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The evolutionary significance of synonymous variations Can codon usage preferen...

The evolutionary significance of synonymous variations Can codon usage preferences drive the propagation of antibiotic resistance? The intensive use of antibiotics provided an unprecedented improvement in infectious disease treatments but at the expense of creating ideal conditions for the selection of widespread resistance. Propagation of antibiotic resistan... ver más

31/05/2022

CNRS

2M€

Presupuesto del proyecto: 2M€

Líder del proyecto

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 2 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2022-05-31

ERC-CoG-2015: ERC Consolidator Grant

I+D

Cerrada hace 9 años

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2 Participantes

CNRS

1.99M€ | Lider

VALL COMPANYS

930.36K€ | Participante

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Duración del proyecto: 73 meses Fecha Inicio: 2016-04-13
Fecha Fin: 2022-05-31

Líder del proyecto

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 2M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto The intensive use of antibiotics provided an unprecedented improvement in infectious disease treatments but at the expense of creating ideal conditions for the selection of widespread resistance. Propagation of antibiotic resistances is favoured by horizontal gene transfer and by bacterial life in multispecies community. However, compositions of resistome and bacterial communities are often correlated, suggesting that propagation of resistances does not occur at random. This project will test the hypothesis that mismatch in codon preferences between the transferred genes and the receiving genome is a fundamental factor shaping resistome structure and evolution. Such central role of codon preferences may have been hitherto overlooked. The project combines mutant collection characterization, experimental evolution approaches –one in a multispecies context and one in a variable environment context-, full genome sequencing of evolved populations, phylogenomics and mathematical modelling integrating the experimental results of the other approaches, and generating a predictive tool about the evolutionary outcome of various real-life situations.

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