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DPI2015-66458-C2-2-R

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TOMOGRAFIA DE OBJETOS DE FASE Y VISUALIZACION DE IMAGENES BIOMEDICAS TRIDIMENSIO...

TOMOGRAFIA DE OBJETOS DE FASE Y VISUALIZACION DE IMAGENES BIOMEDICAS TRIDIMENSIONALES EN TIEMPO REAL EL LIGHTFIELD DE UNA ESCENA (LA INFORMACION RELATIVA AL CONJUNTO DE RAYOS PRESENTES) PUEDE SER CAPTURADO, POR EJEMPLO, MEDIANTE UN SENSOR PLENOPTICO, INTERCALANDO UN ARRAY DE MICROLENTES ENTRE EL OBJETIVO Y EL SENSOR, UNA SIMPLE... ver más

01/01/2015

ULL

178K€

Presupuesto del proyecto: 178K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 679

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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ULL

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 679

Presupuesto del proyecto 178K€

Descripción del proyecto EL LIGHTFIELD DE UNA ESCENA (LA INFORMACION RELATIVA AL CONJUNTO DE RAYOS PRESENTES) PUEDE SER CAPTURADO, POR EJEMPLO, MEDIANTE UN SENSOR PLENOPTICO, INTERCALANDO UN ARRAY DE MICROLENTES ENTRE EL OBJETIVO Y EL SENSOR, UNA SIMPLE RECOMPOSICION DE LA IMAGEN PUEDE GENERAR LA IMAGEN INTEGRAL, DESDE LA QUE ES POSIBLE, TRABAJANDO UNICAMENTE EN INTENSIDAD, REENFOCAR A POSTERIORI DE LA ADQUISICION, GENERAR UNA IMAGEN COMPLETAMENTE ENFOCADA (EN CONSECUENCIA AUMENTAR LA PROFUNDIDAD OPTICA DEL MICROSCOPIO), GENERAR UN MAPA DE PROFUNDIDADES DE LA ESCENA, GENERAR UNA IMAGEN 3D ESTEREO, GENERAR UNA IMAGEN 3D INTEGRAL, ETC, PERO TAMBIEN ES POSIBLE, EN PRESENCIA DE CAMBIOS DE INDICE DE REFRACCION (OBSERVANDO A TRAVES DE UN TEJIDO BIOLOGICO TRANSPARENTE,) AVERIGUAR LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEL MISMO HACIENDO TOMOGRAFIA DE FASE (J,M, TRUJILLO-SEVILLA ET AL, 2013), EN MICROSCOPIA, SI LOS OBJETOS SON DE FASE, SU TRANSPARENCIA SOLO LOS HARA DETECTABLES DE MANERA INDIRECTA Y A TRAVES DE LOS CAMBIOS DE INDICE DE REFRACCION QUE PROVOCAN (CAMBIOS DE FASE), LA OBSERVACION DIRECTA Y DETECCION DE OBJETOS DE FASE ILUMINANDO CON LUZ INCOHERENTE EVITA LA NECESIDAD DE PREPARAR LA MUESTRA PARA HACER USO DE FLUORESCENCIA Y TRABAJAR EN REGIMEN DE INTENSIDAD, EN CUYO CASO LA MUESTRA PODRIA ESTAR VIVA Y SER ANALIZADA EN TIEMPO REAL, ADEMAS, LAS MUESTRAS PREPARADAS PARA FLUORESCENCIA TIENEN UN TIEMPO DE USO LIMITADO A 50 O 100 EXPOSICIONES,LA DESVENTAJA ESENCIAL DEL SENSOR PLENOPTICO ES LA PERDIDA DE RESOLUCION BIDIMENSIONAL, LIMITADA OPTICAMENTE A LA PROPORCIONADA POR EL PEQUEÑO RADIO DE LAS MICROLENTES DEL ARRAY, SI PARTIMOS DE UN FOCAL STACK DE LA ESCENA ADQUIRIDO EN TIEMPO REAL, HACIENDO USO DE POR EJEMPLO DE LENTES LIQUIDAS, CON TODO EL DIAMETRO DEL OBJETIVO MICROSCOPICO, EL LIGHTFIELD ASOCIADO SE GENERA SIN PERDIDA ALGUNA DE RESOLUCION OPTICA (RODRIGUEZ-RAMOS ET AL, 2015), POR OTRO LADO, A PARTIR DE SOLO DOS PLANOS DESENFOCADOS, UN SENSOR GEOMETRICO PUEDE OFRECER LA FASE DE FRENTE DE ONDA EN PUPILA, SI DISPONEMOS DE TODO EL FOCAL STACK DE LA ESCENA, LA RECUPERACION DE LA FASE SE PODRA REALIZAR TOMOGRAFICAMENTE CON LUZ INCOHERENTE Y SIN NECESITAD DE INTERFERENCIA CON OTRA SEÑAL DE FASE CONOCIDA, EN DEFINITIVA, PARTIENDO DEL FOCAL STACK ES POSIBLE REALIZAR IMAGEN 3D INTEGRAL TANTO EN INTENSIDAD COMO EN FASE, PERO MANTENIENDO TODA LA RESOLUCION OPTICA BIDIMENSIONAL, CARACTERISTICA ESENCIAL EN MICROSCOPIA, ALIMENTAR UN DISPLAY INTEGRAL QUE PERMITIESE OBSERVAR LA MUESTRA EN TIEMPO REAL EXIGE QUE ESTOS ALGORITMOS DEBAN SER OPTIMIZADOS E IMPLEMENTADOS EN HARDWARE ELECTRONICO ESPECIALIZADO, EN ESTE SENTIDO, NUESTRA PROPUESTA ES EL USO DE TARJETAS GRAFICAS O GPUS, PROGRAMADAS EN CUDA U OPENCL, HEMOS SIDO LOS PIONEROS DE LA APLICACION DE LAS GPUS A LA OPTICA ADAPTATIVA EN ASTRONOMIA, TODA LA FORMACION Y LA EXPERIENCIA QUE EN LOS APARTADOS INFORMATICO Y ELECTRONICO ATESORA EL EQUIPO DE INVESTIGACION DE LA ULL SE PONDRA AL SERVICIO DEL PROYECTO COORDINADO QUE CON ILUSION ABORDAMOS JUNTO A LA UNIVERSIDAD DE VALENCIA,PARA DEMOSTRAR DE MANERA FIDEDIGNA QUE NUESTRO PROYECTO ES REALMENTE UTIL PARA LA BIOMEDICINA, NOS HEMOS DOTADO DE LA PRESENCIA DEL BIOLOGO ANGEL ACEBES, QUIEN SUMINISTRARA MUESTRAS REALES Y PUBLICARA RESULTADOS ASOCIADOS A LAS NUEVAS TECNICAS QUE AHORA ABORDAMOS, - J,M, TRUJILLO-SEVILLA ET AL, TOMOGRAPHIC MICROSCOPY USING A PLENOPTIC SENSOR, PROCEEDING IEEE WIO2013,- J, M, RODRIGUEZ-RAMOS ET AL , PATENTE EN ESPAÑA Nº P201431900 LIGHTFIELD\TOMOGRAFÍA DE FASE\SENSADO DE FRENTE DE ONDA\DISPLAY 3D\ÓPTICA ADAPTATIVA\TARJETAS GRÁFICAS\CUDA\IMAGEN BIOMÉDICA\MICROSCOPÍA 3D

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