Descripción del proyecto
LOS COMPUESTOS AROMATICOS SON ABUNDANTES EN LA NATURALEZA Y CON FRECUENCIA SON LIBERADOS AL MEDIO AMBIENTE DESDE FUENTES NATURALES Y COMO CONSECUENCIA DE LA ACTIVIDAD INDUSTRIAL. MUCHOS DE ELLOS SON TOXICOS Y DAÑINOS PARA LA SALUD Y EL MEDIO AMBIENTE. LOS ESFUERZOS INTERNACIONALES PARA MEJORAR LAS ESTRATEGIAS DE BIO-REMEDIACION APUNTAN A LOS PROCESOS BIOLOGICOS MEDIADOS POR BACTERIAS. ESTO REQUIERE UNA PROFUNDA INVESTIGACION PREVIA PARA ENTENDER COMO LAS BACTERIAS PUEDEN DEGRADAR ESTOS COMPUESTOS. ACTUALMENTE, EL CONOCIMIENTO SOBRE LA DEGRADACION AEROBIA DE CONTAMINANTES ES MUCHO. SIN EMBARGO EN MUCHAS DE LAS ZONAS CONTAMINADAS NO HAY OXIGENO, Y SOLO SE PUEDEN CONSIDERAR PROCESOS BASADOS EN BACTERIAS ANAEROBIAS. EL CONOCIMIENTO DE LAS RUTAS DE DEGRADACION ANAEROBIA DE COMPUESTOS AROMATICOS SE LIMITA A LAS RUTAS PRINCIPALES DE GRADACION DE MONO-AROMATICOS. AUN SE NECESITAN ESFUERZOS IMPORTANTES PARA ENTENDER LOS MECANISMO MOLECULARES DE LA DEGRADACION DE AROMATICOS MAS COMPLEJOS Y LAS RUTAS ALTERNATIVAS. LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO ES AUMENTAR EL CONOCIMIENTO SOBRE LA DEGRADACION ANAEROBIA DE AROMATICOS POLICICLICOS (PAHS) Y DE COMPUESTOS FENOLICOS, E IMPLEMENTAR ESTRATEGIAS DE BIO-REMEDIACION BASADAS EN LA INOCULACION DE MICROORGANISMOS ANAEROBIOS AUTOCTONOS AISLADOS PREVIAMENTE CON CAPACIDADES BIODEGRADADORAS (BIOAUMENTO). EL PROYECTO SE BASA EN LA DISPONIBILIDAD DE UNA COLECCION DE CEPAS ANAEROBIAS AISLADAS PREVIAMENTE CAPACES DE DEGRADAR ESTOS COMPUESTOS. 1) SE UTILIZARA UNA CEPA MODELO NITRATO-REDUCTORA (NRB) PARA IDENTIFICAR LA RUTA DE DEGRADACION DE NAFTALENO ASOCIADA A LA RESPIRACION DE NITRATO. SE OBTENDRAN EL GENOMA Y EL TRANSCRIPTOMA INDUCIDO CON NAFTALENO DE LA CEPA PARA IDENTIFICAR LOS GENES DE DEGRADACION. SIMULTANEAMENTE SE RASTREARAN VARIAS LIBRERIAS GENOMICAS Y METAGENOMICAS EN BUSCA DE SECUENCIAS RELACIONADAS CON LA DEGRADACION DE NAFTALENO, PARA VALORAR LA PRESENCIA Y DIVERSIDAD DE ESTA RUTA EN LA NATURALEZA. SE APLICARA TAMBIEN UNA APROXIMACION BASADA EN EL MARCAJE CON ISOTOPOS ESTABLES A UN BIOFILM DESARROLLADO EN LA INTERFASE AGUA-PETROLEO DE UN ACUIFERO CONTAMINADO PARA ENRIQUECER E IDENTIFICAR NUEVOS GENES PARA EL METABOLISMO DE NAFTALENO. DETERMINAREMOS EL RENDIMIENTO DE LAS MEJORES CEPAS DE NUESTRA COLECCION EN MICROCOSMOS ANAEROBIOS CONTAMINADOS CON NAFTALENO, Y SE IMPLEMENTARAN PROTOCOLOS DE BIOAUMENTO. 2) HEMOS IDENTIFICADO LOS GRUPOS DE GENES PARA LA OXIDACION ANAEROBIA DE DIHIDROXIBENCENO (RESORCINOL) Y 3,5-DIHIDROXIBENZOATO EN LA BACTERIA NRB AZOARCUS ANAEROBIUS Y THAUERA AROMATICA AR1, RESPECTIVAMENTE. LA EXPRESION DE AMBAS RUTAS DEPENDE DE LA PRESENCIA DE SUSTRATO. SE LLEVARA A CABO UN ANALISIS MOLECULAR Y BIOQUIMICO EXHAUSTIVO PARA IDENTIFICAR LOS GENES DE LOS PASOS PRINCIPALES DE LA RUTA Y LOS GENES REGULADORES, Y PARA DESCIFRAR LOS MECANISMOS REGULADORES RESPONSABLES DE LA EXPRESION DE LAS RUTAS. SE PONDRA UN ENFASIS ESPECIAL EN LA CONEXION ENTRE LA REGULACION ESPECIFICA DEPENDIENTE DE EFECTOR Y LA REGULACION GLOBAL DEPENDIENTE DE LA ACTIVIDAD RESPIRATORIA. FINALMENTE, SE EVALUARA LA RELEVANCIA DE ESTAS NUEVAS RUTAS EN LA NATURALEZA. IODEGRADACION ANAEROBIA\DESNITRIFICACION\SIGMA-54\REGULACION DE LA TRANSCRIPCION\TRANSCRIPTOMICA\NAFTALENO\3.5-DIHIDROXIBENZOATO\RESORCINOL\PAHS