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PID2021-122187NB-C33

Financiado

SIMULACION MULTIESCALA DE ORGANULOS SIN MEMBRANA PARA LA CAPTACION DE NANOESTRUC...

SIMULACION MULTIESCALA DE ORGANULOS SIN MEMBRANA PARA LA CAPTACION DE NANOESTRUCTURAS NOVEDOSAS LA COMPARTIMENTALIZACION DEBIDO A LA AUTOAGREGACION MOLECULAR ES FUNDAMENTAL EN EL FUNCIONAMIENTO DE SISTEMAS BIOLOGICOS EN LOS QUE TIENEN DISTINTAS Y COMPLEMENTARIAS FUNCIONALIDADES. UNA DE ESTAS ES LA DE PROPORCIONAR MICRODOMINI... ver más

01/01/2021

URV

61K€

Presupuesto del proyecto: 61K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD ROVIRA I VIRGILI No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 7

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01

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Participantes

URV

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD ROVIRA I VIRGILI

Total investigadores 7

Presupuesto del proyecto 61K€

Descripción del proyecto LA COMPARTIMENTALIZACION DEBIDO A LA AUTOAGREGACION MOLECULAR ES FUNDAMENTAL EN EL FUNCIONAMIENTO DE SISTEMAS BIOLOGICOS EN LOS QUE TIENEN DISTINTAS Y COMPLEMENTARIAS FUNCIONALIDADES. UNA DE ESTAS ES LA DE PROPORCIONAR MICRODOMINIOS QUE PERMITEN LA SEGREGACION DE DISTINTOS COMPUESTOS Y FUNCIONES BIOLOGICOS. LOS ORGANISMOS VIVOS USAN ESTAS MICROESTRUCTURAS PARA AYUDAR A CONTROLAR REACCIONES PARA LA PRODUCCION DE LAS MOLECULAS REQUERIDAS Y PARA SU ALMACENAMIENTO. ES DE PARTICULAR INTERES PARA ESTE PROYECTO LA FORMACION Y EL CONTROL DE LOS LLAMADOS ORGANULOS SIN MEMBRANA (MLO), PRESENTES EN CELULAS EUCARIOTAS. LA SEGREGACION ESPONTANEA DE MLOS SE BASA EN LA SEPARACION DE FASE LIQUIDO-LIQUIDO (LLPS), QUE ES UN FENOMENO BIEN CONOCIDO Y MODELADO EN QUIMICA FISICA. ESTAS MICROESTRUCTURAS SON MUY DINAMICAS Y APARECEN CUANDO LAS CONCENTRACIONES DE LOS COMPONENTES PRINCIPALES, USUALMENTE MEZCLAS DE PROTEINAS Y ACIDOS NUCLEICOS, SE SITUAN POR ENCIMA DE SU LIMITE DE SOLUBILIDAD, POR EJEMPLO, CUANDO LA CELULA SE HALLA BAJO CONDICIONES DE ESTRES.EL ROL DE LOS MLOS ESTA SIENDO INVESTIGADO UTILIZANDO EL CONCEPTO DE LAS LLPS, QUE AYUDA A LOS INVESTIGADORES A ENTENDER MEJOR LAS OBSERVACIONES EXPERIMENTALES, Y ORIENTAR SU USO HACIA APLICACIONES MEDICAS COMO LA ADMINISTRACION LOCALIZADA DE FARMACOS. MIENTRAS QUE LOS MLOS PROPORCIONAN UN ENTORNO ACUOSO EN SU INTERIOR, UNA COMPARTIMENTALIZACION QUE INCORPORE UN MEDIO LIPOFILICO SE PUEDE INCORPORAR DE MODO ARTIFICIAL, CON EL FIN DE ALMACENAR FARMACOS U OTRAS MOLECULAS DE CARACTER MAS HIDROFOBICO. EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS MODELIZAR LA ABSORCION DE DOS NUEVOS VEHICULOS DE TRANSPORTE DE FARMACOS EN LOS MLOS, ASI COMO LA TRANSFERENCIA DE LOS COMPONENTES ACTIVOS ALMACENADOS EN LOS VEHICULOS. ESTOS DOS VEHICULOS SON COLOIDES CRISTALINOS DE ESTRUCTURAS ORGANICAS COVALENTES (COF COLOIDALES), ASI COMO PARTICULAS DE CRISTAL LIQUIDO POLIMERICO (LCP), ESTO ES, HEXOSOMAS Y CUBOSOMAS.EN ESTE SUBPROYECTO PROPONEMOS COMBINAR LOS MODELOS EXISTENTES EN LA LITERATURA DE MLO CON TECNICAS DE SIMULACION MULTIESCALA, DESARROLLADAS EN EL GRUPO. LA PRIMERA DE ESTAS TECNICAS ES UN METODO DE SIMULACION COARSE-GRAIN LAGRANGIANO, CONOCIDO COMO DISSIPATIVE PARTICLE DYNAMICS (DPD), EN EL QUE EL EQUIPO DE LA URV ESTA HACIENDO IMPORTANTES AVANCES, EN RELACION CON EL DESARROLLO DE UN ALGORITMO SOBREAMORTIGUADO Y DE TRANSFERENCIA DE CALOR. EL SEGUNDO, USA EL LLAMADO SINGLE CHAIN MEAN FIELD THEORY (SCMF) EN EL QUE UNA CADENA INTERACTUA CON LOS CAMPOS MOLECULARES MEDIOS, OBTENIDOS DE MODO AUTOCONSISTENTE. AUNQUE INICIALMENTE SE DESARROLLO PARA CALCULOS DE EQUILIBRIO, EL GRUPO HA DESARROLLADO UNA VERSION DINAMICA DEL MISMO. SE ESPERA QUE ESTAS TECNICAS PERMITAN EL ESTUDIO DE LA CONDENSACION Y DISOLUCION DE LOS MLO, SU DINAMICA Y SU ESTABILIDAD, LAS PROPIEDADES INTERFACIALES Y DE TRANSPORTE, Y SU INTERACCION CON LOS COFS Y LOS LCPS. SE DESARROLLARA UN MODELO COARSE-GRAIN PARA LA INTERACCION DE COFS Y LCPS QUE PRESERVE LOS PRINCIPALES ASPECTOS CUANDO INTERACCIONAN CON LOS MLOS, PARA SER USADOS PARA MODELIZAR SU COMPORTAMIENTO. IMULACION MESOSCOPICA\DISSIPATIVE PARTICLE DYNAMICS\SEPARACION DE FASES LIQUIDO-LIQUIDO\LIBERACION DE FARMACOS\AUTO ENSAMBLAJE

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