PDC2022-133020-I00
Financiado
SISTEMAS DINAMICOS Y MATEMATICA COMPUTACIONAL PARA LA OPTIMIZACION DE PARTICULAS...
SISTEMAS DINAMICOS Y MATEMATICA COMPUTACIONAL PARA LA OPTIMIZACION DE PARTICULAS INTERFERENTES TERAPEUTICAS COMO TERAPIA ANTIVIRAL
EXISTE UNA GRAN NECESIDAD DE RESPONDER EFICAZMENTE A LOS NUEVOS VIRUS EMERGENTES. BASANDONOS EN LA INTERACCION ENTRE LA MODELIZACION MATEMATICA Y LA VIROLOGIA EXPERIMENTAL, PROPONEMOS EL DESARROLLO DE UNA NOVEDOSA TECNOLOGIA DE OP...
EXISTE UNA GRAN NECESIDAD DE RESPONDER EFICAZMENTE A LOS NUEVOS VIRUS EMERGENTES. BASANDONOS EN LA INTERACCION ENTRE LA MODELIZACION MATEMATICA Y LA VIROLOGIA EXPERIMENTAL, PROPONEMOS EL DESARROLLO DE UNA NOVEDOSA TECNOLOGIA DE OPTIMIZACION PARA GENERAR PARTICULAS INTERFERENTES TERAPEUTICAS (TIPS) DE GRAN EFICACIA. LAS TIPS SERIAN VERSIONES OPTIMIZADAS DE LAS PARTICULAS INTERFERENTES DEFECTUOSAS (DIPS) QUE SE PRODUCEN DE FORMA NATURAL. LAS DIPS SON FORMAS DEGENERADAS E INCOMPLETAS DE GENOMAS VIRALES QUE NO SE REPLICAN POR SI MISMAS, PERO QUE SIGUEN SIENDO INFECCIOSAS POR COMPLEMENTACION CON EL VIRUS DE TIPO SALVAJE (WT). LOS DIPS, DESCRITOS HACE UNOS 70 AÑOS, SON PRODUCTOS INEVITABLES DE LA REPLICACION DE LOS VIRUS DE ARN, PROPENSA A ERRORES, Y SE ENCUENTRAN EN CASI TODOS LOS TIPOS DE VIRUS. LOS DIPS JUEGAN UN PAPEL EN LA MODULACION DE LA VIRULENCIA Y LAS RESPUESTAS INMUNES, Y PUEDEN SER SELECCIONADOS ARTIFICIALMENTE O DISEÑADOS PARA SUPRIMIR FUERTEMENTE LA REPLICACION DEL VIRUS WT. DE HECHO, INVESTIGACIONES RECIENTES SOBRE LAS TIP DEL SARS-COV-2 HAN DEMOSTRADO SU EFECTO DE INTERFERENCIA EN MODELOS ANIMALES, FRENANDO LA INFECCION DEL VIRUS EN LOS PULMONES. LOS TIPS OFRECEN MULTITUD DE VENTAJAS SOBRE LOS ENFOQUES ANTIVIRALES CONVENCIONALES: SON TRANSMISIBLES EN PRESENCIA DEL VIRUS WT Y CAPACES DE PROPAGARSE A LO LARGO DE EL PARA DIRIGIRSE ESPECIFICAMENTE A LAS CELULAS INFECTADAS; LA PROTECCION MEDIADA POR LOS TIPS ES EFECTIVA DE FORMA INMEDIATA; Y LOS TIPS SON TRANSCRIPCIONALMENTE INACTIVOS Y NO REPLICANTES PER SE, LO QUE LIMITA LOS EFECTOS SECUNDARIOS. TIPSAVIR PRETENDE PROPORCIONAR UNA NUEVA TECNOLOGIA DEDICADA A LA OPTIMIZACION DE LAS TIPS, COMBINANDO LA MODELIZACION MATEMATICA, LAS MATEMATICAS COMPUTACIONALES Y LAS PRUEBAS EXPERIMENTALES DE LOS RESULTADOS. EL PROYECTO SE BASA EN LA INVESTIGACION REALIZADA EN EL PROYECTO RTI2018-098322-B-I00, Y TIENE TRES OBJETIVOS PRINCIPALES: (I) LA MODELIZACION MATEMATICA Y LA SIMULACION COMPUTACIONAL DE LA DINAMICA ECO-EVOLUTIVA DE GENOMAS DE VIRUS COMPLETOS BAJO LA GENERACION DE DIPS; (II) LA OPTIMIZACION COMPUTACIONAL DE DIPS PARA OBTENER TIPS CON UN PODER DE INTERFERENCIA ALTISIMO MEDIANTE EL USO DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL; Y (III) EXPERIMENTOS EN CULTIVOS CELULARES UTILIZANDO CORONAVIRUS PARA PROBAR EL RESULTADO DE LOS RESULTADOS OBTENIDOS DE LOS PUNTOS (I) Y (II). ESTA TECNOLOGIA POTENCIAL PODRIA SER UNIVERSAL Y FACILMENTE EXTENSIBLE A CUALQUIER TIPO DE VIRUS. EL OBJETIVO PRINCIPAL DE TIPSAVIR ES DISEÑAR Y DESPLEGAR UNA PLATAFORMA PARA OBTENER DIPS ALTAMENTE INTERFERENTES COMO TERAPIAS ANTIVIRALES, BASADA EN LA SIMULACION DE LA DINAMICA EVOLUTIVA DE GENOMAS COMPLETOS VALIDADA CON EXPERIMENTOS IN VITRO. EL NUCLEO DE LA PLATAFORMA SERA UN ALGORITMO CAPAZ DE INVESTIGAR LA DINAMICA DE LOS DIPS A UN NIVEL DE DETALLE IMPREVISTO CONSIDERANDO SIMULACIONES DE GENOMAS COMPLETOS. EN CONCRETO, NUESTRO ENFOQUE SERVIRA PARA DESVELAR LOS MECANISMOS ECO-EVOLUTIVOS MAS RELEVANTES DE LA PRODUCCION DE DIPS PARA OPTIMIZAR COMPUTACIONALMENTE SU PODER DE INTERFERENCIA, PARA LUEGO PROBAR LOS RESULTADOS DEL MODELO EXPERIMENTALMENTE Y EVALUAR SU EFECTO DE INTERFERENCIA SOBRE LA REPLICACION Y PROPAGACION DEL VIRUS WT.
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2022-01-01
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
115K€
Líder del proyecto
CONSORCI CENTRE DE RECERCA MATEMATICA
Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas otros tipos
Perfil tecnológico
TRL
4-5
Perfil tecnológico
TRL
4-5