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Structural Variation and Adaptation of the Stickleback Genome

The project on ‘structural variation and adaptation of the stickleback genome’ is aiming to characterise structural variation (SV) such as deletions, insertions, duplications, translocations, and inversions within and between five... ver más

28/02/2013

WWU

30K€

Presupuesto del proyecto: 30K€

Líder del proyecto

Westfälische Wilhelms-Universität Münster No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo FP7 notifico la concesión del proyecto el día 2013-02-28 No tenemos la información de la convocatoria

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1 Participantes

WWU

30.00K€ | Lider

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Líder del proyecto

Westfälische Wilhelms-Universität Münster No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Presupuesto del proyecto 30K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto The project on ‘structural variation and adaptation of the stickleback genome’ is aiming to characterise structural variation (SV) such as deletions, insertions, duplications, translocations, and inversions within and between five geographically distinct lake-river population comparisons of the three-spined stickleback. Evaluating multiple parallel adaptations will infer the influence of SV on local adaptation and divergence in this prime study system for ecological speciation, adaptive radiation, and ecological genomics. Aim of this project is to develop a computational approach for the detection of SV from whole genome short read paired-end sequencing data. The computational approach will be further assessed in the laboratory. After building a comprehensive map of SV within and between stickleback populations, the role of SV for ecological speciation will be evaluated. Therefore molecular evolution and linkage pattern in the genomic regions affected by SV will be considered. Aim of the project is to contribute to the discussion about the adaptive role of SV of the genome.

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