES UNA TECNICA QUE PERMITE OBTENER INFORMACION ESTRUCTURAL 3D DE LA CELULA A ESCALA NANOMETRICA, LO CUAL ES CLAVE PARA LA COMPRENSION DE LA FUNCION BIOLOGICA. LA TE SE BASA EN PRINCIPIOS SIMILARES A LOS DE LA TOMOGRAFIA COMPUTERIZADA COMUNMENTE USADA EN MEDICINA. A PARTIR DE IMAGENES OBTENIDAS DEL ESPECIMEN A DISTINTAS ORIENTACIONES ES POSIBLE OBTENER EL VOLUMEN 3D. LA COMPUTACION JUEGA UN PAPEL FUNDAMENTAL EN EL PROCESAMIENTO DE LAS IMAGENES, EL CALCULO DEL VOLUMEN 3D Y LA INTERPRETACION AUTOMATICA DEL MISMO. NUESTRO GRUPO CUENTA CON UN LARGO Y SOLIDO HISTORIAL DE DESARROLLO DE METODOS COMPUTACIONALES EN ESTE CAMPO ASI COMO SU APLICACION EN ESTUDIOS ESTRUCTURALES EN BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR. EL TRABAJO QUE SE PROPONE SE ABORDA DESDE TRES PERSPECTIVAS. EN PRIMER LUGAR, PRETENDEMOS CONTINUAR CON NUESTRA FRUCTIFERA LINEA DE DESARROLLO DE METODOS DE PROCESAMIENTO DE IMAGEN PARA LOS DISTINTOS PASOS COMPUTACIONALES INVOLUCRADOS EN TE. EN SEGUNDO LUGAR, CONTINUAREMOS DESARROLLANDO ESTRATEGIAS DE COMPUTACION DE ALTAS PRESTACIONES, CON ESPECIAL ATENCION A LAS NUEVAS PLATAFORMAS HIBRIDAS CPU+GPU, PARA AFRONTAR LOS PASOS COMPUTACIONALES MAS COSTOSOS DE LA TE. EN TERCER LUGAR, PRESENTAMOS UNA LINEA NUEVA DE TRABAJO CENTRADA PRINCIPALMENTE EN EL AMBITO BIOLOGICO Y QUE SURGE GRACIAS A LA INCORPORACION DEL INVESTIGADOR PRINCIPAL AL CENTRO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA (CSIC). AQUI APLICAMOS LA TE EN EL ESTUDIO DE LAS ALTERACIONES QUE SE PRODUCEN EN LA ARQUITECTURA SUBCELULAR EN PROCESOS NEURODEGENERATIVOS. EN ESTA LINEA DE TRABAJO ABORDAREMOS TODOS LOS PASOS INVOLUCRADOS EN LA TE, DESDE LA PREPARACION DE MUESTRAS HASTA LA INTERPRETACION DE LAS ALTERACIONES. LA COMPUTACION JUGARA UN PAPEL FUNDAMENTAL PARA EL PROCESAMIENTO E INTERPRETACION DE LOS RESULTADOS, EN PARTICULAR CON EL DESARROLLO DE ALGORITMOS PARA LA DETECCION DE LAS ALTERACIONES.