Descripción del proyecto
LA IDEA UNIFICADORA DE ESTA PROPUESTA ES EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS PEPTIDICAS PARA EL RECONOCIMIENTO ESPECIFICO BIOMOLECULAR, ESTE CONCEPTO GENERAL SE CONCRETA EN DOS TAREAS COMPLEMENTARIAS (WP) ENFOCADAS HACIA DIFERENTES OBJETIVOS Y DIANAS MOLECULARES, WP1 ES, ESENCIALMENTE, LA CONTINUACION DE NUESTRO PROYECTO PREVIO CTQ2012-31341, CENTRADO EN EL DESARROLLO DE NUEVOS AGENTES DE UNION AL ADN, INCLUYENDO METALOPEPTIDOS AUTOENSAMBLADOS (HELICATOS PEPTIDICOS) Y MOLECULAS PEQUEÑAS; WP2 DESCRIBE UNA NUEVA LINEA DE TRABAJO QUE COMBINA NUESTRA EXPERIENCIA EN QUIMICA SUPRAMOLECULAR, DISEÑO DE PEPTIDOS Y RECONOCIMIENTO BIOMOLECULAR CON METODOS DE QUIMICA COMBINATORIA DINAMICA (DCC), NUESTRO OBJETIVO EN ESTE WP ES EXPLORAR LA DCC DE MINIPROTEINAS OLIGOMERICAS PARA LA SELECCION DE RECEPTORES DE ALTA AFINIDAD SIMILAR A LOS ANTICUERPOS, Y LA IDENTIFICACION DE PROTEINAS AUTOENSAMBLADAS CON FUNCIONALIDAD DESEADA,WP1 - RECONOCIMIENTO DE ADN CON COMPUESTOS DE COORDINACION Y MOLECULAS PEQUEÑAS, ESTE WP SE ORGANIZA EN DOS TAREAS; LA PRIMERA (WP1,1) SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE COMPLEJOS DE COORDINACION DERIVADOS DE BISBENZAMIDINAS, COMO LOS PRIMEROS EJEMPLOS DE COMPLEJOS METALICOS QUE SE UNAN POR INSERCION EN EL SURCO MENOR DEL ADN, ESTOS COMPLEJOS COMBINAN LA SELECTIVIDAD DE SECUENCIA DE LAS BISBENZAMIDINAS CON LAS OPORTUNIDADES PARA EL DISEÑO Y MODULACION DE PROPIEDADES QUE OFRECEN LOS COMPLEJOS METALICOS, EN ESTE MISMO WP ESTUDIAREMOS TAMBIEN OLIGOMEROS DE BISBENZAMIDINAS, QUE MUESTRAN EFECTOS COOPERATIVOS EN SU RECONOCIMIENTO DEL ADN Y PODRIAN UNIRSE A SECUENCIAS REPETIDAS DE ADN GENOMICO RELEVANTES EN ALGUNAS ENFERMEDADES DEGENERATIVAS, E INCLUSO ENCONTRAR APLICACIONES COMO AGENTES PARA CAPTURA DE ADN CIRCULANTE, POR OTRA PARTE, LAS TAREAS ENGLOBADAS EN WP1,2 PROPONEN EL ESTUDIO DE LAS PROPIEDADES DE COMPLEJOS BIMETALICOS SUPRAMOLECULARES (HELICATOS) QUE, A PESAR DE SUS PROMETEDORAS PROPIEDADES, TODAVIA NO SE HAN DESARROLLADO COMO ALTERNATIVAS A LOS AGENTES USADOS ACTUALMENTE EN QUIMIOTERAPIA DEBIDO EN PARTE A LOS PROBLEMAS ASOCIADOS A SU SINTESIS, APLICAREMOS LA ESTRATEGIA SINTETICA DESARROLLADA EN NUESTRO GRUPO PARA LA EXPLORACION DEL ESPACIO FUNCIONAL/ESTRUCTURAL/QUIMICA DE ESTAS ESPECIES Y LA OPTIMIZACION DE SUS PROPIEDADES BIOLOGICAS, WP2 - DISEÑO BOTTOM-UP DE MINIPROTEINAS OLIGOMERICAS, EN ESTE WP APROVECHAMOS LA SIMPLICIDAD ESTRUCTURAL DE OLIGOPROTEINAS SIMETRICAS PARA COMBINAR LOS SISTEMAS PROTEICOS DE ALTA COMPLEJIDAD FUNCIONAL CON LA SIMPLICIDAD DE LA SINTESIS EN FASE SOLIDA DE PEPTIDOS, HEMOS ORGANIZADO ESTE WP EN DOS TAREAS DIFERENTES, DE ACUERDO AL SISTEMA OLIGOMERICO SELECCIONADO Y A LAS POTENCIALES APLICACIONES, EN WP2,1 DELIMITAREMOS EL POTENCIAL DE UNA PEQUEÑA PROTEINA VIRAL HOMOTRIMERICA, EL FOLDON DE T4 FIBRITINA (T4FF), COMO SOPORTE ESTRUCTURAL PARA EL DISEÑO DE PROTEINAS, MAS CONCRETAMENTE, MODIFICAREMOS LAS INTERACCIONES ENTRE LOS DOMINIOS PARA OBTENER HETEROTRIMEROS; MODIFICAREMOS EL NUCLEO HIDROFOBICO PARA OBTENER TAGS FLUORESCENTES Y AGENTES DE CONTRASTE PARA MRI, Y EXPLORAREMOS LA APLICACION DE LIBRERIAS COMBINATORIAS PARA DESCUBRIR RECEPTORES DE ALTA AFINIDAD CON APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS, EN WP2,2 ESTUDIAREMOS PROTEINAS HEXAMERICAS, DE MANERA QUE A TRAVES DE LA MODIFICACION RACIONAL DE LAS UNIDADES MONOMERICAS SE PUEDAN OBTENER PROTEINAS PARA APLICACIONES CONCRETAS, COMO UNION DE NANOTUBOS, CATALISIS METALICAS, UNION A MEMBRANAS, ETC, QUÍMICA SUPRAMOLECULAR\AUTOENSAMBLAJE\QUÍMICA COMBINATORIA DINÁMICA\RECONOCIMIENTO DE ADN\RECEPTORES MOLECULARES\DISEÑO DE PROTEÍNAS\SENSORES FLUORESCENTES