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Structural and functional characterization of large viral and human non coding R...

Structural and functional characterization of large viral and human non coding RNA motifs involved in HIV infection HIV infections cause 1.2Mi deaths/year worldwide at steadily-increasing rates, partly because of antiretroviral resistance and the impossibility of eradicating latent viruses. To expand our understanding of HIV pathogenesis, we ne... ver más

31/08/2020

EMBL

159K€

Presupuesto del proyecto: 159K€

Líder del proyecto

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2020-08-31

MSCA-IF-2016: Individual Fellowships

I+D

Cerrada hace 8 años

0% 100%

Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

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1 Participantes

EMBL

159.46K€ | Lider

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Duración del proyecto: 40 meses Fecha Inicio: 2017-04-19
Fecha Fin: 2020-08-31

Líder del proyecto

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Presupuesto del proyecto 159K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto HIV infections cause 1.2Mi deaths/year worldwide at steadily-increasing rates, partly because of antiretroviral resistance and the impossibility of eradicating latent viruses. To expand our understanding of HIV pathogenesis, we need to unravel all molecular mechanisms involved in HIV progression. Large viral and human RNAs are emerging as key players in HIV infection. To characterize such RNAs, I will employ an integrated structural biology approach complemented by biochemical and functional assays in vitro and in vivo and I will address two fundamental questions: 1. How does the structure of HIV genomic RNA regulate HIV infectivity? HIV genomic RNA regulates nuclear export, packaging, splicing, and translation of viral proteins. 3D structures are known for short motifs (<200 nt), e.g. TAR and RRE. Such motifs are part of 11 larger domains (>400 nt), whose structures are unknown but conserved across HIV strains suggesting functional importance. We will study domain 2 (450 nt), which encompasses the gag-pol frameshifting motif and is crucial for correct protein synthesis. Our work will offer unprecedented insights into the structural complexity of the genome of an RNA virus. 2. How does the structure of human long non-coding RNAs (lncRNAs) affect the host-cell response to HIV infection? HIV infections alter expression of human lncRNAs, e.g. HOTAIR, which regulate Polycomb chromatin remodeling enzymes, e.g. PRC1/PRC2, favoring epigenetic silencing and latency of HIV genes. Interactions between HOTAIR and PRC1/PRC2 are not well characterized at the molecular level. We will study HOTAIR domain 1 (530 nt), which interacts with PRC1/PRC2 and regulates their cellular action. Such work will reveal novel mechanisms of epigenetic gene-silencing that induce HIV latency. By revealing molecular details of HIV and human RNAs, our study will enrich our understanding of HIV infectivity, potentially opening new ways for future therapies against RNA viruses.

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