Descripción del proyecto
ESTE SUBPROYECTO ESTA DIRIGIDO AL ESTUDIO DE LOS EVENTOS QUE OCURREN EN LAS ETAPAS INICIALES DE LA PARATUBERCULOSIS (PTB) A NIVEL INTESTINAL (PRINCIPALMENTE EN LAS PLACAS DE PEYER) DONDE TIENE LUGAR LA INTERACCION PATOGENO (MYCOBACTERIUM AVIUM SUBSP. PARATUBERCULOSIS-MAP)-HOSPEDADOR Y TAMBIEN A LA IDENTIFICACION DE LAS MODIFICACIONES INDUCIDAS POR LA VACUNACION CON ESPECIAL ENFASIS EN LOS MECANISMOS DE INMUNIDAD ENTRENADA Y LA DEMOSTRACION DE SU EXISTENCIA MEDIANTE EL ESTUDIO DE LA REPROGRAMACION EPIGENETICA. ESTE SUBPROYECTO, QUE SE DESARROLLARA EN NEIKER ESTARA CENTRADO EN LA ESPECIE BOVINA. EN EL PRIMER EXPERIMENTO, SE VACUNARAN TERNERAS CON SILIRUM® (VACUNA INACTIVADA) EN CONDICIONES DE CAMPO, Y SE LLEVARAN A CABO ENSAYOS FUNCIONALES PARA INVESTIGAR Y CARACTERIZAR LOS MECANISMOS DE INMUNIDAD ENTRENADA EN MONOCITOS Y NEUTROFILOS DE SANGRE PERIFERICA. ADEMAS, SE ANALIZARA LA METILACION DE HISTONAS EN PROMOTORES DE GENES MEDIANTE CHIP SEQ EN NEUTROFILOS Y MONOCITOS DE AMBAS ESPECIES (LOS DOS SUBPROYECTOS) PARA IDENTIFICAR CUALES ESTAN ASOCIADOS A LA VACUNACION. MUESTRAS GENERADAS EN ESTE ENSAYO DE CAMPO EN BOVINO, TAMBIEN SERAN ANALIZADAS EN EL SUBPROYECTO 1 PARA DESCUBRIR EL PAPEL DE LAS REGIONES CORTAS NO CODIFICANTES DE RNA (LNCRNA) EN LA REPROGRAMACION EPIGENETICA. EN EL SEGUNDO EXPERIMENTO, UN MODELO QUIRURGICO DE AISLAMIENTO DE ASA INTESTINAL SE LLEVARA A CABO EN TERNEROS VACUNADOS Y NO VACUNADOS. EN CADA ANIMAL, SE INFECTARAN DIFERENTES SEGMENTOS INTESTINALES INCLUYENDO LAS ZONAS DE PLACA DE PEYER CON UNA CEPA BOVINA, OVINA O PBS COMO CONTROL NO INFECTADO. A LAS 8 H, 24 H (29 DIAS POST-VACUNACION -DPV-), 3 Y 28 DIAS POST-INFECCION (56 DPV) SE ANALIZARAN MUESTRAS DE INTESTINO MEDIANTE CULTIVOS PARA DETERMINAR LA CAPACIDAD DE ELIMINACION DE LA BACTERIA ASOCIADO A LA VACUNACION EN LAS MUESTRAS GENERADAS EN AMBOS SUBPROYECTOS (BOVINAS Y OVINAS). LA CARACTERIZACION DE NEUTROFILOS Y MACROFAGOS DE LOS ANIMALES DE ESTE EXPERIMENTO SE HARA MEDIANTE TECNICAS HISTOLOGICAS E INMUNOHISTOQUIMICAS COMO TAREA DEL SUBPROYECTO 1. LOS RESULTADOS DE LOS ANALISIS DE LOS DOS SUBPROYECTOS SE INTEGRARAN PARA EVALUAR LAS MODIFICACIONES ASOCIADAS A LA VACUNACION Y A LA INFECCION CON LAS DIFERENTES CEPAS DE MAP. ADEMAS, SE LLEVARA A CABO CHIP SEQ EN MACROFAGOS AISLADOS DEL INTESTINO A LOS 28 DIAS POST-INFECCION (56 DPV) Y EN MONOCITOS DE SANGRE PERIFERICA EN EL MISMO MOMENTO EN MUESTRAS DE LAS DOS ESPECIES ANIMALES, Y ASI CONFIRMAR QUE LOS MACROFAGOS ENTRENADOS SON RESULTADOS HASTA EL SITIO DE INFECCION. LA REPROGRAMACION EPIGENETICA MEDIADA POR LOS LNCRNAS DE LAS MUESTRAS BOVINAS SE ANALIZARA MEDIANTE METODOS DE HIBRIDACION IN SITU EN EL SUBPROYECTO 1 USANDO SONDAS FRENTE A LOS GENES DETECTADOS EN EL EXPERIMENTO 1. POR ULTIMO, ESTUDIOS TRANSCRIPTOMICOS EN MUESTRAS DE INTESTINO INCLUYENDO LAS PLACAS DE PEYER SE REALIZARAN MEDIANTE RNA SEQ PARA DETERMINAR QUE GENES ESTAN EXPRESADOS DIFERENCIALMENTE EN RELACION A LA VACUNACION O INFECCION POR MAP E IDENTIFICAR POSIBLES RUTAS DE SEÑALIZACION ALTERADAS O MARCADORES POTENCIALES DE INFECCION. ICOBACTERIAS\MACROFAGOS\NEUTROFILOS\REPROGRAMACION EPIGENETICA\INMUNIDAD INNATA\INMUNIDAD ENTRENADA\VACUNACION\PARATUBERCULOSIS