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Small RNA regulation of the body plan and epigenome in Arabidopsis embryos

Small RNAs are short non-coding RNAs that regulate gene expression in plants and animals. Although small RNAs are essential for proper differentiation and epigenome regulation, little is known regarding their embryonic functions,... ver más

30/06/2020

GMI

1M€

Presupuesto del proyecto: 1M€

Líder del proyecto

GREGOR MENDEL INSTITUT FUR MOLEKULARE PFLANZE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 2 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2020-06-30

ERC-StG-2014: ERC Starting Grant Scope:Objectives

I+D

Cerrada hace 11 años

0% 100%

Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

Información adicional privada

No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

2 Participantes

GMI

1.50M€ | Lider

JULIAN MARTIN

269.94K€ | Participante

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Duración del proyecto: 60 meses Fecha Inicio: 2015-06-20
Fecha Fin: 2020-06-30

Líder del proyecto

GREGOR MENDEL INSTITUT FUR MOLEKULARE PFLANZE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 1M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Small RNAs are short non-coding RNAs that regulate gene expression in plants and animals. Although small RNAs are essential for proper differentiation and epigenome regulation, little is known regarding their embryonic functions, especially in plants. Arabidopsis thaliana is a leading system to study the regulatory roles of small RNAs because of the abundance of genetic, genomic and epigenomic resources. Moreover, Arabidopsis embryos undergo invariant division patterns and rapidly differentiate to generate the most basic plant cell-types arranged in correct positions. Early Arabidopsis embryos are therefore morphologically simple structures composed of diverse cell types making them ideal for determining the influence of small RNAs on fundamental cellular differentiation and reprogramming events. The objectives of the proposed research are designed to assess the regulatory roles of small RNAs in establishing both the basic body plan and epigenome in plant embryos. We will utilize modified next-generation sequencing technologies to identify small RNAs present in developing embryos. Because we will generate these RNA profiles from a mixture of cell-types, we will also use a fluorescent protein-based approach to quantify specific miRNA repressive activities in individual cell-types. To determine the functions of individual miRNA/target interactions during embryogenesis, we will identify miRNAs required for embryo development and use genome-wide approaches to study specific miRNA/target interactions in greater detail. Lastly, we will use a fusion of genetic and genomic methods to determine how small RNAs influence the nascent epigenome during early embryogenesis.

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